163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1861 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  100 
 
 		 367 aa  754    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  54.68 
 
 		 344 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  52.94 
 
 		 344 aa  360  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  51.46 
 
 		 356 aa  353  2e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  51.92 
 
 		 350 aa  345  6e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  47.97 
 
 		 351 aa  343  4e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  49.55 
 
 		 357 aa  338  5.9999999999999996e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2402  hypothetical protein  49.71 
 
 		 376 aa  333  2e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00162245  decreased coverage  0.000927611 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  48.97 
 
 		 342 aa  332  8e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  48.37 
 
 		 355 aa  330  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  46.18 
 
 		 341 aa  329  4e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  48.09 
 
 		 341 aa  329  6e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  48.52 
 
 		 342 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1601  hypothetical protein  47.55 
 
 		 363 aa  326  4.0000000000000003e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1544  agmatine deiminase  46.61 
 
 		 363 aa  323  2e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1642  Agmatine deiminase  49.27 
 
 		 345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  48.8 
 
 		 343 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  48.8 
 
 		 343 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  47.44 
 
 		 386 aa  310  2e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0144  hypothetical protein  46.61 
 
 		 341 aa  306  3e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  47.04 
 
 		 343 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0984  Agmatine deiminase  41.35 
 
 		 345 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1013  Agmatine deiminase  41.35 
 
 		 345 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  44.57 
 
 		 340 aa  299  6e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  47.41 
 
 		 365 aa  291  9e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00887  peptidyl-arginine deiminase  45.43 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0609278  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0378  peptidyl-arginine deiminase  39.23 
 
 		 331 aa  271  2e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.521894  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.51 
 
 		 322 aa  259  4e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0085  peptidyl-arginine deiminase family protein  41.49 
 
 		 348 aa  257  3e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.360574  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  42.18 
 
 		 342 aa  255  7e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  40.58 
 
 		 352 aa  251  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1172  peptidyl-arginine deiminase family protein  36.25 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1581  Agmatine deiminase  38.81 
 
 		 330 aa  247  2e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.715324  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  40.77 
 
 		 639 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1027  peptidyl-arginine deiminase family protein  35.95 
 
 		 325 aa  243  3e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0973  peptidyl-arginine deiminase family protein  35.65 
 
 		 325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0842  peptidyl-arginine deiminase family protein  37.76 
 
 		 322 aa  243  5e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00603168  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  41.35 
 
 		 349 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0897  peptidyl-arginine deiminase family protein  38.11 
 
 		 325 aa  239  5.999999999999999e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  40.71 
 
 		 348 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  40.59 
 
 		 350 aa  236  6e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3964  peptidyl-arginine deiminase  36.09 
 
 		 350 aa  236  6e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0531  peptidyl-arginine deiminase  37.13 
 
 		 323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.709217  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  35.52 
 
 		 339 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  38.71 
 
 		 349 aa  228  9e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  40.6 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  39.02 
 
 		 348 aa  227  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  38.96 
 
 		 347 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  39.23 
 
 		 631 aa  224  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00673  peptidyl-arginine deiminase  37.54 
 
 		 354 aa  223  4e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.027225  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  38.86 
 
 		 347 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  38.42 
 
 		 352 aa  221  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  35.82 
 
 		 351 aa  221  9.999999999999999e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  33.43 
 
 		 346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  37.72 
 
 		 640 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  37.5 
 
 		 334 aa  219  5e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  38.24 
 
 		 346 aa  219  6e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  35.69 
 
 		 347 aa  218  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  37.39 
 
 		 365 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  35.82 
 
 		 349 aa  212  9e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  37.61 
 
 		 624 aa  209  5e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1873  GGDEF  35.78 
 
 		 339 aa  205  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0147389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  38.17 
 
 		 348 aa  202  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  37.46 
 
 		 348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  33.82 
 
 		 343 aa  200  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  32.94 
 
 		 358 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  34.1 
 
 		 353 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3153  peptidyl-arginine deiminase  34.99 
 
 		 330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  33.14 
 
 		 349 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  36.89 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6353  Agmatine deiminase  35.64 
 
 		 383 aa  187  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  35.76 
 
 		 346 aa  186  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4697  agmatine deiminase  35.29 
 
 		 336 aa  185  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.399563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  30.59 
 
 		 369 aa  182  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  32.87 
 
 		 368 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3497  agmatine deiminase  33.04 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0369  peptidyl-arginine deiminase  34.33 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  32.87 
 
 		 368 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  32.87 
 
 		 368 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1751  agmatine deiminase  33.04 
 
 		 385 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  32.59 
 
 		 368 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3505  hypothetical protein  33.04 
 
 		 385 aa  176  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3209  agmatine deiminase  32.74 
 
 		 387 aa  176  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  29.78 
 
 		 364 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3490  agmatine deiminase  32.31 
 
 		 348 aa  173  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  30.91 
 
 		 370 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  32.17 
 
 		 372 aa  172  7.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2450  agmatine deiminase  33.14 
 
 		 393 aa  170  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  31.18 
 
 		 347 aa  170  5e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1755  agmatine deiminase  31.83 
 
 		 348 aa  169  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.807714  normal  0.973962 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  34.69 
 
 		 327 aa  169  9e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  31.39 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  31.11 
 
 		 368 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  32.02 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36398  predicted protein  33.68 
 
 		 386 aa  168  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  30.75 
 
 		 365 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  32.47 
 
 		 346 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  30.75 
 
 		 371 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  30.75 
 
 		 371 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2072  Agmatine deiminase  33.13 
 
 		 364 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>