More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2233 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2233  response regulator receiver protein  100 
 
 		 131 aa  260  4.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250128  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0398  response regulator receiver protein  60.68 
 
 		 127 aa  144  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.79 
 
 		 231 aa  99.4  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 230 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  40.98 
 
 		 391 aa  91.3  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1485  response regulator receiver  41.51 
 
 		 235 aa  89.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.236897  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  43.93 
 
 		 232 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 245 aa  89  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 245 aa  88.2  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  41.35 
 
 		 272 aa  87.8  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 229 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4952  response regulator receiver protein  37.86 
 
 		 317 aa  87.4  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 236 aa  87  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 242 aa  86.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  40.34 
 
 		 242 aa  86.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.67 
 
 		 310 aa  86.3  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1255  response regulator receiver protein  43.14 
 
 		 124 aa  85.9  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.135587  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 231 aa  85.5  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1356  response regulator receiver protein  43.14 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0440939  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1095  response regulator receiver domain-containing protein  38.18 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117755  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2593  response regulator receiver domain-containing protein  43.14 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 234 aa  85.1  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  40.34 
 
 		 242 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 		 235 aa  85.5  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1924  two component transcriptional regulator  39.17 
 
 		 230 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.399122 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4011  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 236 aa  84  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0268606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  39.45 
 
 		 234 aa  83.6  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 229 aa  84  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  40.57 
 
 		 239 aa  83.6  9e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  40.57 
 
 		 239 aa  83.6  9e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  40.57 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  40.57 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  40.57 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  40.57 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  40.57 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  40.57 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  40.57 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  46.08 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  40.57 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  40.57 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  33.06 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2238  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  hitchhiker  0.00000354209 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2599  phosphate regulon transcriptional regulator, PhoR  38.33 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1134  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.461969  hitchhiker  0.00297359 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2257  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.09 
 
 		 509 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0520127 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.34 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  43.48 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1561  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.28 
 
 		 455 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000734361  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.14 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  40.57 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1257  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.621627  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1220  response regulator  35.83 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.327631  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.03 
 
 		 236 aa  81.6  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5611  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.97 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.736991 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  37.84 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  39.62 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1792  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.4 
 
 		 249 aa  81.3  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.783202  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1941  response regulator receiver domain-containing protein  40.35 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01756  Response regulator CheB (receptor modification enzyme, protein-glutamate methylesterase)  39.64 
 
 		 337 aa  81.3  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.844049  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1155  response regulator receiver protein  39.42 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3557  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.59 
 
 		 322 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.457648  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1223  response regulator receiver protein  39.42 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  37.61 
 
 		 1888 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2175  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.55 
 
 		 395 aa  80.9  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924768  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 226 aa  80.9  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.57 
 
 		 232 aa  80.9  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  39.37 
 
 		 403 aa  80.9  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0171  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1556  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.84 
 
 		 300 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  38.83 
 
 		 230 aa  80.9  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0843  response regulator receiver protein  40.19 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.774989  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1805  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.422276 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.58 
 
 		 242 aa  80.5  0.000000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 233 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1930  two component transcriptional regulator  39.09 
 
 		 233 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.465475  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 224 aa  80.1  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 		 2539 aa  80.1  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3790  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.82 
 
 		 300 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.58 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2857  sensory box/response regulator  33.87 
 
 		 754 aa  79.7  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.917485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  36.79 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2955  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3625  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.77 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  39.6 
 
 		 2336 aa  80.1  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 1651 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0821  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.60557  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3577  two component transcriptional regulator  38.14 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  35.85 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.32 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3288  two component transcriptional regulator  44.12 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 1609 aa  78.6  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2397  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.15 
 
 		 434 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.593336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>