More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4386 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4386  response regulator receiver protein  100 
 
 		 133 aa  274  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0728  response regulator receiver protein  75.94 
 
 		 190 aa  215  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2154  response regulator receiver  30.56 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0828561  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2116  two component transcriptional regulator  30.56 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.291778  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5315  response regulator receiver protein  26.61 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.813269  normal  0.296683 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2390  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.73 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2339  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.73 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  30.51 
 
 		 230 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0108  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26471  two-component response regulator  30.33 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0101  response regulator receiver domain-containing protein  31.86 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.720265  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  25.98 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0119  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  25.98 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 235 aa  57.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4908  response regulator receiver protein  27.13 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100675  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1597  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  29.91 
 
 		 981 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000711164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  29.2 
 
 		 1020 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 397 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2378  two component transcriptional regulator  29.51 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1737  response regulator receiver domain-containing protein  29.09 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.570794  normal  0.630295 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3345  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 483 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0504  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.1 
 
 		 427 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4308  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.38 
 
 		 552 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2281  response regulator receiver protein  26.05 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.217898  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0314  two component transcriptional regulator  29.37 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.645458  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0893  winged helix family two component transcriptional regulator  29.06 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1893  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01561  two-component response regulator  28.69 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.22181  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0227  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  28.33 
 
 		 236 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  29.06 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.77 
 
 		 441 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.130175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1942  response regulator receiver protein  26.79 
 
 		 280 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0511  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  29.06 
 
 		 234 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0781  two component transcriptional regulator  29.06 
 
 		 233 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.174075 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3221  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.57 
 
 		 443 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0497788 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0098  two component transcriptional regulator  31.07 
 
 		 229 aa  54.3  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0130  two component transcriptional regulator  28.69 
 
 		 260 aa  53.9  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.907894  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  27.13 
 
 		 402 aa  54.3  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01451  two-component response regulator  28.69 
 
 		 260 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1352  response regulator receiver protein  29.81 
 
 		 410 aa  53.9  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2657  response regulator receiver protein  28.1 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0140925  normal  0.150861 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01471  two-component response regulator  28.69 
 
 		 260 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.37604  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2281  two component transcriptional regulator  28.93 
 
 		 229 aa  53.9  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.331932  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2998  response regulator receiver protein  29.81 
 
 		 377 aa  53.9  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3924  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  26.67 
 
 		 443 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  27.97 
 
 		 971 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0614  response regulator receiver protein  26.92 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1494  two component transcriptional regulator  28.69 
 
 		 265 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.213712  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 		 452 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  26.89 
 
 		 969 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4918  two component transcriptional regulator  29.06 
 
 		 234 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0866  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 496 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555974  normal  0.133337 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02001  two-component response regulator  28.69 
 
 		 265 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.824437 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3359  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 395 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1803  two component transcriptional regulator  31.43 
 
 		 232 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782093  normal  0.890279 
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  26.5 
 
 		 460 aa  52.8  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2638  response regulator receiver protein  30.25 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.818298  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4400  two component transcriptional regulator  23.58 
 
 		 236 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0202  two component transcriptional regulator  28.81 
 
 		 233 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1464  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 579 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1777  metal dependent phosphohydrolase, HD region with response regulator receiver modulation  28.33 
 
 		 414 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.21 
 
 		 237 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  26.56 
 
 		 233 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2540  two component transcriptional regulator  26.4 
 
 		 228 aa  52  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3508  response regulator receiver  29.13 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2743  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 395 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  28.23 
 
 		 229 aa  52.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1151  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.36 
 
 		 243 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3105  DNA-binding response regulator PhoB  27.83 
 
 		 232 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2202  histidine kinase  34.51 
 
 		 613 aa  51.6  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.143763  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2021  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.67 
 
 		 237 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.198844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2231  two component transcriptional regulator  29.17 
 
 		 234 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1105  two component transcriptional regulator  27.64 
 
 		 229 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  28.21 
 
 		 391 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1434  DNA-binding response regulator PhoB  26.36 
 
 		 243 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1713  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  26.67 
 
 		 237 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0484795  normal  0.810471 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1503  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 513 aa  51.6  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4408  two component transcriptional regulator  26.21 
 
 		 229 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0897949 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 217 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01421  two-component response regulator  29.51 
 
 		 258 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.4 
 
 		 237 aa  51.2  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1597  two component transcriptional regulator  28.7 
 
 		 237 aa  51.2  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.6 
 
 		 452 aa  51.2  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  26.5 
 
 		 247 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  25.6 
 
 		 236 aa  51.2  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0840  response regulator receiver protein  29.31 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.45 
 
 		 246 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.45 
 
 		 246 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5477  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  27.18 
 
 		 229 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  27.18 
 
 		 229 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1220  response regulator receiver protein  25.93 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0485  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  29.06 
 
 		 227 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2180  two component transcriptional regulator  25.83 
 
 		 235 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0753297 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0509  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 232 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  26.92 
 
 		 313 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0154  two component transcriptional regulator  27.18 
 
 		 229 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5367  two component transcriptional regulator  27.18 
 
 		 229 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400776 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5606  two component transcriptional regulator  27.18 
 
 		 229 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5228  two component transcriptional regulator  27.18 
 
 		 229 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.661336  normal  0.450139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>