153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4760 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4760  peptidyl-arginine deiminase  100 
 
 		 509 aa  1021    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0172  Agmatine deiminase  34.83 
 
 		 374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2373  twin-arginine translocation pathway signal  32.6 
 
 		 372 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0189025 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4759  peptidyl-arginine deiminase  36.36 
 
 		 370 aa  204  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675137  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4626  agmatine deiminase  34.01 
 
 		 369 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2482  agmatine deiminase  30.41 
 
 		 375 aa  193  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2561  Agmatine deiminase  34.02 
 
 		 377 aa  186  8e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48450  putative peptidyl-arginine deiminase  34.25 
 
 		 372 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000979902  normal  0.148444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2072  Agmatine deiminase  31.12 
 
 		 364 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  30.89 
 
 		 350 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  30.41 
 
 		 346 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  27.42 
 
 		 347 aa  147  6e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  27.19 
 
 		 346 aa  144  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  28.83 
 
 		 369 aa  144  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1048  agmatine deiminase  28.38 
 
 		 368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.649771  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48490  putative peptidylarginine deiminase  31.26 
 
 		 346 aa  140  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000276698  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0059  Agmatine deiminase  29.4 
 
 		 375 aa  138  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  29.7 
 
 		 370 aa  139  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  25.98 
 
 		 334 aa  137  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  29.35 
 
 		 370 aa  136  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0681  Agmatine deiminase  29.16 
 
 		 348 aa  133  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  28.25 
 
 		 368 aa  131  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0833  Agmatine deiminase  29.93 
 
 		 339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  25.58 
 
 		 339 aa  130  6e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4756  peptidyl-arginine deiminase  29.34 
 
 		 345 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322594  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  27.95 
 
 		 624 aa  130  8.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  28.76 
 
 		 372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6169  Agmatine deiminase  29.06 
 
 		 331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  26.2 
 
 		 350 aa  127  6e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  27.43 
 
 		 348 aa  127  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  27.52 
 
 		 342 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  27.25 
 
 		 369 aa  125  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  28.18 
 
 		 346 aa  125  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  27.23 
 
 		 371 aa  125  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  26.26 
 
 		 347 aa  124  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0759  peptidyl-arginine deiminase  29.72 
 
 		 336 aa  124  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.451964  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  25.22 
 
 		 640 aa  124  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  26.96 
 
 		 351 aa  123  6e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  25.57 
 
 		 364 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  27.21 
 
 		 368 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  27.65 
 
 		 370 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  27.81 
 
 		 370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  28.51 
 
 		 332 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  26.56 
 
 		 348 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2461  hypothetical protein  25.74 
 
 		 477 aa  121  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00038995  hitchhiker  0.00000000000217462 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0678  agmatine deiminase  26.04 
 
 		 386 aa  121  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.421408 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  27.54 
 
 		 358 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  26.93 
 
 		 368 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  25.92 
 
 		 366 aa  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  25.17 
 
 		 368 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  25.57 
 
 		 346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  26.97 
 
 		 375 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  26.3 
 
 		 639 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  27.15 
 
 		 370 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  27.59 
 
 		 370 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  26.87 
 
 		 370 aa  118  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  26.87 
 
 		 370 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  25.73 
 
 		 368 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  26.87 
 
 		 370 aa  117  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  25.76 
 
 		 348 aa  117  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  27.25 
 
 		 370 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  25.57 
 
 		 349 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  25.51 
 
 		 365 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4219  Agmatine deiminase  29.6 
 
 		 340 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  25.5 
 
 		 368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  27.31 
 
 		 374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  26.21 
 
 		 370 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  26.42 
 
 		 343 aa  113  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0369  peptidyl-arginine deiminase  30.15 
 
 		 339 aa  113  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  24.89 
 
 		 368 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  26.46 
 
 		 368 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  23.57 
 
 		 631 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  26.55 
 
 		 370 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  25.56 
 
 		 368 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  27.21 
 
 		 368 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2450  agmatine deiminase  26.75 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  24.43 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  25.11 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36398  predicted protein  26.94 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  25.4 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  23.74 
 
 		 349 aa  108  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1849  agmatine deiminase  24.55 
 
 		 369 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552976  decreased coverage  0.00228426 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1202  agmatine deiminase  23.36 
 
 		 368 aa  106  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  26.3 
 
 		 352 aa  106  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  24.83 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3810  agmatine deiminase  24.6 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.387298  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2405  agmatine deiminase  23.84 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.761895  normal  0.0406266 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3209  agmatine deiminase  25.9 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  23.45 
 
 		 347 aa  105  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  25.99 
 
 		 334 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6353  Agmatine deiminase  28.82 
 
 		 383 aa  104  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  27.58 
 
 		 356 aa  104  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  23.46 
 
 		 353 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  26.65 
 
 		 327 aa  103  8e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  24.89 
 
 		 348 aa  102  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4697  agmatine deiminase  26.94 
 
 		 336 aa  101  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.399563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1189  peptidyl-arginine deiminase  24.43 
 
 		 373 aa  100  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  25.11 
 
 		 355 aa  100  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2192  agmatine deiminase  23.2 
 
 		 373 aa  100  8e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1751  agmatine deiminase  24.62 
 
 		 385 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>