More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1363 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1363  response regulator receiver protein  100 
 
 
159 aa  310  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.79644  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6466  response regulator receiver protein  100 
 
 
159 aa  310  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0540776  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6058  response regulator receiver protein  97.48 
 
 
159 aa  279  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.68971  normal  0.260625 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6378  response regulator receiver protein  80.89 
 
 
158 aa  246  9e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545178  normal  0.378734 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5630  response regulator receiver protein  80.89 
 
 
158 aa  244  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.045392  normal  0.0327485 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5463  response regulator receiver protein  80 
 
 
182 aa  236  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383205 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1362  CheY-like domain-containing protein  70.5 
 
 
149 aa  201  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.517477  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3142  response regulator  70.5 
 
 
149 aa  201  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3013  response regulator receiver  70.5 
 
 
149 aa  201  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.174134  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5291  response regulator receiver protein  65.93 
 
 
152 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1316  response regulator receiver domain-containing protein  65.93 
 
 
152 aa  174  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.320962  normal  0.0622647 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5338  response regulator receiver protein  64.71 
 
 
147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.890396  normal  0.026694 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.04 
 
 
776 aa  92  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  43.36 
 
 
547 aa  90.5  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0027  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.4 
 
 
917 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.26 
 
 
1185 aa  89  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2241  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.4 
 
 
657 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2942  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  47.86 
 
 
702 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897088  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.82 
 
 
1406 aa  88.6  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 
866 aa  86.3  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 
776 aa  84.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0372  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  44.07 
 
 
1233 aa  84.3  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.51 
 
 
657 aa  84.3  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435635  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
835 aa  84  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 
1279 aa  84  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.13 
 
 
664 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  46.15 
 
 
1242 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  39.47 
 
 
1152 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.95 
 
 
1088 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1658  histidine kinase  46.73 
 
 
518 aa  82.8  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0072  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 
568 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516402 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.38 
 
 
1287 aa  82.8  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3992  response regulator receiver protein  41.6 
 
 
157 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16183  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  36.64 
 
 
1222 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.7 
 
 
623 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.850341 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  39.62 
 
 
1344 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  36.8 
 
 
1303 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2013  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 
569 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00655857 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.51 
 
 
529 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3028  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.08 
 
 
702 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.337956  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 
930 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3134  histidine kinase  45.54 
 
 
702 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.22778  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
938 aa  79  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.51 
 
 
526 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6593  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 
906 aa  78.2  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1597  histidine kinase  43.24 
 
 
537 aa  78.2  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0756537 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5434  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
539 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489177  normal  0.0484799 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6439  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.51 
 
 
776 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249109  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  38.68 
 
 
1218 aa  77  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.12 
 
 
659 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.47344  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.9 
 
 
764 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.736998  normal  0.0891785 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3728  response regulator receiver protein  34.45 
 
 
128 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2490  histidine kinase  37.07 
 
 
554 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0717  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 
641 aa  73.9  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4054  histidine kinase  44.92 
 
 
551 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0320  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 
175 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 
1223 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  36.11 
 
 
1384 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2751  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 
151 aa  73.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301483  normal  0.376747 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 
1084 aa  73.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2210  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44.86 
 
 
633 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00664902  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0497  response regulator receiver protein  35.92 
 
 
124 aa  73.6  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.41839  hitchhiker  0.0000227207 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3278  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.54 
 
 
2468 aa  73.2  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0267066 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 
1261 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6406  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.74 
 
 
528 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0853653  normal  0.114934 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
869 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0570546 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  31.03 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5081  PAS  38.1 
 
 
659 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.803763  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0671  two component LuxR family transcriptional regulator  34.46 
 
 
333 aa  71.6  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0205263  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0241  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  39.05 
 
 
582 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5975  histidine kinase  42.05 
 
 
524 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.005421  normal  0.414836 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2484  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.12 
 
 
761 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55775  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 
530 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1671  histidine kinase  39.25 
 
 
755 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408129  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1003  response regulator receiver protein  35.29 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.12 
 
 
761 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170014  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 
1331 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  31.03 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  31.03 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.74 
 
 
528 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568926  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  32.46 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.28 
 
 
1361 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1664  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.73 
 
 
633 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0956689  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  40.38 
 
 
1535 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5679  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 
845 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304618  normal  0.613324 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0509  two component transcriptional regulator  36.04 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163629  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  28.69 
 
 
123 aa  70.1  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0627  response regulator receiver protein  35.16 
 
 
163 aa  70.5  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00307044 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1555  response regulator receiver protein  35.65 
 
 
121 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  31.03 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  33.04 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1492  histidine kinase  40.38 
 
 
519 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.416072 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
121 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 
440 aa  69.3  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1737  histidine kinase  45.79 
 
 
633 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.181813  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3251  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 
418 aa  68.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35487  normal  0.0265543 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 
639 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5630  histidine kinase  38.83 
 
 
714 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.11737 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5085  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.65 
 
 
530 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.55 
 
 
522 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>