33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0844 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0844  response regulator receiver protein  100 
 
 		 77 aa  157  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000136417  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0221  response regulator receiver domain-containing protein  40.26 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1201  response regulator receiver protein  35.21 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0883705  hitchhiker  0.00883957 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.75 
 
 		 823 aa  47.8  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1472  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2708  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 204 aa  43.5  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.18523  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0171  response regulator receiver protein  42.22 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 		 1954 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 		 944 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1805  response regulator receiver protein  42.22 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.422276 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  45 
 
 		 870 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2946  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 272 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  41.86 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3340  response regulator receiver  36.36 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.269643 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0681  response regulator receiver protein  35.06 
 
 		 639 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.657626  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2477  response regulator receiver protein  43.18 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.586597  normal  0.458637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 		 975 aa  41.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0912  response regulator receiver protein  32.89 
 
 		 118 aa  41.6  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.616011 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1737  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.5 
 
 		 1037 aa  41.2  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476029  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0693  response regulator receiver protein  35.06 
 
 		 639 aa  40.8  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000123693 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0626  response regulator receiver protein  36.23 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0991172 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  36.36 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.11 
 
 		 664 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  36.36 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1497  response regulator PleD  38.1 
 
 		 454 aa  40.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6466  response regulator receiver protein  27.5 
 
 		 159 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0540776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1363  response regulator receiver protein  27.5 
 
 		 159 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.79644  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4227  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.482069  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.86 
 
 		 1177 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 697 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.64 
 
 		 1942 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>