161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1727 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  100 
 
 		 347 aa  717    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  70.86 
 
 		 348 aa  503  1e-141  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  68.12 
 
 		 349 aa  487  1e-136  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  67.06 
 
 		 352 aa  475  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  65.9 
 
 		 350 aa  467  9.999999999999999e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  64.64 
 
 		 346 aa  464  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  61.85 
 
 		 349 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  57.43 
 
 		 348 aa  394  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  55.03 
 
 		 339 aa  389  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  55.98 
 
 		 348 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  53.78 
 
 		 347 aa  378  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  49.85 
 
 		 347 aa  362  4e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  48.13 
 
 		 349 aa  345  5e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  49.57 
 
 		 342 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  49.56 
 
 		 334 aa  338  7e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  46.69 
 
 		 349 aa  334  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  47.77 
 
 		 365 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  46.69 
 
 		 353 aa  318  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  49.13 
 
 		 624 aa  316  5e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  47.23 
 
 		 639 aa  311  7.999999999999999e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  44.48 
 
 		 640 aa  299  5e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  43.87 
 
 		 352 aa  295  8e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  45.43 
 
 		 334 aa  292  7e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  44.19 
 
 		 631 aa  285  5.999999999999999e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  43.39 
 
 		 348 aa  281  1e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  42.44 
 
 		 343 aa  273  3e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  42.27 
 
 		 351 aa  270  2.9999999999999997e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  41.41 
 
 		 346 aa  266  5e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  39.32 
 
 		 350 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  37.93 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  40.23 
 
 		 355 aa  239  5e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  39.32 
 
 		 350 aa  239  5.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  39.02 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0144  hypothetical protein  40.52 
 
 		 341 aa  237  2e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  37.68 
 
 		 341 aa  237  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  39.72 
 
 		 356 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  40.11 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  36.51 
 
 		 369 aa  233  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  38.37 
 
 		 344 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  38.15 
 
 		 343 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  38.15 
 
 		 343 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  36.31 
 
 		 342 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  35.17 
 
 		 347 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  35.04 
 
 		 358 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  36.81 
 
 		 346 aa  229  5e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  34.88 
 
 		 346 aa  229  7e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  37.82 
 
 		 357 aa  229  7e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  35.89 
 
 		 370 aa  227  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  38.37 
 
 		 351 aa  227  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  34.7 
 
 		 364 aa  227  3e-58  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  34.25 
 
 		 367 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  35.76 
 
 		 340 aa  224  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  33.88 
 
 		 365 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  33.88 
 
 		 371 aa  225  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  33.88 
 
 		 371 aa  225  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  35.05 
 
 		 372 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  36.29 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  36.36 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  38.79 
 
 		 332 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  33.42 
 
 		 367 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  38.95 
 
 		 386 aa  219  7.999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  36.93 
 
 		 341 aa  218  8.999999999999998e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  36.04 
 
 		 371 aa  218  8.999999999999998e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0378  peptidyl-arginine deiminase  34.53 
 
 		 331 aa  217  2e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.521894  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  37.54 
 
 		 327 aa  215  8e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  34.51 
 
 		 368 aa  215  8e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  34.78 
 
 		 368 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  35.42 
 
 		 369 aa  213  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  34.51 
 
 		 368 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  33.7 
 
 		 368 aa  212  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  34.51 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  36.34 
 
 		 342 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  34.15 
 
 		 365 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3810  agmatine deiminase  34.15 
 
 		 365 aa  210  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.387298  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  33.7 
 
 		 368 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4756  peptidyl-arginine deiminase  34.29 
 
 		 345 aa  209  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322594  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  31.15 
 
 		 370 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1601  hypothetical protein  32.57 
 
 		 363 aa  206  5e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1544  agmatine deiminase  32.57 
 
 		 363 aa  205  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4759  peptidyl-arginine deiminase  37.86 
 
 		 370 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675137  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  34.51 
 
 		 368 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  31.69 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  34.33 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  31.69 
 
 		 370 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0842  peptidyl-arginine deiminase family protein  34.14 
 
 		 322 aa  203  3e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00603168  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0085  peptidyl-arginine deiminase family protein  36.12 
 
 		 348 aa  203  3e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.360574  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  35.25 
 
 		 374 aa  203  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  34.24 
 
 		 368 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0172  Agmatine deiminase  36.57 
 
 		 374 aa  202  6e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  30.6 
 
 		 370 aa  202  6e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  33.97 
 
 		 368 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6353  Agmatine deiminase  38.97 
 
 		 383 aa  201  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  30.87 
 
 		 370 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4219  Agmatine deiminase  36.21 
 
 		 340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  30.87 
 
 		 370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.13 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  33.89 
 
 		 355 aa  200  3e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  33.97 
 
 		 368 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48490  putative peptidylarginine deiminase  36.96 
 
 		 346 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000276698  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  31.42 
 
 		 370 aa  199  7e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>