More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2718 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2718  response regulator receiver protein  100 
 
 		 133 aa  266  7e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2551  response regulator receiver protein  56.03 
 
 		 322 aa  147  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3713  response regulator receiver domain-containing protein  60.17 
 
 		 153 aa  147  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  38.66 
 
 		 242 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.32 
 
 		 977 aa  84  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 242 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  37.82 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01981  two-component response regulator  36.97 
 
 		 242 aa  81.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.125891  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3578  response regulator receiver protein  30.4 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.677729  normal  0.0425656 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 245 aa  74.7  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  37.82 
 
 		 242 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 		 970 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2358  two component transcriptional regulator  34.75 
 
 		 231 aa  74.3  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136772  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2901  response regulator receiver protein  30.4 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191122  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  33.87 
 
 		 1156 aa  73.6  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  29.6 
 
 		 132 aa  73.6  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  29.6 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0734  response regulator receiver protein  36.15 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3021  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.381292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  45.24 
 
 		 1651 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27181  two-component response regulator  37.61 
 
 		 233 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  30.25 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.83 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  36.13 
 
 		 242 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  27.42 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.05 
 
 		 1631 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  31.93 
 
 		 125 aa  70.1  0.000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  31.93 
 
 		 125 aa  70.1  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2238  response regulator receiver protein  40.32 
 
 		 140 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  hitchhiker  0.00000354209 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3190  twitching motility, CheY-like protein  30.65 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5172  response regulator receiver protein  46.91 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  normal  0.0583946 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  30.08 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2264  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  37.19 
 
 		 525 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2257  response regulator receiver protein  35.23 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.05 
 
 		 917 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 		 796 aa  68.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3003  two component Fis family transcriptional regulator  50.62 
 
 		 465 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697126  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  36.13 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  26.4 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  26.4 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0176  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.17 
 
 		 378 aa  68.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0241  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  39.53 
 
 		 919 aa  68.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3816  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2960  response regulator receiver  34.68 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0852903  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4431  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  29.84 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2326  response regulator receiver domain-containing protein  33.86 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0575  response regulator receiver protein  34.09 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0118  response regulator receiver domain-containing protein  35.48 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0893  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.605635  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1017  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88924  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  29.41 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  29.41 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  33.87 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  34.45 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  32.2 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0436  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 370 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3778  response regulator receiver domain-containing protein  38.1 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  32.52 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3558  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.43 
 
 		 984 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299477 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  36.04 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  29.17 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  29.17 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  25.6 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  34.17 
 
 		 234 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0870  response regulator receiver protein  32.54 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.226165  normal  0.635424 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3844  response regulator receiver domain-containing protein  42.68 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  34.17 
 
 		 234 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1632  response regulator receiver  33.86 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  30.25 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3088  response regulator receiver protein  32.54 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.224006 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3907  response regulator receiver protein  42.68 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0483  response regulator receiver domain-containing protein  33.07 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 248 aa  67.4  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  33.06 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  33.9 
 
 		 121 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.8 
 
 		 770 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3680  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.5 
 
 		 223 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2430  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.5 
 
 		 223 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  32.77 
 
 		 121 aa  66.6  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  35.14 
 
 		 403 aa  67  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  31.2 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>