158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0059 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0059  Agmatine deiminase  100 
 
 
375 aa  757    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0681  Agmatine deiminase  65.79 
 
 
348 aa  444  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0833  Agmatine deiminase  65.27 
 
 
339 aa  423  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0759  peptidyl-arginine deiminase  55.99 
 
 
336 aa  363  3e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.451964  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6169  Agmatine deiminase  52.66 
 
 
331 aa  337  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  44.8 
 
 
370 aa  271  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  39.61 
 
 
372 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  36.47 
 
 
347 aa  241  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  36.5 
 
 
346 aa  239  6.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  39.95 
 
 
370 aa  238  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  40 
 
 
346 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  39.45 
 
 
368 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  38.87 
 
 
346 aa  231  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  35.29 
 
 
364 aa  230  3e-59  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  37.78 
 
 
368 aa  226  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  39.07 
 
 
350 aa  225  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0172  Agmatine deiminase  40.18 
 
 
374 aa  224  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  39.72 
 
 
369 aa  222  8e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  37.05 
 
 
368 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  36.77 
 
 
368 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  35.65 
 
 
368 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  36.49 
 
 
368 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  38.9 
 
 
368 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  36.49 
 
 
368 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  35.36 
 
 
368 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  37.46 
 
 
369 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48490  putative peptidylarginine deiminase  39.52 
 
 
346 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000276698  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  35.34 
 
 
355 aa  212  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  35.91 
 
 
368 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4759  peptidyl-arginine deiminase  38.97 
 
 
370 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675137  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  35.94 
 
 
358 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2373  twin-arginine translocation pathway signal  36.59 
 
 
372 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0189025 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4756  peptidyl-arginine deiminase  37.09 
 
 
345 aa  206  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322594  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  37.39 
 
 
343 aa  206  4e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  34.18 
 
 
367 aa  203  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  33.9 
 
 
367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  36.49 
 
 
371 aa  199  7e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  36.26 
 
 
334 aa  199  7e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2072  Agmatine deiminase  36.39 
 
 
364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  34.46 
 
 
375 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  36.59 
 
 
374 aa  198  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1202  agmatine deiminase  32.11 
 
 
368 aa  196  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4626  agmatine deiminase  37.79 
 
 
369 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192221  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  34.06 
 
 
365 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  34.06 
 
 
371 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  34.06 
 
 
371 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  34.93 
 
 
365 aa  194  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  32.96 
 
 
366 aa  194  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2405  agmatine deiminase  32.11 
 
 
365 aa  194  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.761895  normal  0.0406266 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  34.9 
 
 
342 aa  192  9e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  34.18 
 
 
370 aa  192  9e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  34.18 
 
 
370 aa  192  9e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  34.18 
 
 
370 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48450  putative peptidyl-arginine deiminase  37.79 
 
 
372 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000979902  normal  0.148444 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  35.78 
 
 
348 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1048  agmatine deiminase  33.61 
 
 
368 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.649771  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  33.9 
 
 
370 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  33.9 
 
 
370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  34.18 
 
 
370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  33.9 
 
 
370 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1849  agmatine deiminase  33.43 
 
 
369 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552976  decreased coverage  0.00228426 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  33.9 
 
 
370 aa  189  7e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2561  Agmatine deiminase  35.96 
 
 
377 aa  188  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2192  agmatine deiminase  32.69 
 
 
373 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  33.62 
 
 
370 aa  188  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  33.62 
 
 
370 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3810  agmatine deiminase  34.93 
 
 
365 aa  187  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.387298  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  34.8 
 
 
640 aa  187  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  32.66 
 
 
639 aa  186  7e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  33.71 
 
 
347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  34.02 
 
 
624 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2482  agmatine deiminase  36.44 
 
 
375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  33.52 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1189  peptidyl-arginine deiminase  33.43 
 
 
373 aa  184  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2154  peptidyl-arginine deiminase  32.3 
 
 
371 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  31.03 
 
 
350 aa  181  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0678  agmatine deiminase  33.42 
 
 
386 aa  181  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.421408 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36398  predicted protein  36.91 
 
 
386 aa  182  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  34.68 
 
 
351 aa  181  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  29.45 
 
 
339 aa  179  9e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  30.84 
 
 
346 aa  178  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  30.48 
 
 
349 aa  172  7.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  31.73 
 
 
348 aa  172  9e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  31.96 
 
 
348 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  29.53 
 
 
352 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  34.6 
 
 
332 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  35.4 
 
 
327 aa  170  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  31.9 
 
 
349 aa  169  5e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  31.32 
 
 
348 aa  170  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  29.05 
 
 
347 aa  168  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  33.33 
 
 
344 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  30.12 
 
 
349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  33.43 
 
 
356 aa  167  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4219  Agmatine deiminase  34.18 
 
 
340 aa  166  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  33.24 
 
 
344 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2450  agmatine deiminase  31.81 
 
 
393 aa  163  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  29.02 
 
 
352 aa  161  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1755  agmatine deiminase  32.09 
 
 
348 aa  160  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.807714  normal  0.973962 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  31.38 
 
 
355 aa  159  6e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3505  hypothetical protein  30.09 
 
 
385 aa  159  9e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>