161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1018 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  706    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  65.4 
 
 		 344 aa  479  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  66.47 
 
 		 351 aa  478  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  64.9 
 
 		 342 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  65.29 
 
 		 342 aa  474  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  64.6 
 
 		 343 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  61 
 
 		 341 aa  448  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  60.82 
 
 		 340 aa  432  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2402  hypothetical protein  57.86 
 
 		 376 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00162245  decreased coverage  0.000927611 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  56.27 
 
 		 344 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  54.09 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  53.82 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  54.14 
 
 		 343 aa  372  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  54.14 
 
 		 343 aa  372  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  54.02 
 
 		 350 aa  368  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1601  hypothetical protein  51.32 
 
 		 363 aa  358  9e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1544  agmatine deiminase  50.73 
 
 		 363 aa  353  2e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  51.16 
 
 		 355 aa  352  4e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1013  Agmatine deiminase  50.59 
 
 		 345 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0984  Agmatine deiminase  50.59 
 
 		 345 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0144  hypothetical protein  50.73 
 
 		 341 aa  341  9e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1642  Agmatine deiminase  50.15 
 
 		 345 aa  340  2e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  46.18 
 
 		 367 aa  329  3e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  49.27 
 
 		 386 aa  321  9.999999999999999e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00887  peptidyl-arginine deiminase  49.85 
 
 		 328 aa  321  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0609278  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  50.15 
 
 		 365 aa  318  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0378  peptidyl-arginine deiminase  44.35 
 
 		 331 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.521894  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.69 
 
 		 322 aa  290  4e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1172  peptidyl-arginine deiminase family protein  41.59 
 
 		 325 aa  285  5e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0085  peptidyl-arginine deiminase family protein  42.42 
 
 		 348 aa  276  4e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.360574  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1581  Agmatine deiminase  42.43 
 
 		 330 aa  276  5e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.715324  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1027  peptidyl-arginine deiminase family protein  41.59 
 
 		 325 aa  275  8e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0897  peptidyl-arginine deiminase family protein  41.87 
 
 		 325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0973  peptidyl-arginine deiminase family protein  41.59 
 
 		 325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0842  peptidyl-arginine deiminase family protein  40.55 
 
 		 322 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00603168  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  43.44 
 
 		 350 aa  264  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  40.18 
 
 		 349 aa  262  4.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0531  peptidyl-arginine deiminase  41 
 
 		 323 aa  260  3e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.709217  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  39.47 
 
 		 348 aa  255  8e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  41.42 
 
 		 342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  39.36 
 
 		 347 aa  249  6e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  39.07 
 
 		 349 aa  248  1e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  38.89 
 
 		 348 aa  248  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  42.23 
 
 		 334 aa  246  3e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  39.71 
 
 		 640 aa  247  3e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  40.11 
 
 		 348 aa  246  4e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  37.35 
 
 		 639 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3964  peptidyl-arginine deiminase  38.3 
 
 		 350 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  38.82 
 
 		 353 aa  243  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  40.69 
 
 		 348 aa  243  3.9999999999999997e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  35.31 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  38.37 
 
 		 352 aa  241  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00673  peptidyl-arginine deiminase  38.21 
 
 		 354 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.027225  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  38.62 
 
 		 346 aa  239  4e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  37.75 
 
 		 349 aa  239  6.999999999999999e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  37.65 
 
 		 347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  39.65 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  38.71 
 
 		 624 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  37.06 
 
 		 352 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  37.68 
 
 		 347 aa  230  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  40.52 
 
 		 334 aa  229  4e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  36.05 
 
 		 346 aa  228  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  37.06 
 
 		 631 aa  226  4e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  36.18 
 
 		 349 aa  226  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  36.36 
 
 		 365 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1873  GGDEF  34.78 
 
 		 339 aa  211  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0147389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  34.59 
 
 		 343 aa  205  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  33.43 
 
 		 358 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  32.77 
 
 		 369 aa  198  9e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  33.15 
 
 		 372 aa  196  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  31.61 
 
 		 368 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  31.74 
 
 		 368 aa  192  6e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6353  Agmatine deiminase  34.76 
 
 		 383 aa  189  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  31.68 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  34.51 
 
 		 332 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  30.25 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  30.34 
 
 		 364 aa  187  2e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  34.02 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2072  Agmatine deiminase  36.84 
 
 		 364 aa  186  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  29.97 
 
 		 368 aa  186  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  31.34 
 
 		 368 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  31.67 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  31.83 
 
 		 365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  31.83 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  31.83 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  31.13 
 
 		 368 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  30.79 
 
 		 368 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  30.18 
 
 		 347 aa  179  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48450  putative peptidyl-arginine deiminase  32.54 
 
 		 372 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000979902  normal  0.148444 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  30.14 
 
 		 368 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  34.69 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4697  agmatine deiminase  32.35 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.399563  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  31.38 
 
 		 346 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  29.97 
 
 		 368 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36398  predicted protein  32.11 
 
 		 386 aa  176  4e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  31.65 
 
 		 370 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  29.69 
 
 		 368 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  31.84 
 
 		 370 aa  176  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  31.56 
 
 		 370 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  31.62 
 
 		 370 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>