159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1901 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  100 
 
 		 352 aa  726    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  75 
 
 		 350 aa  539  9.999999999999999e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  73.91 
 
 		 349 aa  535  1e-151  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  72.75 
 
 		 349 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  69.36 
 
 		 346 aa  503  1e-141  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  68.59 
 
 		 348 aa  491  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  67.06 
 
 		 347 aa  464  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  57.35 
 
 		 348 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  54.73 
 
 		 339 aa  392  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  57.31 
 
 		 348 aa  387  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  54.41 
 
 		 347 aa  374  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  51.75 
 
 		 349 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  50.29 
 
 		 347 aa  364  1e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  50.59 
 
 		 349 aa  352  5e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  50.29 
 
 		 342 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  48.97 
 
 		 334 aa  334  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  48.86 
 
 		 365 aa  333  4e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  48.68 
 
 		 639 aa  329  6e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  46.33 
 
 		 353 aa  324  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  44.77 
 
 		 352 aa  314  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  47.65 
 
 		 624 aa  305  6e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  44.12 
 
 		 640 aa  301  1e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  44.25 
 
 		 334 aa  291  1e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  43.15 
 
 		 348 aa  288  8e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  44.02 
 
 		 351 aa  285  1.0000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  42.36 
 
 		 346 aa  281  9e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  42.69 
 
 		 631 aa  279  5e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  41.28 
 
 		 343 aa  265  8.999999999999999e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  40.58 
 
 		 367 aa  251  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  40.86 
 
 		 357 aa  249  5e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  40.41 
 
 		 344 aa  246  4e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  37.81 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  40.63 
 
 		 344 aa  241  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  38.37 
 
 		 341 aa  241  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  39.83 
 
 		 343 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  39.83 
 
 		 343 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  38.26 
 
 		 358 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  39.37 
 
 		 342 aa  238  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  40.41 
 
 		 351 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  38.12 
 
 		 369 aa  233  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  40.12 
 
 		 356 aa  233  5e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  40 
 
 		 341 aa  232  6e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  39.66 
 
 		 343 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  37.82 
 
 		 350 aa  230  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  40.29 
 
 		 342 aa  230  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  39.53 
 
 		 355 aa  229  8e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  39.59 
 
 		 346 aa  228  8e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  33.91 
 
 		 347 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0144  hypothetical protein  39.77 
 
 		 341 aa  227  3e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  36.78 
 
 		 368 aa  226  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  33.81 
 
 		 346 aa  225  8e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  35.18 
 
 		 371 aa  225  9e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  35.18 
 
 		 371 aa  225  9e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  40.7 
 
 		 386 aa  224  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  35.18 
 
 		 365 aa  225  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  34.81 
 
 		 369 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  34.63 
 
 		 364 aa  223  4e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  37.29 
 
 		 374 aa  222  9e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  38.15 
 
 		 340 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  42.49 
 
 		 365 aa  219  5e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.72 
 
 		 322 aa  219  5e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  34.35 
 
 		 367 aa  219  7e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  35.42 
 
 		 368 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  34.35 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  35.6 
 
 		 368 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  35.87 
 
 		 368 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  35.81 
 
 		 372 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  35.44 
 
 		 371 aa  218  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  38.9 
 
 		 332 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  35.54 
 
 		 368 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  39.48 
 
 		 327 aa  216  4e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3810  agmatine deiminase  33.88 
 
 		 365 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.387298  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  34.16 
 
 		 365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  33.52 
 
 		 370 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  33.52 
 
 		 370 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1601  hypothetical protein  34.77 
 
 		 363 aa  212  5.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  33.52 
 
 		 370 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  35.15 
 
 		 368 aa  212  9e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  32.96 
 
 		 370 aa  212  9e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  36.34 
 
 		 350 aa  212  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  33.24 
 
 		 370 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  33.52 
 
 		 370 aa  211  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  33.8 
 
 		 375 aa  211  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1202  agmatine deiminase  34.16 
 
 		 368 aa  212  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0984  Agmatine deiminase  37.46 
 
 		 345 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1013  Agmatine deiminase  37.46 
 
 		 345 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  32.96 
 
 		 370 aa  211  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  35.67 
 
 		 346 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  34.06 
 
 		 368 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0378  peptidyl-arginine deiminase  34.31 
 
 		 331 aa  210  3e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.521894  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  34.06 
 
 		 368 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  35.07 
 
 		 366 aa  209  7e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2402  hypothetical protein  35.47 
 
 		 376 aa  209  8e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00162245  decreased coverage  0.000927611 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  32.96 
 
 		 370 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  33.79 
 
 		 368 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1544  agmatine deiminase  34.48 
 
 		 363 aa  208  9e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  32.41 
 
 		 370 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  32.69 
 
 		 370 aa  207  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00887  peptidyl-arginine deiminase  37.69 
 
 		 328 aa  207  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0609278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1755  agmatine deiminase  37.57 
 
 		 348 aa  207  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.807714  normal  0.973962 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>