164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2482 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2482  agmatine deiminase  100 
 
 		 375 aa  775    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2373  twin-arginine translocation pathway signal  69.6 
 
 		 372 aa  527  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0189025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4626  agmatine deiminase  73.21 
 
 		 369 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48450  putative peptidyl-arginine deiminase  56.06 
 
 		 372 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000979902  normal  0.148444 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2561  Agmatine deiminase  56.76 
 
 		 377 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0172  Agmatine deiminase  51.46 
 
 		 374 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4759  peptidyl-arginine deiminase  52.53 
 
 		 370 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675137  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2072  Agmatine deiminase  42.48 
 
 		 364 aa  266  5e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1048  agmatine deiminase  43.52 
 
 		 368 aa  265  8e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.649771  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  36.92 
 
 		 350 aa  209  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  36.6 
 
 		 346 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  33.05 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  33.04 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  34.73 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  33.05 
 
 		 368 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6169  Agmatine deiminase  37.69 
 
 		 331 aa  196  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  32.04 
 
 		 334 aa  196  7e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  33.33 
 
 		 368 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0681  Agmatine deiminase  36.42 
 
 		 348 aa  195  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  34.02 
 
 		 343 aa  194  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  34.71 
 
 		 370 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  30.7 
 
 		 366 aa  194  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  32.77 
 
 		 368 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  33.05 
 
 		 368 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  33.05 
 
 		 368 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  31.87 
 
 		 346 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0759  peptidyl-arginine deiminase  36.86 
 
 		 336 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.451964  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  36.89 
 
 		 624 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0833  Agmatine deiminase  36.71 
 
 		 339 aa  189  8e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  32.96 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4756  peptidyl-arginine deiminase  35.47 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322594  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  33.53 
 
 		 348 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  32.68 
 
 		 368 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48490  putative peptidylarginine deiminase  36.44 
 
 		 346 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000276698  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0059  Agmatine deiminase  36.44 
 
 		 375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  34.29 
 
 		 342 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  34.16 
 
 		 368 aa  182  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1751  agmatine deiminase  29.02 
 
 		 385 aa  182  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  31.78 
 
 		 358 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  32.84 
 
 		 346 aa  182  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  34.17 
 
 		 369 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2192  agmatine deiminase  30.56 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  33.05 
 
 		 368 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  32.31 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  34.08 
 
 		 370 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4760  peptidyl-arginine deiminase  30.2 
 
 		 509 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  32.16 
 
 		 339 aa  179  7e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  34.01 
 
 		 640 aa  179  7e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3505  hypothetical protein  28.76 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3497  agmatine deiminase  28.23 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3209  agmatine deiminase  28.76 
 
 		 387 aa  176  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  32.58 
 
 		 347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  33.61 
 
 		 639 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  30.83 
 
 		 364 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  33.91 
 
 		 365 aa  172  6.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  30.64 
 
 		 369 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2450  agmatine deiminase  29.03 
 
 		 393 aa  169  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  32.68 
 
 		 347 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0678  agmatine deiminase  30.75 
 
 		 386 aa  168  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.421408 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  30.7 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  30.42 
 
 		 370 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  29.63 
 
 		 370 aa  167  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  29.94 
 
 		 370 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  32.67 
 
 		 348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  31.05 
 
 		 348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  30.79 
 
 		 370 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  31.03 
 
 		 367 aa  166  8e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  32.77 
 
 		 367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  29.86 
 
 		 370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  31.74 
 
 		 370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  30.62 
 
 		 370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  30.85 
 
 		 367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  29.38 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  29.86 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  32.56 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  30.9 
 
 		 631 aa  164  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  37.31 
 
 		 350 aa  162  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4219  Agmatine deiminase  33.82 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  29.94 
 
 		 375 aa  160  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1202  agmatine deiminase  29.49 
 
 		 368 aa  160  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  35.21 
 
 		 365 aa  160  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  32.96 
 
 		 374 aa  159  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  29.91 
 
 		 357 aa  159  8e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2154  peptidyl-arginine deiminase  30.9 
 
 		 371 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2405  agmatine deiminase  29.04 
 
 		 365 aa  158  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.761895  normal  0.0406266 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  28.45 
 
 		 349 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  30.1 
 
 		 371 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  30.1 
 
 		 371 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  30.11 
 
 		 365 aa  157  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36398  predicted protein  31.75 
 
 		 386 aa  156  5.0000000000000005e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  32.27 
 
 		 351 aa  156  5.0000000000000005e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.24 
 
 		 322 aa  156  7e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  29.33 
 
 		 341 aa  155  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1849  agmatine deiminase  31.07 
 
 		 369 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552976  decreased coverage  0.00228426 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1755  agmatine deiminase  31.2 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.807714  normal  0.973962 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  30.79 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  31.29 
 
 		 334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  30.72 
 
 		 356 aa  153  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  33.53 
 
 		 344 aa  153  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  30.97 
 
 		 351 aa  153  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>