158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0652 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  100 
 
 
370 aa  754    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  43.84 
 
 
347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  47.73 
 
 
346 aa  327  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  43.27 
 
 
346 aa  324  1e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  44.41 
 
 
369 aa  291  9e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  44.83 
 
 
350 aa  279  5e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  43.53 
 
 
334 aa  276  4e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  43.09 
 
 
372 aa  273  4.0000000000000004e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0059  Agmatine deiminase  44.8 
 
 
375 aa  271  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6169  Agmatine deiminase  44.38 
 
 
331 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  43.01 
 
 
368 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  42.37 
 
 
346 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  42.35 
 
 
368 aa  263  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  39.12 
 
 
369 aa  260  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  42.41 
 
 
342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0681  Agmatine deiminase  42.82 
 
 
348 aa  254  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  40.44 
 
 
368 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  39.89 
 
 
343 aa  252  6e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  41.67 
 
 
374 aa  253  6e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  40.16 
 
 
368 aa  252  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0833  Agmatine deiminase  43.44 
 
 
339 aa  252  7e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  40.39 
 
 
370 aa  251  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  43.28 
 
 
368 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  38.98 
 
 
347 aa  250  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  40.27 
 
 
370 aa  248  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  37.7 
 
 
364 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  40.69 
 
 
624 aa  245  8e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48490  putative peptidylarginine deiminase  44.19 
 
 
346 aa  245  9e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000276698  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  40.51 
 
 
348 aa  245  9.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  40 
 
 
370 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  39.45 
 
 
370 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  38.63 
 
 
367 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  38.98 
 
 
370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  39.18 
 
 
370 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  39.18 
 
 
368 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  38.52 
 
 
368 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  38.46 
 
 
367 aa  243  5e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  40 
 
 
375 aa  243  6e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  39.52 
 
 
370 aa  242  7e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  36.02 
 
 
366 aa  242  9e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  40.16 
 
 
368 aa  242  9e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  39.52 
 
 
370 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  40.16 
 
 
370 aa  242  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  38.71 
 
 
370 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  39.52 
 
 
370 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  37.46 
 
 
358 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3810  agmatine deiminase  40.05 
 
 
365 aa  240  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.387298  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  38.9 
 
 
368 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  40 
 
 
365 aa  239  5.999999999999999e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  38.52 
 
 
368 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  38.19 
 
 
371 aa  238  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  38.19 
 
 
371 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  37.93 
 
 
347 aa  237  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  38.74 
 
 
365 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  37.92 
 
 
639 aa  237  3e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0759  peptidyl-arginine deiminase  40.35 
 
 
336 aa  235  7e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.451964  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  38.71 
 
 
334 aa  231  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2405  agmatine deiminase  35.97 
 
 
365 aa  231  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.761895  normal  0.0406266 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  37.03 
 
 
371 aa  230  3e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  35.24 
 
 
346 aa  229  5e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  35.84 
 
 
339 aa  229  5e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  36.57 
 
 
355 aa  228  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1202  agmatine deiminase  35.42 
 
 
368 aa  228  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  36.75 
 
 
631 aa  227  3e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  35.71 
 
 
365 aa  227  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2072  Agmatine deiminase  41.42 
 
 
364 aa  226  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1189  peptidyl-arginine deiminase  38.11 
 
 
373 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  36.36 
 
 
348 aa  223  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  38.11 
 
 
348 aa  223  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4219  Agmatine deiminase  41.38 
 
 
340 aa  223  4.9999999999999996e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2373  twin-arginine translocation pathway signal  36.07 
 
 
372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0189025 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  36.21 
 
 
349 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2154  peptidyl-arginine deiminase  35.83 
 
 
371 aa  220  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  36.31 
 
 
640 aa  220  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4759  peptidyl-arginine deiminase  40.71 
 
 
370 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675137  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0172  Agmatine deiminase  41.11 
 
 
374 aa  219  7e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1849  agmatine deiminase  37 
 
 
369 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552976  decreased coverage  0.00228426 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  34.01 
 
 
348 aa  218  2e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  32.66 
 
 
349 aa  216  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  35.16 
 
 
350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48450  putative peptidyl-arginine deiminase  37.25 
 
 
372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000979902  normal  0.148444 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  36.84 
 
 
356 aa  210  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  38.6 
 
 
332 aa  210  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0678  agmatine deiminase  34.95 
 
 
386 aa  209  5e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.421408 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4756  peptidyl-arginine deiminase  36.66 
 
 
345 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322594  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  34.29 
 
 
349 aa  208  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  32.1 
 
 
347 aa  207  3e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4626  agmatine deiminase  36.07 
 
 
369 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192221  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  34.01 
 
 
352 aa  202  6e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  32.95 
 
 
352 aa  199  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  35.24 
 
 
346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  37.94 
 
 
327 aa  196  6e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2482  agmatine deiminase  34.71 
 
 
375 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1048  agmatine deiminase  33.53 
 
 
368 aa  194  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.649771  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36398  predicted protein  35.99 
 
 
386 aa  193  3e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2192  agmatine deiminase  32.33 
 
 
373 aa  193  4e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  30.79 
 
 
353 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  34.58 
 
 
351 aa  191  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  34.47 
 
 
344 aa  186  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  32.85 
 
 
340 aa  186  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>