156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1189 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2154  peptidyl-arginine deiminase  82.19 
 
 		 371 aa  638    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1189  peptidyl-arginine deiminase  100 
 
 		 373 aa  765    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1849  agmatine deiminase  84.11 
 
 		 369 aa  652    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552976  decreased coverage  0.00228426 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1202  agmatine deiminase  71.74 
 
 		 368 aa  568  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2405  agmatine deiminase  71.23 
 
 		 365 aa  558  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.761895  normal  0.0406266 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  56.71 
 
 		 369 aa  420  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  59.72 
 
 		 374 aa  411  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  54.55 
 
 		 368 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  55.25 
 
 		 368 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  54.52 
 
 		 368 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  54.52 
 
 		 368 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  54.25 
 
 		 368 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  54.27 
 
 		 368 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  52.89 
 
 		 364 aa  391  1e-108  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  53.15 
 
 		 368 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  54.55 
 
 		 368 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  55.8 
 
 		 368 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  52.23 
 
 		 370 aa  382  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  53.44 
 
 		 368 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  53.83 
 
 		 372 aa  375  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  49.59 
 
 		 366 aa  363  3e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2192  agmatine deiminase  50 
 
 		 373 aa  361  1e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  49.03 
 
 		 370 aa  346  3e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  47.91 
 
 		 370 aa  345  6e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  47.66 
 
 		 371 aa  344  1e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  47.91 
 
 		 370 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  48.19 
 
 		 370 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  47.91 
 
 		 370 aa  343  4e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  48.6 
 
 		 375 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  47.35 
 
 		 370 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  47.75 
 
 		 370 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  47.66 
 
 		 367 aa  342  7e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  47.91 
 
 		 370 aa  342  9e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  47.63 
 
 		 370 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  47.75 
 
 		 370 aa  340  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  48.31 
 
 		 367 aa  341  2e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  48.34 
 
 		 365 aa  323  2e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3810  agmatine deiminase  48.07 
 
 		 365 aa  322  8e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.387298  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  45.79 
 
 		 371 aa  317  2e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  45.79 
 
 		 371 aa  317  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  45.79 
 
 		 365 aa  317  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  44.17 
 
 		 369 aa  315  7e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0678  agmatine deiminase  41.64 
 
 		 386 aa  295  7e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.421408 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  40.97 
 
 		 355 aa  273  3e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  37.85 
 
 		 346 aa  253  3e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  37.29 
 
 		 347 aa  253  3e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36398  predicted protein  38.27 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  38.55 
 
 		 346 aa  233  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  38.11 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  33.7 
 
 		 342 aa  210  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  35.47 
 
 		 348 aa  208  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  34.77 
 
 		 624 aa  204  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  32.14 
 
 		 353 aa  201  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  34.32 
 
 		 358 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  34.92 
 
 		 348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  34.05 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  34.17 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  33.89 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  34.34 
 
 		 350 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  34.26 
 
 		 349 aa  197  3e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  33.06 
 
 		 350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  33.06 
 
 		 347 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4219  Agmatine deiminase  37.26 
 
 		 340 aa  196  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  32.87 
 
 		 639 aa  195  9e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  33.43 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  33.61 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  28.69 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  33.97 
 
 		 640 aa  193  5e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  32.41 
 
 		 348 aa  192  9e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  31.49 
 
 		 347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  31.71 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  32.88 
 
 		 352 aa  189  9e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  31.13 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0172  Agmatine deiminase  35.88 
 
 		 374 aa  186  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  32.31 
 
 		 348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0759  peptidyl-arginine deiminase  34.64 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.451964  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0059  Agmatine deiminase  33.43 
 
 		 375 aa  184  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  31.23 
 
 		 349 aa  182  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6169  Agmatine deiminase  34.75 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  30.75 
 
 		 631 aa  181  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0369  peptidyl-arginine deiminase  34.45 
 
 		 339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1048  agmatine deiminase  33.15 
 
 		 368 aa  179  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.649771  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48490  putative peptidylarginine deiminase  35.64 
 
 		 346 aa  179  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000276698  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0833  Agmatine deiminase  35.38 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0681  Agmatine deiminase  32.42 
 
 		 348 aa  178  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  32.78 
 
 		 351 aa  176  4e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4756  peptidyl-arginine deiminase  31.92 
 
 		 345 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322594  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  34.19 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6353  Agmatine deiminase  35.33 
 
 		 383 aa  172  9e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  33.97 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  31.34 
 
 		 343 aa  169  8e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  30.68 
 
 		 347 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2561  Agmatine deiminase  31.47 
 
 		 377 aa  166  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3497  agmatine deiminase  30.47 
 
 		 385 aa  166  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  32.69 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  29.55 
 
 		 365 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1751  agmatine deiminase  29.92 
 
 		 385 aa  162  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4697  agmatine deiminase  32.66 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.399563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  31.22 
 
 		 344 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3505  hypothetical protein  29.61 
 
 		 385 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>