162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_48450 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_48450  putative peptidyl-arginine deiminase  100 
 
 		 372 aa  758    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000979902  normal  0.148444 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2373  twin-arginine translocation pathway signal  58.65 
 
 		 372 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0189025 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2561  Agmatine deiminase  65.42 
 
 		 377 aa  442  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2482  agmatine deiminase  56.06 
 
 		 375 aa  429  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4626  agmatine deiminase  61.26 
 
 		 369 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0172  Agmatine deiminase  54.13 
 
 		 374 aa  382  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4759  peptidyl-arginine deiminase  54.35 
 
 		 370 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675137  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1048  agmatine deiminase  41.07 
 
 		 368 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.649771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2072  Agmatine deiminase  40.29 
 
 		 364 aa  256  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  35.31 
 
 		 347 aa  229  7e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  35.31 
 
 		 346 aa  228  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  39.18 
 
 		 346 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  37.25 
 
 		 370 aa  220  3e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  35.49 
 
 		 368 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  35.49 
 
 		 368 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  36.04 
 
 		 346 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6169  Agmatine deiminase  39.58 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  35.88 
 
 		 350 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  35.21 
 
 		 368 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0759  peptidyl-arginine deiminase  37.32 
 
 		 336 aa  209  6e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.451964  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  36.07 
 
 		 372 aa  209  7e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  35.77 
 
 		 368 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  35.21 
 
 		 368 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  33.98 
 
 		 368 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  34.92 
 
 		 368 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  35.49 
 
 		 368 aa  202  8e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  35.33 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0059  Agmatine deiminase  37.79 
 
 		 375 aa  199  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  33.43 
 
 		 366 aa  199  6e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  33.24 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48490  putative peptidylarginine deiminase  36.55 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000276698  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4756  peptidyl-arginine deiminase  36.92 
 
 		 345 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322594  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  35.09 
 
 		 343 aa  192  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  33.99 
 
 		 371 aa  192  8e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  33.98 
 
 		 368 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  34.55 
 
 		 370 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0833  Agmatine deiminase  37.35 
 
 		 339 aa  189  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  35.47 
 
 		 369 aa  189  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0681  Agmatine deiminase  35.94 
 
 		 348 aa  189  9e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  34.3 
 
 		 342 aa  186  7e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  31.87 
 
 		 369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  32.86 
 
 		 355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  32.6 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  32.6 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  32.6 
 
 		 365 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  32.84 
 
 		 334 aa  184  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  34.88 
 
 		 624 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  32.54 
 
 		 341 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4760  peptidyl-arginine deiminase  33.56 
 
 		 509 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  32.46 
 
 		 358 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  31.66 
 
 		 339 aa  179  9e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  31.94 
 
 		 348 aa  178  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  37.38 
 
 		 365 aa  175  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2192  agmatine deiminase  29.86 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  34.39 
 
 		 357 aa  170  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  31.56 
 
 		 375 aa  170  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  34.81 
 
 		 341 aa  169  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  30.39 
 
 		 367 aa  169  8e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  32.39 
 
 		 364 aa  168  1e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0678  agmatine deiminase  30.77 
 
 		 386 aa  169  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.421408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  30.23 
 
 		 370 aa  168  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  33.43 
 
 		 640 aa  167  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  33.24 
 
 		 374 aa  168  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  30.23 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  30.39 
 
 		 370 aa  166  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  30.96 
 
 		 367 aa  166  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  29.94 
 
 		 370 aa  166  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  30.66 
 
 		 370 aa  166  5e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  33.05 
 
 		 347 aa  166  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0085  peptidyl-arginine deiminase family protein  33.94 
 
 		 348 aa  166  5.9999999999999996e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.360574  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.58 
 
 		 322 aa  166  5.9999999999999996e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1849  agmatine deiminase  32.05 
 
 		 369 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552976  decreased coverage  0.00228426 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  31.23 
 
 		 349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  29.61 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2154  peptidyl-arginine deiminase  31.18 
 
 		 371 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  32.06 
 
 		 347 aa  164  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  29.32 
 
 		 370 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  28.81 
 
 		 370 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  31.2 
 
 		 370 aa  163  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  33.43 
 
 		 344 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  31.73 
 
 		 639 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  28.77 
 
 		 370 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  32.09 
 
 		 348 aa  161  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  32.26 
 
 		 351 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1751  agmatine deiminase  28.32 
 
 		 385 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  33.24 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3505  hypothetical protein  28.28 
 
 		 385 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1189  peptidyl-arginine deiminase  31.65 
 
 		 373 aa  159  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  32.49 
 
 		 365 aa  159  6e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  32.07 
 
 		 355 aa  159  6e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4219  Agmatine deiminase  33.72 
 
 		 340 aa  159  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  33.14 
 
 		 356 aa  159  8e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  32.95 
 
 		 344 aa  159  8e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3209  agmatine deiminase  27.62 
 
 		 387 aa  159  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  30.35 
 
 		 346 aa  159  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  31.47 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  31.29 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3497  agmatine deiminase  27.46 
 
 		 385 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2450  agmatine deiminase  28.45 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  34.01 
 
 		 386 aa  155  7e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>