160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0822 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  100 
 
 
355 aa  740    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  58.91 
 
 
366 aa  448  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  58.97 
 
 
371 aa  419  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0678  agmatine deiminase  48.91 
 
 
386 aa  363  2e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.421408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  46.8 
 
 
368 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  48.03 
 
 
368 aa  335  7e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  47.46 
 
 
372 aa  335  7e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  46.69 
 
 
367 aa  334  1e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  46.86 
 
 
369 aa  334  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  48.85 
 
 
371 aa  333  2e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  48.85 
 
 
371 aa  333  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  48.85 
 
 
365 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  46.18 
 
 
367 aa  332  6e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  47.01 
 
 
368 aa  332  6e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  47.34 
 
 
368 aa  332  8e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  47.75 
 
 
368 aa  331  9e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  46.8 
 
 
368 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  46.8 
 
 
368 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  45.76 
 
 
370 aa  327  3e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  46.24 
 
 
368 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  44.79 
 
 
370 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  47.28 
 
 
370 aa  324  1e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  48.88 
 
 
368 aa  324  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  44.79 
 
 
370 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  46.11 
 
 
364 aa  323  3e-87  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  45.4 
 
 
370 aa  322  4e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  45.4 
 
 
369 aa  323  4e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  44.79 
 
 
370 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  44.92 
 
 
370 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  48.03 
 
 
368 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  44.79 
 
 
370 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  44.79 
 
 
370 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  45.07 
 
 
370 aa  319  5e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  44.79 
 
 
370 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  46.48 
 
 
375 aa  317  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  46.7 
 
 
365 aa  315  7e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1202  agmatine deiminase  44.54 
 
 
368 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2405  agmatine deiminase  44.54 
 
 
365 aa  311  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.761895  normal  0.0406266 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3810  agmatine deiminase  46.31 
 
 
365 aa  310  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.387298  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  45.4 
 
 
374 aa  292  5e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2154  peptidyl-arginine deiminase  41.55 
 
 
371 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1849  agmatine deiminase  41.55 
 
 
369 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552976  decreased coverage  0.00228426 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1189  peptidyl-arginine deiminase  40.97 
 
 
373 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2192  agmatine deiminase  38.29 
 
 
373 aa  268  8.999999999999999e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  39.89 
 
 
347 aa  266  5e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  41.13 
 
 
346 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  38.79 
 
 
346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36398  predicted protein  39.27 
 
 
386 aa  237  3e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  36.57 
 
 
370 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  35.24 
 
 
334 aa  222  6e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  37.29 
 
 
350 aa  222  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  35 
 
 
349 aa  219  5e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  36.34 
 
 
346 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  35.49 
 
 
339 aa  218  8.999999999999998e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  35.56 
 
 
350 aa  218  2e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  36.14 
 
 
348 aa  218  2e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  36.26 
 
 
346 aa  216  7e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  34.83 
 
 
352 aa  216  7e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0369  peptidyl-arginine deiminase  37.71 
 
 
339 aa  215  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  34.83 
 
 
347 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0059  Agmatine deiminase  35.34 
 
 
375 aa  212  9e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  36.24 
 
 
351 aa  210  3e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  33.24 
 
 
348 aa  210  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  34.55 
 
 
334 aa  209  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  33.9 
 
 
342 aa  209  6e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  35.39 
 
 
348 aa  209  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  34.17 
 
 
343 aa  208  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0833  Agmatine deiminase  35.21 
 
 
339 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  36.16 
 
 
348 aa  207  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  35.67 
 
 
639 aa  204  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  34.52 
 
 
352 aa  202  5e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4219  Agmatine deiminase  35.69 
 
 
340 aa  202  7e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  35.03 
 
 
624 aa  202  8e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0759  peptidyl-arginine deiminase  34.75 
 
 
336 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.451964  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  34.54 
 
 
358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  34.75 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6169  Agmatine deiminase  35.41 
 
 
331 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4756  peptidyl-arginine deiminase  32.48 
 
 
345 aa  198  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322594  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  32.14 
 
 
344 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  33.43 
 
 
349 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0172  Agmatine deiminase  36.18 
 
 
374 aa  196  6e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0681  Agmatine deiminase  33.24 
 
 
348 aa  195  8.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  35.1 
 
 
353 aa  193  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  35.75 
 
 
631 aa  193  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48490  putative peptidylarginine deiminase  34.75 
 
 
346 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000276698  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  33.89 
 
 
347 aa  192  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  33.99 
 
 
640 aa  191  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  33.99 
 
 
349 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  32.02 
 
 
347 aa  186  6e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  31.25 
 
 
365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  32.96 
 
 
343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  32.96 
 
 
343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4697  agmatine deiminase  34.37 
 
 
336 aa  184  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.399563  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  32.12 
 
 
356 aa  182  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  33.62 
 
 
332 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  31.32 
 
 
344 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48450  putative peptidyl-arginine deiminase  32.86 
 
 
372 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000979902  normal  0.148444 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2450  agmatine deiminase  32.2 
 
 
393 aa  176  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6353  Agmatine deiminase  32.52 
 
 
383 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1544  agmatine deiminase  31.13 
 
 
363 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>