More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3787 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3787  response regulator receiver protein  100 
 
 		 125 aa  243  6.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3825  response regulator receiver protein  48.41 
 
 		 127 aa  84.3  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44747  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3884  response regulator receiver protein  36 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.110956  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0337  response regulator receiver protein  40.8 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081011  hitchhiker  0.000378914 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3821  response regulator receiver protein  37.01 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305029  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2328  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1900  response regulator  35.71 
 
 		 148 aa  70.1  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176755  normal  0.0491434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1791  response regulator receiver protein  33.94 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4841  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  32 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2513  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2317  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4337  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  hitchhiker  0.000570677 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  39.77 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  39.77 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1220  CheY-like response regulator  38.02 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0243191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3361  response regulator receiver protein  37.86 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937091  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 1431 aa  62  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5055  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000148317  normal  0.0527856 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  31.01 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4440  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1538  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2652  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 242 aa  61.2  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 1131 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0841  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.93 
 
 		 715 aa  60.5  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.101081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2082  two-component response regulator, cheY-like  37.27 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.988257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  30.47 
 
 		 137 aa  60.1  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3183  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2397  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.15 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.593336  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3567  response regulator receiver protein  34.92 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  32.81 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  29.27 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2257  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30 
 
 		 509 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0520127 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.15 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.484645  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5086  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.78 
 
 		 465 aa  59.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  32.41 
 
 		 1378 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3740  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0227  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  29.75 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.19 
 
 		 317 aa  58.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1372  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.786279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  33.6 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  36.99 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1464  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000820366  normal  0.014977 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4240  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 		 1064 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 383 aa  58.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  28.69 
 
 		 1306 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3744  response regulator receiver protein  34.55 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.139387  hitchhiker  0.00363561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  42.22 
 
 		 299 aa  57  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3767  response regulator receiver protein  31.2 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  30.23 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 120 aa  57  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 		 935 aa  57  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4408  two component transcriptional regulator  30.4 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0897949 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5179  response regulator receiver protein  34.07 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  32.23 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  30.4 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0984  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.75 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.194443 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4400  two component transcriptional regulator  31.15 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2751  response regulator receiver domain-containing protein  32 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301483  normal  0.376747 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.03 
 
 		 337 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0326  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.986154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1257  two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.536699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0148  response regulator, CheY-like  29.17 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3545  response regulator for Gln (sensor glnL) (nitrogen regulator I, NRI)  32.79 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000295304  normal  0.0892706 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2570  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 381 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5729  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.69 
 
 		 975 aa  55.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0821  two component transcriptional regulator  27.2 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.60557  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  32.8 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2232  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  40.26 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.326614  normal  0.43086 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  28.91 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 238 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  33.78 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0098  two component transcriptional regulator  28.8 
 
 		 229 aa  54.3  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2188  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 384 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00677544 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3583  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  32.03 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  28.12 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0104  response regulator, putative  30.33 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4725  response regulator receiver protein  28.1 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2162  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  34.62 
 
 		 235 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.33 
 
 		 1301 aa  53.9  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1556  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.93 
 
 		 300 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2294  two component transcriptional regulator  33.7 
 
 		 228 aa  53.9  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0043  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  33.78 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5320  winged helix family two component transcriptional regulator  28.8 
 
 		 242 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5367  two component transcriptional regulator  28.8 
 
 		 229 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>