163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1834 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  100 
 
 		 343 aa  703    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  100 
 
 		 343 aa  703    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  54.14 
 
 		 341 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  53.69 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  55.49 
 
 		 344 aa  368  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  56.68 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  54.3 
 
 		 342 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  53.71 
 
 		 344 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  51.6 
 
 		 343 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  51.02 
 
 		 342 aa  363  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  52.38 
 
 		 340 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  53.71 
 
 		 351 aa  353  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  52.37 
 
 		 341 aa  345  6e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2402  hypothetical protein  51.76 
 
 		 376 aa  345  7e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00162245  decreased coverage  0.000927611 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  52.46 
 
 		 350 aa  343  2.9999999999999997e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1013  Agmatine deiminase  47.2 
 
 		 345 aa  332  4e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0984  Agmatine deiminase  47.2 
 
 		 345 aa  332  4e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0144  hypothetical protein  52.07 
 
 		 341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  51.93 
 
 		 365 aa  326  3e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  50.89 
 
 		 355 aa  321  9.999999999999999e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  48.8 
 
 		 367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  48.81 
 
 		 386 aa  315  7e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1601  hypothetical protein  47.04 
 
 		 363 aa  315  9.999999999999999e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1544  agmatine deiminase  47.04 
 
 		 363 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1642  Agmatine deiminase  46.78 
 
 		 345 aa  306  3e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00887  peptidyl-arginine deiminase  48.77 
 
 		 328 aa  292  5e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0609278  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.76 
 
 		 322 aa  255  9e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  42.52 
 
 		 348 aa  252  6e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  38.97 
 
 		 349 aa  251  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0085  peptidyl-arginine deiminase family protein  40.98 
 
 		 348 aa  251  1e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.360574  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  41.76 
 
 		 348 aa  249  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  39.88 
 
 		 350 aa  247  2e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0378  peptidyl-arginine deiminase  36.72 
 
 		 331 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.521894  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1581  Agmatine deiminase  38.76 
 
 		 330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.715324  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  39.66 
 
 		 348 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1172  peptidyl-arginine deiminase family protein  36.89 
 
 		 325 aa  242  7e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  39.54 
 
 		 346 aa  241  2e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  38.71 
 
 		 347 aa  240  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  39.83 
 
 		 352 aa  241  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0897  peptidyl-arginine deiminase family protein  38.6 
 
 		 325 aa  239  5.999999999999999e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  39.77 
 
 		 347 aa  238  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  36.69 
 
 		 339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  38.84 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1027  peptidyl-arginine deiminase family protein  36.89 
 
 		 325 aa  233  5e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0973  peptidyl-arginine deiminase family protein  36.59 
 
 		 325 aa  232  7.000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  39.54 
 
 		 342 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  37.83 
 
 		 352 aa  229  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  37.46 
 
 		 349 aa  229  6e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  37.97 
 
 		 347 aa  227  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  37.46 
 
 		 639 aa  225  7e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  40.53 
 
 		 334 aa  223  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00673  peptidyl-arginine deiminase  38.84 
 
 		 354 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.027225  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  36.36 
 
 		 640 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  40.58 
 
 		 348 aa  219  3.9999999999999997e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0842  peptidyl-arginine deiminase family protein  34.45 
 
 		 322 aa  219  6e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00603168  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  36.26 
 
 		 353 aa  217  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  37.64 
 
 		 343 aa  216  5e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3964  peptidyl-arginine deiminase  37.57 
 
 		 350 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0531  peptidyl-arginine deiminase  35.65 
 
 		 323 aa  215  9.999999999999999e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.709217  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  38.01 
 
 		 631 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  35.48 
 
 		 346 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  38.3 
 
 		 334 aa  209  7e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  37.61 
 
 		 351 aa  208  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  36.89 
 
 		 346 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  35.69 
 
 		 624 aa  203  4e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  34.9 
 
 		 349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  35.21 
 
 		 365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3497  agmatine deiminase  34.01 
 
 		 385 aa  195  9e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  34.35 
 
 		 372 aa  193  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  33.71 
 
 		 367 aa  192  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  33.72 
 
 		 358 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  33.15 
 
 		 367 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1751  agmatine deiminase  33.43 
 
 		 385 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3209  agmatine deiminase  33.43 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  33.61 
 
 		 365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  33.61 
 
 		 371 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  33.61 
 
 		 371 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3505  hypothetical protein  33.43 
 
 		 385 aa  189  7e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  33.06 
 
 		 370 aa  188  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1873  GGDEF  32.56 
 
 		 339 aa  185  9e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0147389  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  32.69 
 
 		 370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  33.61 
 
 		 370 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  33.24 
 
 		 370 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  32.97 
 
 		 370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  32.96 
 
 		 370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  32.96 
 
 		 355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  32.42 
 
 		 370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  32.97 
 
 		 370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  31.67 
 
 		 368 aa  183  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  32.23 
 
 		 368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  32.33 
 
 		 368 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  32.78 
 
 		 368 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  32.78 
 
 		 368 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  32.5 
 
 		 368 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  32.78 
 
 		 368 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2450  agmatine deiminase  30.52 
 
 		 393 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  32.33 
 
 		 368 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  32.51 
 
 		 370 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  32.76 
 
 		 370 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  32.51 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>