162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3209 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3505  hypothetical protein  93.02 
 
 
385 aa  744    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2450  agmatine deiminase  77.61 
 
 
393 aa  635    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1751  agmatine deiminase  92.25 
 
 
385 aa  741    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3497  agmatine deiminase  91.47 
 
 
385 aa  736    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3209  agmatine deiminase  100 
 
 
387 aa  791    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1755  agmatine deiminase  44.48 
 
 
348 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.807714  normal  0.973962 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3490  agmatine deiminase  45.06 
 
 
348 aa  269  5e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3203  agmatine deiminase  43.6 
 
 
348 aa  265  7e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.659757  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  36.47 
 
 
639 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  37.65 
 
 
339 aa  209  5e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  33.83 
 
 
334 aa  209  5e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  34.5 
 
 
347 aa  207  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  36.07 
 
 
348 aa  207  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  33.04 
 
 
352 aa  205  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  35.48 
 
 
348 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  35.1 
 
 
356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0172  Agmatine deiminase  33.8 
 
 
374 aa  200  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  35.45 
 
 
350 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  33.14 
 
 
640 aa  199  6e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  34.2 
 
 
349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  34.76 
 
 
348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  33.14 
 
 
349 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  33.04 
 
 
343 aa  191  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  34.39 
 
 
365 aa  192  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1013  Agmatine deiminase  34.68 
 
 
345 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0984  Agmatine deiminase  34.68 
 
 
345 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  33.43 
 
 
343 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  33.43 
 
 
343 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  31.78 
 
 
342 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  36.57 
 
 
352 aa  189  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  31.13 
 
 
370 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  32.85 
 
 
348 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  35.36 
 
 
344 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  34.96 
 
 
624 aa  187  4e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  34.71 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  31.18 
 
 
349 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  33.53 
 
 
346 aa  183  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4626  agmatine deiminase  30.9 
 
 
369 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192221  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  31.43 
 
 
358 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2373  twin-arginine translocation pathway signal  32.27 
 
 
372 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0189025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2072  Agmatine deiminase  35.96 
 
 
364 aa  179  8e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  34.36 
 
 
365 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4759  peptidyl-arginine deiminase  31.62 
 
 
370 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675137  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1048  agmatine deiminase  32.76 
 
 
368 aa  178  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.649771  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  35.1 
 
 
351 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  32.94 
 
 
334 aa  177  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  31.7 
 
 
346 aa  176  5e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2482  agmatine deiminase  28.76 
 
 
375 aa  176  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  30.99 
 
 
353 aa  176  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  32.74 
 
 
367 aa  176  7e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  34.76 
 
 
347 aa  176  8e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  33.63 
 
 
342 aa  175  9e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  31.67 
 
 
347 aa  175  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  32.48 
 
 
386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  31.08 
 
 
369 aa  172  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  30.64 
 
 
371 aa  172  7.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  32.94 
 
 
342 aa  172  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  32.42 
 
 
355 aa  171  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  29.69 
 
 
355 aa  172  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  31.36 
 
 
351 aa  171  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  32.23 
 
 
631 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  31.73 
 
 
350 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2402  hypothetical protein  31.28 
 
 
376 aa  171  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00162245  decreased coverage  0.000927611 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  29.49 
 
 
366 aa  170  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  30.49 
 
 
368 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  32.74 
 
 
343 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  31.96 
 
 
349 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  31.44 
 
 
374 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  31.29 
 
 
357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  29.22 
 
 
368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_002950  PG0144  hypothetical protein  34.23 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  33.24 
 
 
350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  32.28 
 
 
332 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  29.22 
 
 
368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  30.9 
 
 
346 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  29.79 
 
 
341 aa  164  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  32.16 
 
 
340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  28.61 
 
 
368 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0681  Agmatine deiminase  31.55 
 
 
348 aa  162  9e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  29.28 
 
 
368 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  30.08 
 
 
370 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  28.69 
 
 
368 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48490  putative peptidylarginine deiminase  33.91 
 
 
346 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000276698  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  29.33 
 
 
370 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  29.64 
 
 
370 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  29.51 
 
 
368 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  29.36 
 
 
370 aa  160  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  32.47 
 
 
341 aa  160  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  29.56 
 
 
370 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  29.92 
 
 
375 aa  159  8e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1189  peptidyl-arginine deiminase  29.92 
 
 
373 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2561  Agmatine deiminase  29.45 
 
 
377 aa  157  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  28.73 
 
 
370 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  29.25 
 
 
370 aa  157  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  30.64 
 
 
365 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  29.25 
 
 
370 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  30.64 
 
 
371 aa  157  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  30.64 
 
 
371 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  29.95 
 
 
368 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48450  putative peptidyl-arginine deiminase  27.62 
 
 
372 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000979902  normal  0.148444 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>