156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2192 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2192  agmatine deiminase  100 
 
 		 373 aa  775    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  50.28 
 
 		 368 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  50.27 
 
 		 368 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  49.73 
 
 		 368 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  50 
 
 		 368 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  49.03 
 
 		 368 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  51.39 
 
 		 368 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  49.45 
 
 		 368 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  49.03 
 
 		 368 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  49.18 
 
 		 368 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1202  agmatine deiminase  50.67 
 
 		 368 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  48.35 
 
 		 372 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  51.11 
 
 		 368 aa  378  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  48.64 
 
 		 369 aa  375  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2405  agmatine deiminase  50.41 
 
 		 365 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.761895  normal  0.0406266 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  48.91 
 
 		 366 aa  366  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1189  peptidyl-arginine deiminase  50 
 
 		 373 aa  361  1e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2154  peptidyl-arginine deiminase  47.25 
 
 		 371 aa  358  6e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1849  agmatine deiminase  48.6 
 
 		 369 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552976  decreased coverage  0.00228426 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  47.21 
 
 		 364 aa  349  6e-95  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  47.24 
 
 		 371 aa  346  3e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  43.98 
 
 		 370 aa  331  1e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  43.09 
 
 		 369 aa  322  9.000000000000001e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  46.01 
 
 		 374 aa  321  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  43.96 
 
 		 375 aa  317  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  44.26 
 
 		 367 aa  317  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  43.7 
 
 		 367 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  43.14 
 
 		 370 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  43.42 
 
 		 370 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  43.14 
 
 		 370 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  42.86 
 
 		 370 aa  309  5e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  43.14 
 
 		 370 aa  308  9e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  42.58 
 
 		 370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  42.3 
 
 		 370 aa  306  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  42.86 
 
 		 370 aa  305  6e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  42.02 
 
 		 370 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  42.02 
 
 		 370 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0678  agmatine deiminase  43.08 
 
 		 386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.421408 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  42.7 
 
 		 365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  42.7 
 
 		 371 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  42.7 
 
 		 371 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3810  agmatine deiminase  44.29 
 
 		 365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.387298  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  43.73 
 
 		 365 aa  302  7.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  38.29 
 
 		 355 aa  268  8.999999999999999e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  32.87 
 
 		 346 aa  226  3e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  31.58 
 
 		 347 aa  223  4e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36398  predicted protein  34.22 
 
 		 386 aa  222  9e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  34.07 
 
 		 346 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  33.33 
 
 		 346 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  32.41 
 
 		 350 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4219  Agmatine deiminase  32.78 
 
 		 340 aa  200  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  32.33 
 
 		 370 aa  193  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4626  agmatine deiminase  32.29 
 
 		 369 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  32.7 
 
 		 624 aa  192  8e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0059  Agmatine deiminase  32.69 
 
 		 375 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  31.96 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  30.31 
 
 		 334 aa  187  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  30.89 
 
 		 342 aa  186  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  31.4 
 
 		 348 aa  186  8e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  30.05 
 
 		 348 aa  185  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0172  Agmatine deiminase  32.77 
 
 		 374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  29.75 
 
 		 348 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  32.44 
 
 		 640 aa  182  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  31.4 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  29.95 
 
 		 639 aa  181  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2482  agmatine deiminase  30.56 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  30.43 
 
 		 350 aa  180  4e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  27.95 
 
 		 348 aa  179  4.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48490  putative peptidylarginine deiminase  31.56 
 
 		 346 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000276698  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  31.58 
 
 		 334 aa  179  9e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0681  Agmatine deiminase  31.3 
 
 		 348 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4756  peptidyl-arginine deiminase  30.66 
 
 		 345 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322594  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  30.52 
 
 		 347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  30.39 
 
 		 343 aa  172  5.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  30.43 
 
 		 352 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  29.62 
 
 		 349 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2561  Agmatine deiminase  29.51 
 
 		 377 aa  172  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  28.07 
 
 		 353 aa  169  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0759  peptidyl-arginine deiminase  31.27 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.451964  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6169  Agmatine deiminase  31.65 
 
 		 331 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  29.25 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4759  peptidyl-arginine deiminase  31.53 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675137  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  27.4 
 
 		 347 aa  167  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48450  putative peptidyl-arginine deiminase  29.1 
 
 		 372 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000979902  normal  0.148444 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  28.53 
 
 		 358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0369  peptidyl-arginine deiminase  28.81 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2072  Agmatine deiminase  31.94 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  30.06 
 
 		 351 aa  164  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  30.73 
 
 		 355 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  28.53 
 
 		 352 aa  162  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2373  twin-arginine translocation pathway signal  28.29 
 
 		 372 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0189025 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  28.61 
 
 		 386 aa  161  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1048  agmatine deiminase  29.36 
 
 		 368 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.649771  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  29.12 
 
 		 631 aa  161  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  27.11 
 
 		 365 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  26.83 
 
 		 347 aa  160  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  28.09 
 
 		 339 aa  161  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  29.47 
 
 		 356 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  31.11 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  30.47 
 
 		 343 aa  159  9e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>