More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_3099 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_3099  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
513 aa  1065    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000841335 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4604  AMP-dependent synthetase and ligase  36.69 
 
 
492 aa  287  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1034  AMP-dependent synthetase and ligase  37.24 
 
 
495 aa  284  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1599  AMP-dependent synthetase and ligase  37.1 
 
 
484 aa  282  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1029  AMP-dependent synthetase and ligase  37.58 
 
 
499 aa  281  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3247  AMP-dependent synthetase and ligase  38.53 
 
 
497 aa  281  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.640388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1600  AMP-dependent synthetase and ligase  35.17 
 
 
496 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0614  AMP-dependent synthetase and ligase  32.19 
 
 
502 aa  275  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 
507 aa  263  6e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1112  putative acyl-CoA ligase  36.32 
 
 
504 aa  262  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.29648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4026  AMP-dependent synthetase and ligase  32.8 
 
 
487 aa  260  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.863411  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0213  AMP-dependent synthetase and ligase  33.87 
 
 
491 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0419  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
492 aa  260  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0725647  normal  0.0451868 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0223  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
491 aa  260  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.803967  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0233  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
491 aa  260  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318189  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  34.38 
 
 
498 aa  258  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0252  AMP-dependent synthetase and ligase  33.62 
 
 
484 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.122402 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.04 
 
 
543 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  30.19 
 
 
487 aa  214  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.98 
 
 
501 aa  213  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.68 
 
 
524 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  32.32 
 
 
492 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  30.82 
 
 
508 aa  211  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.1 
 
 
509 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  30.19 
 
 
492 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4161  acyl-CoA synthetase  34.2 
 
 
517 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  29.01 
 
 
515 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  29.01 
 
 
515 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  32.28 
 
 
510 aa  202  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  29.45 
 
 
532 aa  201  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.14 
 
 
514 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.83 
 
 
506 aa  200  7e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  28.34 
 
 
515 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0218  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.99 
 
 
516 aa  196  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0925378 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.83 
 
 
506 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.83 
 
 
506 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230763  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0449  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.91 
 
 
516 aa  195  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.56 
 
 
500 aa  193  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  29.96 
 
 
546 aa  193  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  30.57 
 
 
514 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  29.57 
 
 
511 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  28.75 
 
 
512 aa  190  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.62 
 
 
509 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  30.08 
 
 
511 aa  189  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2787  AMP-dependent synthetase and ligase  29.4 
 
 
518 aa  187  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296837  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.12 
 
 
516 aa  186  8e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  29.48 
 
 
502 aa  186  9e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.74 
 
 
509 aa  186  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0912  AMP-dependent synthetase and ligase  29.88 
 
 
515 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.881726 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.19 
 
 
497 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  30.49 
 
 
551 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.19 
 
 
497 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.32 
 
 
513 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  29.22 
 
 
523 aa  184  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  27.27 
 
 
508 aa  183  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1095  AMP-dependent synthetase and ligase  30.09 
 
 
518 aa  183  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  29.41 
 
 
499 aa  182  9.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.33 
 
 
516 aa  182  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1681  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.08 
 
 
514 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.43 
 
 
513 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1902  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.87 
 
 
518 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889055  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2397  AMP-dependent synthetase and ligase  32.29 
 
 
516 aa  182  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.94 
 
 
512 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  28.96 
 
 
511 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1481  AMP-dependent synthetase and ligase  34.77 
 
 
525 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  31.9 
 
 
516 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0661  AMP-binding enzyme family protein  32.37 
 
 
520 aa  180  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.52 
 
 
499 aa  180  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5032  acyl-CoA synthetase  37.01 
 
 
501 aa  181  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  32.1 
 
 
516 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  32.17 
 
 
520 aa  179  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.76 
 
 
512 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100628  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  28.96 
 
 
508 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  36.65 
 
 
501 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0848  AMP-dependent synthetase and ligase  28.78 
 
 
517 aa  179  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  28.48 
 
 
525 aa  179  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0098  AMP-dependent synthetase and ligase  28.31 
 
 
522 aa  179  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.690806  normal  0.913632 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0361  acyl-CoA synthetase  29.35 
 
 
577 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  36.65 
 
 
501 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0371  acyl-CoA synthetase  29.35 
 
 
577 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  32.09 
 
 
516 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0104  AMP-dependent synthetase and ligase  34.2 
 
 
524 aa  178  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  29.37 
 
 
560 aa  178  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10216  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.05 
 
 
537 aa  177  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3605  acyl-CoA synthetase  31.61 
 
 
514 aa  177  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133038  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0350  acyl-CoA synthetase  29.16 
 
 
574 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0209  AMP-dependent synthetase and ligase  28.16 
 
 
526 aa  177  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  28.33 
 
 
519 aa  177  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3089  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.37 
 
 
522 aa  176  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196285  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1124  AMP-dependent synthetase and ligase  30.47 
 
 
509 aa  176  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719867  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  32.49 
 
 
516 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  28.93 
 
 
509 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0115  AMP-dependent synthetase and ligase  27.47 
 
 
526 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3612  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.12 
 
 
514 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  28.82 
 
 
508 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  29.42 
 
 
519 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  31.85 
 
 
523 aa  174  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3161  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.77 
 
 
516 aa  173  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0121  AMP-dependent synthetase and ligase  33.05 
 
 
522 aa  174  5e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  29.05 
 
 
521 aa  174  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.446284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>