161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1254 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  100 
 
 		 386 aa  780    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  58.87 
 
 		 365 aa  380  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  55.43 
 
 		 344 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  53.08 
 
 		 356 aa  360  2e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  52.33 
 
 		 355 aa  353  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  49.85 
 
 		 351 aa  346  3e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  49.85 
 
 		 350 aa  342  5e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  49.27 
 
 		 341 aa  340  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  50.44 
 
 		 344 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  48.81 
 
 		 343 aa  333  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  48.81 
 
 		 343 aa  333  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1601  hypothetical protein  49.85 
 
 		 363 aa  333  4e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1544  agmatine deiminase  49.85 
 
 		 363 aa  332  8e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  47.44 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1642  Agmatine deiminase  49.71 
 
 		 345 aa  326  5e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  49.85 
 
 		 342 aa  323  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  47.06 
 
 		 357 aa  317  2e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  47.51 
 
 		 342 aa  315  9e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  48.68 
 
 		 343 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  47.81 
 
 		 341 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  45.45 
 
 		 340 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2402  hypothetical protein  46.63 
 
 		 376 aa  309  5e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00162245  decreased coverage  0.000927611 
 
 
-
 
NC_002950  PG0144  hypothetical protein  46.36 
 
 		 341 aa  305  7e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1013  Agmatine deiminase  41.76 
 
 		 345 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00887  peptidyl-arginine deiminase  49.39 
 
 		 328 aa  296  5e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0609278  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0984  Agmatine deiminase  41.76 
 
 		 345 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1172  peptidyl-arginine deiminase family protein  38.39 
 
 		 325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0378  peptidyl-arginine deiminase  38.71 
 
 		 331 aa  280  5e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.521894  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0085  peptidyl-arginine deiminase family protein  41.49 
 
 		 348 aa  276  4e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.360574  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.1 
 
 		 322 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1027  peptidyl-arginine deiminase family protein  38.39 
 
 		 325 aa  273  3e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0842  peptidyl-arginine deiminase family protein  40.12 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00603168  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0973  peptidyl-arginine deiminase family protein  37.8 
 
 		 325 aa  271  2e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0897  peptidyl-arginine deiminase family protein  41.34 
 
 		 325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0531  peptidyl-arginine deiminase  40.18 
 
 		 323 aa  259  7e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.709217  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1581  Agmatine deiminase  36.61 
 
 		 330 aa  245  6.999999999999999e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.715324  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  41.28 
 
 		 350 aa  245  9e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  39.07 
 
 		 334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  40.17 
 
 		 639 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  42.82 
 
 		 334 aa  243  5e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  40.69 
 
 		 352 aa  241  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  40.39 
 
 		 640 aa  241  1e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  35.31 
 
 		 339 aa  240  2e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  40.11 
 
 		 348 aa  239  4e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  40.12 
 
 		 348 aa  239  8e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  37.68 
 
 		 349 aa  235  8e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  40.12 
 
 		 351 aa  233  3e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  41.16 
 
 		 347 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  37.9 
 
 		 349 aa  230  3e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  41.6 
 
 		 342 aa  229  4e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  41.18 
 
 		 348 aa  229  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  38.37 
 
 		 347 aa  229  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  36.05 
 
 		 346 aa  228  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  37.97 
 
 		 349 aa  227  3e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  38.62 
 
 		 343 aa  227  3e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  41.18 
 
 		 348 aa  223  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  35.16 
 
 		 347 aa  222  7e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  37.4 
 
 		 372 aa  222  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  36.09 
 
 		 352 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  37.87 
 
 		 365 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  37.61 
 
 		 358 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  39.71 
 
 		 346 aa  216  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  35.59 
 
 		 631 aa  215  9e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  34.93 
 
 		 353 aa  215  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00673  peptidyl-arginine deiminase  34.75 
 
 		 354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.027225  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  35.38 
 
 		 368 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  35.94 
 
 		 346 aa  211  1e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  34.85 
 
 		 367 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  37.04 
 
 		 624 aa  209  8e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  35.21 
 
 		 367 aa  208  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3964  peptidyl-arginine deiminase  33.61 
 
 		 350 aa  207  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  34.07 
 
 		 368 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  34.58 
 
 		 368 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  32.87 
 
 		 370 aa  206  7e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  33.43 
 
 		 370 aa  205  9e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  33.43 
 
 		 370 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  34.41 
 
 		 349 aa  205  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  33.43 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  32.87 
 
 		 370 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  32.59 
 
 		 370 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  32.31 
 
 		 370 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  32.59 
 
 		 370 aa  202  7e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1873  GGDEF  35.26 
 
 		 339 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0147389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  34.35 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  34.07 
 
 		 368 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  31.75 
 
 		 370 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  33.43 
 
 		 370 aa  199  6e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  34.07 
 
 		 368 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  31.84 
 
 		 364 aa  197  3e-49  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  37.99 
 
 		 374 aa  196  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  31.84 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  31.66 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  34.85 
 
 		 368 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  31.56 
 
 		 365 aa  192  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  31.56 
 
 		 371 aa  192  6e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  31.56 
 
 		 371 aa  192  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  34.44 
 
 		 368 aa  192  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  34.43 
 
 		 369 aa  192  8e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3153  peptidyl-arginine deiminase  37.28 
 
 		 330 aa  189  7e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  34.64 
 
 		 370 aa  189  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>