More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1658 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1658  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 315 aa  631  1e-180  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01175  cytochrome c oxidase assembly factor (CtaA) + protoheme IXfarnesyltransferase (CtaB)  64.56 
 
 		 297 aa  386  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3468  protoheme IX farnesyltransferase  42.66 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2204  polyprenyltransferase (cytochrome oxidase assembly factor)  40.41 
 
 		 300 aa  205  7e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000348808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0521  protoheme IX farnesyltransferase  41.16 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.043939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5673  protoheme IX farnesyltransferase  42.7 
 
 		 292 aa  202  8e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0297  protoheme IX farnesyltransferase  38.61 
 
 		 300 aa  192  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116054 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2955  protoheme IX farnesyltransferase  35.26 
 
 		 326 aa  170  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2218  protoheme IX farnesyltransferase  34.67 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.446862  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  36.59 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  34.45 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  34.43 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  35.14 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  36.2 
 
 		 312 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  33.9 
 
 		 318 aa  149  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  34.72 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  34.72 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  35.25 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  35.25 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1787  protoheme IX farnesyltransferase  36.36 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.50189  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  36.55 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  35.96 
 
 		 296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  35.25 
 
 		 353 aa  146  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  35.25 
 
 		 312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  39.57 
 
 		 302 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  32.4 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  31 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0503  protoheme IX farnesyltransferase  31.94 
 
 		 298 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  32.12 
 
 		 302 aa  143  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  36.01 
 
 		 301 aa  142  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  35.82 
 
 		 313 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  33.9 
 
 		 300 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  31.85 
 
 		 302 aa  142  8e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  32.87 
 
 		 295 aa  142  9e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  33.8 
 
 		 303 aa  142  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3173  protoheme IX farnesyltransferase  34.25 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0955942  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  33.9 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0150  protoheme IX farnesyltransferase  36.27 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  33.45 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  33.56 
 
 		 300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  33.56 
 
 		 300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  33.56 
 
 		 300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  35.98 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  32.47 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  37.24 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  33.9 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  37.24 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  32.47 
 
 		 313 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0130  protoheme IX farnesyltransferase  36.24 
 
 		 297 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.914448 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  34.5 
 
 		 304 aa  139  7.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  32.99 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  35.97 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  31 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  32.64 
 
 		 301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  37.21 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  32.05 
 
 		 535 aa  136  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  36.47 
 
 		 312 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1933  protoheme IX farnesyltransferase  35.95 
 
 		 342 aa  136  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  38.43 
 
 		 311 aa  136  5e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  31.94 
 
 		 310 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 		 296 aa  135  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0110  protoheme IX farnesyltransferase  36.92 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  33.74 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0125  protoheme IX farnesyltransferase  36.2 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350123  normal  0.0256302 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00940  protoheme IX farnesyltransferase  35.62 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110139  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  38.17 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0170  protoheme IX farnesyltransferase  36.33 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  37.72 
 
 		 301 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  37.72 
 
 		 301 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2075  protoheme IX farnesyltransferase  32.09 
 
 		 295 aa  134  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126082  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  34.98 
 
 		 295 aa  133  3e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1294  protoheme IX farnesyltransferase  36.47 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  34.24 
 
 		 328 aa  133  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  36.29 
 
 		 306 aa  134  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0127  protoheme IX farnesyltransferase  36.56 
 
 		 297 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  37.72 
 
 		 301 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  32.99 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  32.99 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0191  protoheme IX farnesyltransferase  32.53 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0918  protoheme IX farnesyltransferase  34.34 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  37.34 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4120  protoheme IX farnesyltransferase  37.72 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  32.99 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  33.22 
 
 		 315 aa  133  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0466  protoheme IX farnesyltransferase  32.88 
 
 		 300 aa  132  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.622131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  32.14 
 
 		 326 aa  132  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  32.27 
 
 		 297 aa  132  6e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  37.76 
 
 		 300 aa  132  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  32.64 
 
 		 300 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  32.42 
 
 		 534 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  33.85 
 
 		 624 aa  132  7.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  34.39 
 
 		 301 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1689  protoheme IX farnesyltransferase  34.11 
 
 		 298 aa  132  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.575941  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0887  protoheme IX farnesyltransferase  35.83 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  32.64 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  32.64 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  32.64 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  36.8 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  35.27 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>