164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2373 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2373  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 372 aa  767    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0189025 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2482  agmatine deiminase  69.6 
 
 		 375 aa  527  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4626  agmatine deiminase  68.28 
 
 		 369 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48450  putative peptidyl-arginine deiminase  58.65 
 
 		 372 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000979902  normal  0.148444 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2561  Agmatine deiminase  56.42 
 
 		 377 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0172  Agmatine deiminase  52.82 
 
 		 374 aa  380  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4759  peptidyl-arginine deiminase  53.48 
 
 		 370 aa  342  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675137  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1048  agmatine deiminase  42.27 
 
 		 368 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.649771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2072  Agmatine deiminase  41.06 
 
 		 364 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  36.07 
 
 		 370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  37.06 
 
 		 346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  37.13 
 
 		 350 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6169  Agmatine deiminase  39.58 
 
 		 331 aa  219  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0681  Agmatine deiminase  37.39 
 
 		 348 aa  218  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  35.12 
 
 		 347 aa  213  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  34.82 
 
 		 346 aa  212  7.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  34.38 
 
 		 368 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0059  Agmatine deiminase  36.59 
 
 		 375 aa  206  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  33.52 
 
 		 372 aa  203  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48490  putative peptidylarginine deiminase  35.78 
 
 		 346 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000276698  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  32.6 
 
 		 358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0759  peptidyl-arginine deiminase  38.01 
 
 		 336 aa  197  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.451964  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  31.23 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  34.38 
 
 		 368 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4760  peptidyl-arginine deiminase  32.29 
 
 		 509 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  32.94 
 
 		 343 aa  192  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  35.04 
 
 		 624 aa  191  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  35.43 
 
 		 369 aa  192  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  33.33 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  33.05 
 
 		 368 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  32.1 
 
 		 368 aa  187  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  33.05 
 
 		 368 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1751  agmatine deiminase  33.04 
 
 		 385 aa  186  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  31.23 
 
 		 366 aa  186  7e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4756  peptidyl-arginine deiminase  32.74 
 
 		 345 aa  186  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322594  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  32.66 
 
 		 342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0833  Agmatine deiminase  35.57 
 
 		 339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3497  agmatine deiminase  33.04 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3505  hypothetical protein  31.76 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  33.05 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  32.76 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  32.29 
 
 		 368 aa  182  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  32.77 
 
 		 364 aa  182  1e-44  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  31.85 
 
 		 346 aa  182  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3209  agmatine deiminase  32.27 
 
 		 387 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  32.5 
 
 		 370 aa  179  8e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  32.19 
 
 		 368 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  34.1 
 
 		 347 aa  176  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  31.73 
 
 		 371 aa  174  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2450  agmatine deiminase  31.1 
 
 		 393 aa  173  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  31.32 
 
 		 347 aa  173  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  31.86 
 
 		 339 aa  172  5.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  30.09 
 
 		 348 aa  172  7.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0369  peptidyl-arginine deiminase  32.84 
 
 		 339 aa  166  5e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1202  agmatine deiminase  30.2 
 
 		 368 aa  166  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  30.46 
 
 		 369 aa  166  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  29.71 
 
 		 357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  31.61 
 
 		 349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  30.23 
 
 		 348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  30.66 
 
 		 367 aa  163  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  31.18 
 
 		 640 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2192  agmatine deiminase  28.29 
 
 		 373 aa  162  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  35.48 
 
 		 639 aa  162  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  32.09 
 
 		 374 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  31.55 
 
 		 631 aa  160  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  30.75 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  30.43 
 
 		 351 aa  160  4e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  29.8 
 
 		 367 aa  160  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  30.41 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  29.8 
 
 		 346 aa  157  4e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.12 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  29.71 
 
 		 371 aa  157  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  29.71 
 
 		 371 aa  157  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0678  agmatine deiminase  29.62 
 
 		 386 aa  156  6e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.421408 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  28.61 
 
 		 349 aa  156  6e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  29.71 
 
 		 365 aa  156  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  28.82 
 
 		 349 aa  155  8e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2405  agmatine deiminase  29.06 
 
 		 365 aa  155  9e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.761895  normal  0.0406266 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  29.78 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4697  agmatine deiminase  31.07 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.399563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  32.82 
 
 		 365 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36398  predicted protein  30.81 
 
 		 386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4219  Agmatine deiminase  31.85 
 
 		 340 aa  153  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  31.88 
 
 		 367 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  30.32 
 
 		 356 aa  152  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  29.43 
 
 		 355 aa  151  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  30.41 
 
 		 348 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  28.53 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1849  agmatine deiminase  29.26 
 
 		 369 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552976  decreased coverage  0.00228426 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  28.53 
 
 		 334 aa  150  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  30.68 
 
 		 351 aa  149  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  29.86 
 
 		 352 aa  149  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  32.41 
 
 		 344 aa  149  8e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1013  Agmatine deiminase  30.43 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  28.69 
 
 		 370 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0984  Agmatine deiminase  30.43 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  30.68 
 
 		 344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2154  peptidyl-arginine deiminase  28.69 
 
 		 371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  31.58 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  28.41 
 
 		 370 aa  147  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>