More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0221 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0221  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 118 aa  236  8e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0626  response regulator receiver protein  53.57 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0991172 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1201  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 135 aa  90.1  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0883705  hitchhiker  0.00883957 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2257  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2719  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3714  response regulator receiver domain-containing protein  31.62 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2551  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0844  response regulator receiver protein  40.26 
 
 		 77 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000136417  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0870  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 117 aa  73.6  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.226165  normal  0.635424 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  31.4 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0869  response regulator receiver protein  29.06 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.588002  normal  0.840358 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  30.58 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  32.2 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  29.75 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  31.36 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0575  response regulator receiver protein  28.21 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  29.75 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3907  response regulator receiver protein  34.23 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3844  response regulator receiver domain-containing protein  34.23 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3985  response regulator receiver protein  34.23 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3713  response regulator receiver domain-containing protein  41.86 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  29.27 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40 
 
 		 900 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269875  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 204 aa  60.8  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0824  response regulator receiver protein  30.25 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.494027  normal  0.693271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  33.98 
 
 		 1200 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3956  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.314568 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  30.23 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  30.23 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2230  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 		 707 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2526  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40 
 
 		 715 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.263284  normal  0.0502692 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  35.79 
 
 		 922 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3009  response regulator receiver protein  32.95 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  35.42 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  30.23 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 		 991 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  28.1 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3108  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 122 aa  57  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6062  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  26.72 
 
 		 123 aa  57  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 		 1168 aa  57  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.37 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0776  response regulator receiver domain-containing protein  33.62 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0195762  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 		 1651 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  39.51 
 
 		 768 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5086  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  26.27 
 
 		 465 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  36.14 
 
 		 998 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2238  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  hitchhiker  0.00000354209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  25.62 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.36 
 
 		 1195 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0828  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000089442  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  34.74 
 
 		 934 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  25.62 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22620  response regulator receiver protein  26.04 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4168  response regulator receiver protein  35.63 
 
 		 622 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1850  response regulator receiver protein  30.63 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.549411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  32.56 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  30.17 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4908  response regulator receiver protein  36.71 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100675  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2995  response regulator receiver domain-containing protein  36.97 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  25.86 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.02 
 
 		 823 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0824  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0263767  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  34.74 
 
 		 888 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3376  CheA signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 911 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163998  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  25.86 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0497  response regulator receiver protein  34.18 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.41839  hitchhiker  0.0000227207 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2975  response regulator receiver protein  33.71 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000459905 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  36.14 
 
 		 232 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 		 1003 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  24.79 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3195  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2718  response regulator receiver protein  35.37 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  28.07 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0046  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2592  two component transcriptional regulator, Fis family  28.45 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0681  response regulator receiver protein  28.69 
 
 		 639 aa  53.5  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.657626  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 934 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3094  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1364  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 485 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 		 397 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1817  CheA signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 937 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1547  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 520 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 1832 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1872  CheA signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 937 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134352  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.41 
 
 		 454 aa  53.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4386  response regulator receiver protein  27.18 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.74 
 
 		 385 aa  52.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 970 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>