157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1512 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  719    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  75 
 
 
352 aa  539  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  72.43 
 
 
349 aa  528  1e-149  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  70.81 
 
 
349 aa  521  1e-147  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  69.21 
 
 
346 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  69.08 
 
 
348 aa  502  1e-141  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  66.37 
 
 
347 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  58.94 
 
 
348 aa  414  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  58.36 
 
 
348 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  52.49 
 
 
339 aa  387  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  54.15 
 
 
347 aa  386  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  53.08 
 
 
349 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  50.73 
 
 
347 aa  372  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  51.16 
 
 
349 aa  363  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  51.76 
 
 
334 aa  352  4e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  50.44 
 
 
342 aa  343  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  47.21 
 
 
353 aa  335  7.999999999999999e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  48.68 
 
 
639 aa  326  3e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  49.56 
 
 
624 aa  323  4e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  46.18 
 
 
640 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  44.77 
 
 
352 aa  317  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  46.74 
 
 
365 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  45.82 
 
 
351 aa  305  8.000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  45.51 
 
 
348 aa  296  4e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  43.53 
 
 
631 aa  289  4e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  43.8 
 
 
346 aa  284  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  42.94 
 
 
334 aa  280  3e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  41.57 
 
 
343 aa  267  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  43.44 
 
 
341 aa  264  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  38.9 
 
 
370 aa  258  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  42.15 
 
 
344 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  41.03 
 
 
350 aa  251  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  40.35 
 
 
342 aa  249  6e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  40.17 
 
 
357 aa  249  7e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  37.63 
 
 
372 aa  248  8e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  39.88 
 
 
343 aa  247  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  39.88 
 
 
343 aa  247  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0144  hypothetical protein  39.77 
 
 
341 aa  241  2e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  40.64 
 
 
343 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  41.11 
 
 
344 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  37.19 
 
 
369 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  39.65 
 
 
356 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  37.64 
 
 
368 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  40.82 
 
 
342 aa  237  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  37.09 
 
 
368 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  36.81 
 
 
368 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  40.59 
 
 
367 aa  236  6e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  38.04 
 
 
368 aa  236  6e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  35.67 
 
 
347 aa  235  7e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  35.09 
 
 
346 aa  235  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  37.64 
 
 
368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  40.23 
 
 
351 aa  233  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  38.79 
 
 
341 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  39.59 
 
 
355 aa  232  6e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  34.53 
 
 
365 aa  232  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  34.53 
 
 
371 aa  232  7.000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  34.53 
 
 
371 aa  232  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  37.09 
 
 
368 aa  229  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  41.28 
 
 
386 aa  228  9e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  33.52 
 
 
369 aa  228  9e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  33.43 
 
 
364 aa  228  1e-58  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  36.81 
 
 
368 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  36.81 
 
 
368 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  36.81 
 
 
368 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  36.16 
 
 
371 aa  225  7e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  38.04 
 
 
340 aa  225  8e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  34.81 
 
 
375 aa  224  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  38.53 
 
 
346 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  36.19 
 
 
366 aa  223  3e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  34.62 
 
 
365 aa  223  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0984  Agmatine deiminase  37.57 
 
 
345 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  33.43 
 
 
367 aa  223  4e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1013  Agmatine deiminase  37.57 
 
 
345 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3810  agmatine deiminase  34.34 
 
 
365 aa  222  6e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.387298  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.23 
 
 
322 aa  222  6e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1601  hypothetical protein  36.05 
 
 
363 aa  223  6e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  33.15 
 
 
367 aa  222  8e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  41.91 
 
 
365 aa  221  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1544  agmatine deiminase  36.05 
 
 
363 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  39.32 
 
 
332 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  37.09 
 
 
368 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  35.23 
 
 
358 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  35.56 
 
 
355 aa  218  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3490  agmatine deiminase  38.51 
 
 
348 aa  217  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1755  agmatine deiminase  37.54 
 
 
348 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.807714  normal  0.973962 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  39.53 
 
 
327 aa  216  7e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  35.16 
 
 
370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  32.87 
 
 
370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1202  agmatine deiminase  32.97 
 
 
368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2405  agmatine deiminase  32.42 
 
 
365 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.761895  normal  0.0406266 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  32.87 
 
 
370 aa  212  9e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  32.04 
 
 
370 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  34.88 
 
 
374 aa  212  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  32.32 
 
 
370 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3203  agmatine deiminase  36.16 
 
 
348 aa  210  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.659757  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  32.32 
 
 
370 aa  210  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  32.32 
 
 
370 aa  209  6e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  32.05 
 
 
370 aa  209  7e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  32.04 
 
 
370 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  32.04 
 
 
370 aa  209  8e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>