More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3260 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  54.33 
 
 		 616 aa  672    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 602 aa  1242    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  55.17 
 
 		 602 aa  679    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  31.41 
 
 		 615 aa  260  4e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  31.39 
 
 		 617 aa  238  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  29.84 
 
 		 605 aa  209  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1796  Rhs element Vgr protein  28.2 
 
 		 619 aa  191  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3220  Rhs element Vgr protein  26.39 
 
 		 618 aa  180  7e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4109  Rhs element Vgr protein  29.9 
 
 		 576 aa  169  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0273732 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3589  Rhs element Vgr protein  24.68 
 
 		 612 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.512863 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4864  Rhs element Vgr protein  24.95 
 
 		 599 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0846936  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  38.42 
 
 		 218 aa  120  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  24.65 
 
 		 589 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  30.05 
 
 		 248 aa  103  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  23.33 
 
 		 661 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  24.2 
 
 		 641 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  23.12 
 
 		 661 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  23.12 
 
 		 661 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  23.12 
 
 		 661 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  23.12 
 
 		 661 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  23.03 
 
 		 661 aa  101  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  22.93 
 
 		 661 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  22.93 
 
 		 661 aa  101  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  32.99 
 
 		 593 aa  100  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  22.9 
 
 		 703 aa  97.8  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  24.88 
 
 		 578 aa  95.9  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  32.79 
 
 		 587 aa  95.5  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  31.4 
 
 		 239 aa  94.7  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  24.48 
 
 		 596 aa  90.9  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  28.03 
 
 		 602 aa  90.9  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  25.09 
 
 		 697 aa  90.1  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  28.37 
 
 		 247 aa  90.1  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  22.06 
 
 		 641 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  31.44 
 
 		 592 aa  88.2  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  26.1 
 
 		 668 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  32.58 
 
 		 606 aa  87.4  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  29.02 
 
 		 610 aa  87.4  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  26.39 
 
 		 595 aa  86.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  24.95 
 
 		 669 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  23.81 
 
 		 668 aa  84.7  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2094  Rhs element Vgr protein  24.65 
 
 		 646 aa  84.3  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.730907  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2555  hypothetical protein  28.49 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216389 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  22.88 
 
 		 594 aa  82  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  23.25 
 
 		 668 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  38.14 
 
 		 599 aa  81.6  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  27.67 
 
 		 589 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  31.78 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  28.3 
 
 		 598 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  22.52 
 
 		 689 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  32.97 
 
 		 604 aa  79  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0531  type VI secretion system Vgr family protein  29.76 
 
 		 1003 aa  78.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  21.88 
 
 		 589 aa  79  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  23.08 
 
 		 574 aa  77.8  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3429  Rhs element Vgr protein  23.15 
 
 		 782 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3558  type VI secretion system Vgr family protein  23.15 
 
 		 782 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  30.37 
 
 		 226 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3043  Rhs element Vgr protein  30.3 
 
 		 229 aa  75.1  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160638 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  22.12 
 
 		 730 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  29.27 
 
 		 565 aa  74.3  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  23.62 
 
 		 619 aa  74.7  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  23.73 
 
 		 683 aa  74.3  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  22.99 
 
 		 771 aa  74.3  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  22.53 
 
 		 613 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  22.2 
 
 		 581 aa  73.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1138  hypothetical protein  27.42 
 
 		 270 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  30.96 
 
 		 576 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  23.34 
 
 		 683 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  22.77 
 
 		 642 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1486  type VI secretion system Vgr family protein  21.2 
 
 		 922 aa  72.8  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  22 
 
 		 618 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1934  hypothetical protein  21.2 
 
 		 874 aa  72.8  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.652792  normal  0.85907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1374  Rhs element Vgr protein  21.2 
 
 		 916 aa  72.8  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  38.83 
 
 		 928 aa  72  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  23.36 
 
 		 618 aa  72  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  38.83 
 
 		 979 aa  71.6  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  23.72 
 
 		 729 aa  71.2  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04713  Rhs element Vgr protein  38.83 
 
 		 564 aa  71.2  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0536  type VI secretion system Vgr family protein  27.38 
 
 		 792 aa  71.2  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00256  Rhs-family protein  21.96 
 
 		 645 aa  70.9  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  23.71 
 
 		 729 aa  70.5  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  33.98 
 
 		 1094 aa  69.3  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  20.28 
 
 		 771 aa  68.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1080  hypothetical protein  31.17 
 
 		 599 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.752206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0394  Rhs element Vgr protein  33.98 
 
 		 811 aa  68.6  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  22.24 
 
 		 851 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  28.34 
 
 		 596 aa  68.6  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  21.27 
 
 		 767 aa  68.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  23.12 
 
 		 709 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  22.83 
 
 		 596 aa  67.4  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1035  Rhs element Vgr protein  22.05 
 
 		 762 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508183  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0446  Rhs element Vgr protein  22.05 
 
 		 762 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.232565  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2009  Rhs element Vgr protein  22.05 
 
 		 762 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2082  Rhs element Vgr protein  22.05 
 
 		 762 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0709  Rhs element Vgr protein  22.05 
 
 		 762 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.730029  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  21.83 
 
 		 714 aa  67  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1894  Rhs element Vgr protein  21.62 
 
 		 763 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0740  Rhs element Vgr protein  22.05 
 
 		 762 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  24.65 
 
 		 743 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2959  hypothetical protein  23.22 
 
 		 644 aa  66.2  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027443 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2945  Rhs element Vgr protein  28.9 
 
 		 589 aa  65.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>