More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2038 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  100 
 
 
639 aa  1310    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  57.1 
 
 
640 aa  748    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  55.34 
 
 
631 aa  709    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  60.35 
 
 
624 aa  770    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  52.34 
 
 
348 aa  351  3e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  53.22 
 
 
348 aa  347  4e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  49.57 
 
 
349 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  50.29 
 
 
348 aa  338  9.999999999999999e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  47.95 
 
 
349 aa  337  5e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  49.85 
 
 
349 aa  332  2e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  48.68 
 
 
352 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  47.09 
 
 
347 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  50.87 
 
 
347 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  47.95 
 
 
346 aa  327  5e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  48.68 
 
 
350 aa  326  7e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  46.55 
 
 
339 aa  318  2e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  46.33 
 
 
342 aa  318  3e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  47.51 
 
 
365 aa  313  7.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  46.31 
 
 
349 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  47.23 
 
 
347 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1717  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  53.82 
 
 
291 aa  301  2e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  42.61 
 
 
352 aa  301  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2857  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  52.76 
 
 
292 aa  297  4e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  0.190038 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  43.84 
 
 
353 aa  294  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1731  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  53.38 
 
 
289 aa  293  5e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  43.58 
 
 
334 aa  286  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1903  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  52.26 
 
 
296 aa  282  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00174651  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2560  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  49.82 
 
 
291 aa  278  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.195885 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1608  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  51.07 
 
 
290 aa  278  3e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1822  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  50.18 
 
 
294 aa  276  8e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3938  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  45.99 
 
 
291 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0480903  normal  0.165411 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2118  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  50.9 
 
 
285 aa  276  1.0000000000000001e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.556726  normal  0.0624833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2741  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  49.65 
 
 
294 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2512  carbon-nitrogen hydrolase  46.13 
 
 
290 aa  272  1e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1026  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  50.36 
 
 
291 aa  270  5e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.451175  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0707  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  48.62 
 
 
295 aa  269  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0693  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  45.3 
 
 
291 aa  269  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  41.32 
 
 
334 aa  268  2.9999999999999995e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1514  carbon-nitrogen hydrolase family protein  50.35 
 
 
292 aa  267  5e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  42.15 
 
 
351 aa  267  5e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  41.76 
 
 
358 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1941  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  46.58 
 
 
303 aa  266  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.516758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2623  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  46.21 
 
 
299 aa  265  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1510  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  48.8 
 
 
299 aa  265  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1027  glycosy hydrolase family protein  47.42 
 
 
294 aa  263  6e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1017  amidohydrolase  46.58 
 
 
295 aa  263  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1444  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  47.95 
 
 
294 aa  260  5.0000000000000005e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0920298 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1361  glycosy hydrolase family protein  50.69 
 
 
291 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  40.58 
 
 
348 aa  260  5.0000000000000005e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  41.64 
 
 
343 aa  259  7e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0942  carbon-nitrogen hydrolase family protein  48.44 
 
 
294 aa  259  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  38.51 
 
 
346 aa  258  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0784  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  44.22 
 
 
295 aa  257  4e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0710  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  47.42 
 
 
294 aa  257  5e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1255  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  52.48 
 
 
300 aa  253  6e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131033  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  40.23 
 
 
342 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2598  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  46.58 
 
 
294 aa  251  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00535485  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2472  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  46.39 
 
 
293 aa  250  7e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  40.82 
 
 
343 aa  249  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0736  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  45.36 
 
 
294 aa  249  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374285  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3416  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  45.21 
 
 
296 aa  248  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0379108  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1862  carbon-nitrogen family hydrolase  46.9 
 
 
295 aa  248  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00415258  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  39.88 
 
 
347 aa  247  4e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  39.14 
 
 
346 aa  246  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  37.35 
 
 
341 aa  244  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  40.77 
 
 
367 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00886  beta-alanine synthetase  45.89 
 
 
299 aa  244  3.9999999999999997e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0326997  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2448  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  44.76 
 
 
293 aa  242  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0143  carbon-nitrogen family hydrolase  44.83 
 
 
292 aa  241  2.9999999999999997e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  39.64 
 
 
344 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1641  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  46.37 
 
 
295 aa  241  4e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.97553 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  41 
 
 
342 aa  240  5e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1446  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  46.39 
 
 
294 aa  239  8e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  40.71 
 
 
344 aa  239  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0167  N-carbamoylputrescine amidase  45.73 
 
 
294 aa  239  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1751  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  42.95 
 
 
307 aa  239  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.294979  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1545  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  44.86 
 
 
295 aa  238  2e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.838608  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00672  glycosyl hydrolase, family 10  43.54 
 
 
297 aa  239  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0501014  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1196  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  46.08 
 
 
299 aa  238  3e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0152  N-carbamoylputrescine amidase  45.39 
 
 
294 aa  238  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  39.12 
 
 
351 aa  238  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  37.92 
 
 
370 aa  237  6e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1014  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  42.47 
 
 
295 aa  237  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.204532  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0985  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  42.47 
 
 
295 aa  237  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0833  N-carbamoylputrescine amidohydrolase  45.39 
 
 
294 aa  236  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3339  N-carbamoylputrescine amidohydrolase  45.39 
 
 
294 aa  236  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1602  pantothenase  44.18 
 
 
295 aa  236  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  39.94 
 
 
370 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0835  N-carbamoylputrescine amidase  45.05 
 
 
294 aa  234  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.121363  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1585  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  45.49 
 
 
290 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  39.31 
 
 
346 aa  234  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1745  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  46.74 
 
 
293 aa  232  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2145  hypothetical protein  45.86 
 
 
295 aa  232  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.695458  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  38.94 
 
 
340 aa  232  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4018  N-carbamoylputrescine amidase  43.84 
 
 
294 aa  231  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  38.86 
 
 
372 aa  231  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1755  agmatine deiminase  39.37 
 
 
348 aa  229  9e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.807714  normal  0.973962 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0895  hydrolase, carbon-nitrogen family  42.81 
 
 
290 aa  229  2e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0311874  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  37.78 
 
 
356 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  38.64 
 
 
341 aa  229  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>