164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0172 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0172  Agmatine deiminase  100 
 
 		 374 aa  755    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4759  peptidyl-arginine deiminase  64.14 
 
 		 370 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675137  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2373  twin-arginine translocation pathway signal  52.82 
 
 		 372 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0189025 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48450  putative peptidyl-arginine deiminase  54.13 
 
 		 372 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000979902  normal  0.148444 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2482  agmatine deiminase  51.46 
 
 		 375 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4626  agmatine deiminase  55.06 
 
 		 369 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2561  Agmatine deiminase  52.84 
 
 		 377 aa  320  3e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1048  agmatine deiminase  44.64 
 
 		 368 aa  270  4e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.649771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2072  Agmatine deiminase  45.72 
 
 		 364 aa  269  5.9999999999999995e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  44.12 
 
 		 350 aa  256  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  44.25 
 
 		 346 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6169  Agmatine deiminase  45.97 
 
 		 331 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  40.68 
 
 		 368 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  37.31 
 
 		 347 aa  237  2e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48490  putative peptidylarginine deiminase  44.54 
 
 		 346 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000276698  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  39.66 
 
 		 368 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  40.22 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  37.01 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  40.4 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0681  Agmatine deiminase  41.57 
 
 		 348 aa  233  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  39.94 
 
 		 368 aa  232  6e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  39.11 
 
 		 368 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  38.83 
 
 		 368 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4756  peptidyl-arginine deiminase  41.16 
 
 		 345 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322594  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  37.99 
 
 		 368 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  40.24 
 
 		 346 aa  226  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  38.83 
 
 		 368 aa  226  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  38.75 
 
 		 364 aa  224  1e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  40.11 
 
 		 368 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0059  Agmatine deiminase  40.35 
 
 		 375 aa  224  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  39.39 
 
 		 368 aa  223  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0833  Agmatine deiminase  41.18 
 
 		 339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  41.11 
 
 		 370 aa  219  7e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  39.03 
 
 		 370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  37.24 
 
 		 334 aa  216  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  38.24 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  37.11 
 
 		 369 aa  210  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3505  hypothetical protein  34.63 
 
 		 385 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1751  agmatine deiminase  33.8 
 
 		 385 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0759  peptidyl-arginine deiminase  40 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.451964  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  37.9 
 
 		 343 aa  207  3e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3497  agmatine deiminase  34.34 
 
 		 385 aa  207  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  38.03 
 
 		 371 aa  206  7e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  38.55 
 
 		 374 aa  202  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  33.33 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4760  peptidyl-arginine deiminase  35.47 
 
 		 509 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  34.77 
 
 		 358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3209  agmatine deiminase  33.8 
 
 		 387 aa  200  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  37.14 
 
 		 367 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  37.43 
 
 		 367 aa  199  9e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  36.57 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  36.52 
 
 		 640 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  36.57 
 
 		 371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  36.57 
 
 		 371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  35.16 
 
 		 346 aa  197  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  39.03 
 
 		 365 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  36.68 
 
 		 349 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  37.72 
 
 		 332 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  36.18 
 
 		 355 aa  196  6e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  36.31 
 
 		 350 aa  196  7e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  36.86 
 
 		 375 aa  195  9e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  36.57 
 
 		 347 aa  193  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  36.86 
 
 		 370 aa  193  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  35.61 
 
 		 624 aa  193  4e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  36.16 
 
 		 370 aa  192  8e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  35.61 
 
 		 348 aa  192  8e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3810  agmatine deiminase  39.2 
 
 		 365 aa  192  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.387298  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  36 
 
 		 348 aa  191  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  33.9 
 
 		 369 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  35.59 
 
 		 370 aa  191  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  35.93 
 
 		 639 aa  191  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  36.95 
 
 		 348 aa  190  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  36.09 
 
 		 342 aa  189  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  34.91 
 
 		 334 aa  189  5.999999999999999e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  34.94 
 
 		 370 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  34.66 
 
 		 370 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2450  agmatine deiminase  33.82 
 
 		 393 aa  189  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0678  agmatine deiminase  34.32 
 
 		 386 aa  188  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.421408 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  35.23 
 
 		 370 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  34.94 
 
 		 370 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  34.94 
 
 		 370 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  34.94 
 
 		 370 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1189  peptidyl-arginine deiminase  35.88 
 
 		 373 aa  186  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  35.76 
 
 		 347 aa  186  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1849  agmatine deiminase  36.03 
 
 		 369 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552976  decreased coverage  0.00228426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2154  peptidyl-arginine deiminase  34.75 
 
 		 371 aa  185  9e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  34.66 
 
 		 370 aa  185  9e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2192  agmatine deiminase  32.77 
 
 		 373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  34.9 
 
 		 348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  34.58 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  33.97 
 
 		 631 aa  182  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2405  agmatine deiminase  32.48 
 
 		 365 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.761895  normal  0.0406266 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36398  predicted protein  34.74 
 
 		 386 aa  181  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4219  Agmatine deiminase  37.46 
 
 		 340 aa  180  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  37.35 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1202  agmatine deiminase  31.91 
 
 		 368 aa  177  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  32.94 
 
 		 349 aa  177  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0369  peptidyl-arginine deiminase  36.36 
 
 		 339 aa  176  6e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  34.88 
 
 		 351 aa  173  5.999999999999999e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  32.29 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>