More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2592 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2592  two component transcriptional regulator, Fis family  100 
 
 		 128 aa  256  6e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2411  response regulator receiver protein  69.03 
 
 		 138 aa  160  6e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133639  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3714  response regulator receiver domain-containing protein  48.7 
 
 		 131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2257  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2719  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 142 aa  123  9e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0869  response regulator receiver protein  52.94 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.588002  normal  0.840358 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2551  response regulator receiver protein  47.79 
 
 		 322 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0870  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 117 aa  114  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.226165  normal  0.635424 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0575  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3713  response regulator receiver domain-containing protein  33.86 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.29 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1245  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  33.61 
 
 		 472 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390474  normal  0.0307837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1220  response regulator receiver protein  39.05 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7173  two component AraC family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 268 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.74 
 
 		 234 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 271 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  35.54 
 
 		 1361 aa  67  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 		 1362 aa  67  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 452 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1850  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.549411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1745  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  31.93 
 
 		 468 aa  65.5  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6875  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 		 858 aa  65.5  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 452 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.1 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  35.25 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  35.96 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6350  two component AraC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 271 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal  0.900493 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6528  two component AraC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 271 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485144  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6762  two component AraC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 271 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  38.82 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 204 aa  63.5  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1038  sensory box histidine kinase/response regulator  43.21 
 
 		 513 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.847548  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.82 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.94 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.484645  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0140  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 371 aa  62.8  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.46 
 
 		 326 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0123  two component transcriptional regulator  34.38 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0013  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.71 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.992585 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2054  response regulator receiver protein  37.21 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880044 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 316 aa  62  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2238  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  hitchhiker  0.00000354209 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2692  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.97 
 
 		 229 aa  62  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 		 977 aa  61.6  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 509 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3504  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2213  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 461 aa  61.6  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2452  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.83 
 
 		 377 aa  62  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101758 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2360  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 523 aa  61.6  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2397  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.07 
 
 		 434 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.593336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1055  two component signal transduction response regulator  32.73 
 
 		 734 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148851  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1570  transcriptional regulator, XRE family  29.23 
 
 		 233 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0978  response regulator receiver protein  37.65 
 
 		 280 aa  61.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000299391  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0979  response regulator receiver protein  40 
 
 		 336 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0988  response regulator BaeR  33.33 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000405458  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  38.46 
 
 		 326 aa  61.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4451  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.61 
 
 		 314 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  38.82 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2377  response regulator receiver protein  30.25 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1797  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.67 
 
 		 461 aa  60.8  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.774224  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  43.02 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 		 1358 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0653  two-component response regulator PhoB  38.02 
 
 		 230 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131558  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 1609 aa  60.5  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4465  adenylate/guanylate cyclase  34.62 
 
 		 561 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3355  two component Fis family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 122 aa  60.1  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 128 aa  60.1  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2177  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 120 aa  60.1  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3719  sensor histidine kinase  35.64 
 
 		 1278 aa  60.1  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0283  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.34 
 
 		 456 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3138  C4-dicarboxylate transport transcriptional regulatory protein  31.97 
 
 		 459 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  29.17 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  31.62 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4152  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0573  response regulator receiver protein  34.11 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.087024  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0804  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.61 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.504991 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1385  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  32.77 
 
 		 460 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0268  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.34 
 
 		 456 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540037 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2229  response regulator receiver domain-containing protein  41.28 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737175  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.51 
 
 		 1857 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 1942 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1097  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.89 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151318 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  35.4 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2226  response regulator receiver protein  34.11 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.561592  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13760  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.65 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 		 823 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 		 1977 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1201  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0883705  hitchhiker  0.00883957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>