159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2447 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  100 
 
 		 357 aa  732    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  54.12 
 
 		 341 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  53.69 
 
 		 343 aa  376  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  53.69 
 
 		 343 aa  376  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  54.55 
 
 		 344 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  52.65 
 
 		 342 aa  360  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2402  hypothetical protein  51.16 
 
 		 376 aa  355  8.999999999999999e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00162245  decreased coverage  0.000927611 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  52.65 
 
 		 351 aa  354  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  51.61 
 
 		 356 aa  352  5e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  49.85 
 
 		 367 aa  350  2e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  50.72 
 
 		 350 aa  350  3e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  50.58 
 
 		 340 aa  347  3e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  50.14 
 
 		 343 aa  346  4e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  49.28 
 
 		 342 aa  346  4e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  52.06 
 
 		 344 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0984  Agmatine deiminase  49.42 
 
 		 345 aa  343  4e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1013  Agmatine deiminase  49.42 
 
 		 345 aa  343  4e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  48.83 
 
 		 341 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  51.57 
 
 		 365 aa  333  2e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1601  hypothetical protein  46.46 
 
 		 363 aa  333  3e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1544  agmatine deiminase  46.46 
 
 		 363 aa  333  3e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0144  hypothetical protein  50.59 
 
 		 341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  48.08 
 
 		 355 aa  319  5e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1642  Agmatine deiminase  45.59 
 
 		 345 aa  312  6.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  47.06 
 
 		 386 aa  305  6e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00887  peptidyl-arginine deiminase  44.24 
 
 		 328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0609278  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0378  peptidyl-arginine deiminase  41.04 
 
 		 331 aa  267  2e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.521894  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.98 
 
 		 322 aa  265  7e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1581  Agmatine deiminase  42.09 
 
 		 330 aa  259  6e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.715324  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  40.46 
 
 		 350 aa  256  4e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  41.48 
 
 		 352 aa  256  5e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1172  peptidyl-arginine deiminase family protein  38.11 
 
 		 325 aa  253  5.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  39.19 
 
 		 349 aa  249  7e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  37.83 
 
 		 339 aa  247  2e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  38.24 
 
 		 349 aa  243  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  40.57 
 
 		 347 aa  243  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  39.06 
 
 		 348 aa  242  6e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00673  peptidyl-arginine deiminase  38.84 
 
 		 354 aa  242  6e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.027225  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0531  peptidyl-arginine deiminase  41.32 
 
 		 323 aa  242  7.999999999999999e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.709217  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0085  peptidyl-arginine deiminase family protein  40.55 
 
 		 348 aa  242  9e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.360574  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  40.4 
 
 		 348 aa  241  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1027  peptidyl-arginine deiminase family protein  37.8 
 
 		 325 aa  239  5e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0973  peptidyl-arginine deiminase family protein  37.5 
 
 		 325 aa  239  6.999999999999999e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0897  peptidyl-arginine deiminase family protein  37.8 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  38.37 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  39.6 
 
 		 349 aa  237  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  39.6 
 
 		 346 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3964  peptidyl-arginine deiminase  38.48 
 
 		 350 aa  236  6e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0842  peptidyl-arginine deiminase family protein  37 
 
 		 322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00603168  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  37.35 
 
 		 640 aa  230  2e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  38.29 
 
 		 347 aa  229  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  40 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  36.71 
 
 		 353 aa  227  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  37.94 
 
 		 624 aa  227  2e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  37.07 
 
 		 343 aa  226  5.0000000000000005e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  36.55 
 
 		 639 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  35.84 
 
 		 347 aa  226  6e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  35.8 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  38.05 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  36.31 
 
 		 631 aa  219  5e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  37.89 
 
 		 348 aa  219  7.999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  37.57 
 
 		 351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  34.37 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  37.25 
 
 		 334 aa  209  9e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  36.08 
 
 		 365 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  34.96 
 
 		 349 aa  206  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1873  GGDEF  34.88 
 
 		 339 aa  206  7e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0147389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  34.47 
 
 		 358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  32.6 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  33.06 
 
 		 368 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6353  Agmatine deiminase  38.04 
 
 		 383 aa  189  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  34.11 
 
 		 347 aa  189  9e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  31.98 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  31.98 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  31.98 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  36.1 
 
 		 332 aa  187  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  34.4 
 
 		 346 aa  186  7e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  32.6 
 
 		 368 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  31.77 
 
 		 368 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  30.94 
 
 		 368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  30.95 
 
 		 370 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  32.42 
 
 		 372 aa  182  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  33.43 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  31.34 
 
 		 368 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3497  agmatine deiminase  32.46 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  34.8 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48450  putative peptidyl-arginine deiminase  34.39 
 
 		 372 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000979902  normal  0.148444 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  30.87 
 
 		 370 aa  176  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  32.69 
 
 		 365 aa  176  6e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  30.6 
 
 		 370 aa  175  8e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  30.6 
 
 		 370 aa  175  9e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  30.6 
 
 		 370 aa  175  9e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  30.39 
 
 		 371 aa  175  9e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  30.47 
 
 		 364 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  31.77 
 
 		 368 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  31.58 
 
 		 370 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3209  agmatine deiminase  31.29 
 
 		 387 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  30 
 
 		 366 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  30.94 
 
 		 368 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  30.75 
 
 		 355 aa  173  5e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>