159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0706 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  100 
 
 
347 aa  717    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  73.33 
 
 
348 aa  519  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  71.01 
 
 
348 aa  509  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  57.85 
 
 
347 aa  431  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  56.52 
 
 
349 aa  422  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  57.43 
 
 
342 aa  408  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  55.79 
 
 
339 aa  402  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  56.07 
 
 
348 aa  398  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  54.91 
 
 
349 aa  395  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  54.15 
 
 
350 aa  394  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  53.91 
 
 
349 aa  390  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  54.41 
 
 
349 aa  385  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  54.41 
 
 
352 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  52.29 
 
 
346 aa  379  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  54.36 
 
 
347 aa  378  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  55.19 
 
 
334 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  51.58 
 
 
352 aa  359  3e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  51.9 
 
 
353 aa  357  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  50.87 
 
 
639 aa  334  1e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  47.23 
 
 
640 aa  331  1e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  48.19 
 
 
365 aa  324  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  47.69 
 
 
624 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  46.61 
 
 
351 aa  313  2.9999999999999996e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  46.65 
 
 
631 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  46.22 
 
 
348 aa  306  3e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  44.38 
 
 
334 aa  291  1e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  42.44 
 
 
346 aa  286  5e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  39.65 
 
 
347 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  39.36 
 
 
346 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  42.94 
 
 
343 aa  276  4e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  41.28 
 
 
346 aa  266  5.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  41.73 
 
 
370 aa  262  6e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  39.77 
 
 
358 aa  255  9e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  39.55 
 
 
370 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  38.42 
 
 
368 aa  253  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  39.36 
 
 
341 aa  252  6e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  41.35 
 
 
344 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  39.07 
 
 
368 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3810  agmatine deiminase  38.32 
 
 
365 aa  250  3e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.387298  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  37.06 
 
 
370 aa  249  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  40.05 
 
 
369 aa  250  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  41.23 
 
 
344 aa  249  3e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  38.52 
 
 
368 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  36.34 
 
 
369 aa  247  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  36.07 
 
 
365 aa  247  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  36.07 
 
 
371 aa  248  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  36.07 
 
 
371 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  36.41 
 
 
367 aa  246  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  38.54 
 
 
372 aa  246  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  39.41 
 
 
342 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  40.69 
 
 
356 aa  245  6.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  35.87 
 
 
367 aa  245  8e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  38.04 
 
 
368 aa  245  9e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  40 
 
 
357 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  39.71 
 
 
351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  35.97 
 
 
370 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  36.51 
 
 
370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  35.97 
 
 
370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  38.69 
 
 
374 aa  243  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  39.71 
 
 
350 aa  242  7e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  36.24 
 
 
370 aa  241  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  39.77 
 
 
343 aa  241  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  36.51 
 
 
370 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  37.77 
 
 
368 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  40 
 
 
342 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  35.97 
 
 
370 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  39.77 
 
 
343 aa  241  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  36.24 
 
 
370 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  39.12 
 
 
343 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  35.97 
 
 
370 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  37.7 
 
 
368 aa  239  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  36.59 
 
 
365 aa  239  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  37.16 
 
 
368 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  36.89 
 
 
368 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  36.89 
 
 
368 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1202  agmatine deiminase  36.19 
 
 
368 aa  236  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  41.5 
 
 
332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  36.89 
 
 
368 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  40.83 
 
 
327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4219  Agmatine deiminase  42.12 
 
 
340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  35.69 
 
 
370 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0144  hypothetical protein  39.71 
 
 
341 aa  231  1e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  34.43 
 
 
375 aa  231  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  40.95 
 
 
355 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2405  agmatine deiminase  35.91 
 
 
365 aa  230  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.761895  normal  0.0406266 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  36.24 
 
 
366 aa  231  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0984  Agmatine deiminase  36.44 
 
 
345 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1013  Agmatine deiminase  36.44 
 
 
345 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.14 
 
 
322 aa  229  5e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6353  Agmatine deiminase  42.15 
 
 
383 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1172  peptidyl-arginine deiminase family protein  35.52 
 
 
325 aa  226  4e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  33.79 
 
 
364 aa  226  6e-58  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  38.86 
 
 
367 aa  226  7e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  37.35 
 
 
340 aa  224  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  37.06 
 
 
341 aa  223  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  41.16 
 
 
386 aa  222  7e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  37.18 
 
 
346 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0973  peptidyl-arginine deiminase family protein  35.35 
 
 
325 aa  220  3e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1027  peptidyl-arginine deiminase family protein  35.05 
 
 
325 aa  218  1e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  36.6 
 
 
350 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0192949 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>