158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1172 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1027  peptidyl-arginine deiminase family protein  98.46 
 
 
325 aa  659    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0973  peptidyl-arginine deiminase family protein  98.15 
 
 
325 aa  656    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1172  peptidyl-arginine deiminase family protein  100 
 
 
325 aa  669    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0897  peptidyl-arginine deiminase family protein  74.46 
 
 
325 aa  499  1e-140  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0842  peptidyl-arginine deiminase family protein  64.09 
 
 
322 aa  424  1e-118  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00603168  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  61.37 
 
 
322 aa  420  1e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0531  peptidyl-arginine deiminase  61.85 
 
 
323 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.709217  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0085  peptidyl-arginine deiminase family protein  57.81 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.360574  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1581  Agmatine deiminase  49.23 
 
 
330 aa  318  1e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.715324  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  42.77 
 
 
342 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  41.59 
 
 
341 aa  285  5e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  42.01 
 
 
351 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  39.77 
 
 
344 aa  276  3e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  38.86 
 
 
341 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0378  peptidyl-arginine deiminase  41.21 
 
 
331 aa  273  3e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.521894  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  39.7 
 
 
342 aa  272  7e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  38.39 
 
 
386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  38.82 
 
 
344 aa  269  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  39.58 
 
 
343 aa  269  4e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  38.87 
 
 
356 aa  265  8e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  39.45 
 
 
340 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  38.81 
 
 
355 aa  263  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0984  Agmatine deiminase  42.09 
 
 
345 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1013  Agmatine deiminase  42.09 
 
 
345 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  36.25 
 
 
367 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0144  hypothetical protein  37.35 
 
 
341 aa  249  5e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  37.5 
 
 
357 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  36.73 
 
 
350 aa  242  6e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  36.89 
 
 
343 aa  242  7e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  36.89 
 
 
343 aa  242  7e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2402  hypothetical protein  35.54 
 
 
376 aa  240  2.9999999999999997e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00162245  decreased coverage  0.000927611 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1601  hypothetical protein  35.42 
 
 
363 aa  231  1e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  38.11 
 
 
349 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1544  agmatine deiminase  34.52 
 
 
363 aa  228  9e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  35.52 
 
 
347 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  37.88 
 
 
339 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1642  Agmatine deiminase  34.82 
 
 
345 aa  219  3.9999999999999997e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00887  peptidyl-arginine deiminase  34.15 
 
 
328 aa  219  7e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0609278  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  36.28 
 
 
348 aa  218  8.999999999999998e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  34.24 
 
 
348 aa  213  3.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  34.55 
 
 
334 aa  210  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  33.43 
 
 
342 aa  210  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  33.84 
 
 
348 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  34.25 
 
 
334 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  33.93 
 
 
351 aa  204  1e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3964  peptidyl-arginine deiminase  30.46 
 
 
350 aa  204  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  33.73 
 
 
347 aa  204  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  32.83 
 
 
352 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  33.13 
 
 
348 aa  204  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  34.55 
 
 
352 aa  204  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  34.63 
 
 
350 aa  202  5e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  33.83 
 
 
365 aa  202  6e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  32.53 
 
 
349 aa  202  6e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  35.52 
 
 
346 aa  202  9e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00673  peptidyl-arginine deiminase  33.02 
 
 
354 aa  199  7e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.027225  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  33.83 
 
 
639 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  33.43 
 
 
353 aa  197  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  33.92 
 
 
640 aa  195  7e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  33.13 
 
 
631 aa  192  7e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  33.85 
 
 
349 aa  189  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  32.02 
 
 
347 aa  188  8e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  33.33 
 
 
349 aa  189  8e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  32.06 
 
 
343 aa  183  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  32.83 
 
 
346 aa  182  9.000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  29.11 
 
 
368 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  29.36 
 
 
365 aa  177  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  31.79 
 
 
364 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  30.63 
 
 
624 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3153  peptidyl-arginine deiminase  29.28 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  29.87 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1873  GGDEF  30.24 
 
 
339 aa  172  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0147389  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  31.02 
 
 
346 aa  172  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  32.63 
 
 
346 aa  172  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  32.62 
 
 
347 aa  172  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  27.95 
 
 
368 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  31.14 
 
 
370 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  30.47 
 
 
369 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  27.59 
 
 
368 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  30.57 
 
 
370 aa  170  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  29.23 
 
 
332 aa  170  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  30.57 
 
 
370 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  28.82 
 
 
368 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  30.57 
 
 
370 aa  169  7e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  30.37 
 
 
370 aa  169  8e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  27.01 
 
 
368 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  30.2 
 
 
370 aa  168  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  29.97 
 
 
370 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  30.29 
 
 
370 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  27.38 
 
 
368 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  26.72 
 
 
368 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  30.29 
 
 
370 aa  165  8e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  29.91 
 
 
370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  26.8 
 
 
368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  26.44 
 
 
368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  29.36 
 
 
365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  28.2 
 
 
367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  29.36 
 
 
371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  29.36 
 
 
371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  29.14 
 
 
355 aa  162  9e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  27.43 
 
 
366 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>