158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2858 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  100 
 
 		 334 aa  687    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  56.72 
 
 		 348 aa  380  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  56.72 
 
 		 348 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  53.57 
 
 		 347 aa  368  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  52.84 
 
 		 349 aa  369  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  55.19 
 
 		 347 aa  365  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  52.35 
 
 		 348 aa  354  1e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  51.33 
 
 		 349 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  51.76 
 
 		 350 aa  352  4e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  51.47 
 
 		 349 aa  349  4e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  52.54 
 
 		 342 aa  347  2e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  50.74 
 
 		 352 aa  342  4e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  50 
 
 		 353 aa  342  7e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  49.71 
 
 		 346 aa  340  1e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  49.56 
 
 		 347 aa  334  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  48.97 
 
 		 352 aa  334  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  48.36 
 
 		 351 aa  333  2e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  49.1 
 
 		 339 aa  330  2e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  47.62 
 
 		 349 aa  330  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  44.61 
 
 		 346 aa  297  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  47.01 
 
 		 640 aa  293  2e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  45.3 
 
 		 365 aa  293  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  45.54 
 
 		 334 aa  288  1e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  43.58 
 
 		 639 aa  286  5e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  44.94 
 
 		 624 aa  279  6e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  44.54 
 
 		 348 aa  272  8.000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  41.79 
 
 		 346 aa  262  6e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  41.92 
 
 		 631 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  36.83 
 
 		 347 aa  256  4e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  42.77 
 
 		 344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  36.83 
 
 		 346 aa  254  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  38.66 
 
 		 368 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  37.54 
 
 		 368 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  38.38 
 
 		 368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  38.38 
 
 		 368 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  38.1 
 
 		 368 aa  242  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  40.82 
 
 		 350 aa  242  5e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  38.1 
 
 		 372 aa  241  9e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  42.11 
 
 		 344 aa  241  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  37.54 
 
 		 368 aa  239  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  40.76 
 
 		 351 aa  238  9e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  41.59 
 
 		 355 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  38.03 
 
 		 370 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  35.85 
 
 		 368 aa  233  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  38.71 
 
 		 370 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  39.07 
 
 		 343 aa  231  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  35.85 
 
 		 368 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  40.52 
 
 		 341 aa  229  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  39.94 
 
 		 342 aa  229  5e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  40.6 
 
 		 367 aa  228  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  40.75 
 
 		 356 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  38.42 
 
 		 341 aa  227  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1601  hypothetical protein  38.35 
 
 		 363 aa  228  2e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  39.64 
 
 		 340 aa  226  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  40.23 
 
 		 343 aa  227  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  42.82 
 
 		 386 aa  225  6e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1544  agmatine deiminase  38.05 
 
 		 363 aa  224  1e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  36.41 
 
 		 368 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  38.87 
 
 		 374 aa  223  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  35.49 
 
 		 371 aa  222  8e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  35.49 
 
 		 371 aa  222  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  35.49 
 
 		 365 aa  222  9e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  42.03 
 
 		 365 aa  217  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  35.96 
 
 		 369 aa  217  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  33.9 
 
 		 369 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  36.95 
 
 		 346 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  40 
 
 		 342 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  35.57 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1172  peptidyl-arginine deiminase family protein  34.55 
 
 		 325 aa  210  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  34.55 
 
 		 355 aa  209  4e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  37.13 
 
 		 350 aa  209  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  38.3 
 
 		 343 aa  209  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  38.3 
 
 		 343 aa  209  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  34.55 
 
 		 375 aa  209  6e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  33.24 
 
 		 364 aa  206  6e-52  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0984  Agmatine deiminase  35.1 
 
 		 345 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  35.26 
 
 		 371 aa  206  6e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00887  peptidyl-arginine deiminase  39.76 
 
 		 328 aa  206  6e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0609278  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1013  Agmatine deiminase  35.1 
 
 		 345 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  37.25 
 
 		 357 aa  205  9e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2402  hypothetical protein  36.99 
 
 		 376 aa  205  9e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00162245  decreased coverage  0.000927611 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  32.96 
 
 		 367 aa  205  9e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  32.96 
 
 		 367 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  38.35 
 
 		 332 aa  205  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  38.76 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0842  peptidyl-arginine deiminase family protein  33.23 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00603168  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.64 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  34.37 
 
 		 370 aa  203  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0897  peptidyl-arginine deiminase family protein  36.97 
 
 		 325 aa  203  3e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0144  hypothetical protein  37.06 
 
 		 341 aa  203  4e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1027  peptidyl-arginine deiminase family protein  33.33 
 
 		 325 aa  202  6e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4756  peptidyl-arginine deiminase  37.17 
 
 		 345 aa  202  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322594  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  33.8 
 
 		 370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  33.8 
 
 		 370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  33.52 
 
 		 370 aa  200  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48490  putative peptidylarginine deiminase  38.42 
 
 		 346 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000276698  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0531  peptidyl-arginine deiminase  34.44 
 
 		 323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.709217  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0973  peptidyl-arginine deiminase family protein  33.33 
 
 		 325 aa  200  3.9999999999999996e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  32.68 
 
 		 366 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  34.45 
 
 		 365 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>