163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1581 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  100 
 
 
355 aa  721    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  55.2 
 
 
356 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  54.93 
 
 
351 aa  378  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  55.36 
 
 
344 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  52.49 
 
 
342 aa  358  7e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  53.74 
 
 
344 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  51.16 
 
 
341 aa  352  4e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  52.35 
 
 
343 aa  350  2e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  52.06 
 
 
350 aa  343  2e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  52.33 
 
 
386 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  52.17 
 
 
342 aa  331  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  48.37 
 
 
367 aa  330  2e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2402  hypothetical protein  50.58 
 
 
376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00162245  decreased coverage  0.000927611 
 
 
-
 
NC_002950  PG0144  hypothetical protein  49.29 
 
 
341 aa  324  1e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  49.42 
 
 
341 aa  323  3e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  50.89 
 
 
343 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  49.13 
 
 
340 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  50.89 
 
 
343 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0984  Agmatine deiminase  47.34 
 
 
345 aa  319  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1013  Agmatine deiminase  47.34 
 
 
345 aa  319  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1601  hypothetical protein  48.99 
 
 
363 aa  317  3e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1642  Agmatine deiminase  50.44 
 
 
345 aa  314  9.999999999999999e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0378  peptidyl-arginine deiminase  43.57 
 
 
331 aa  314  9.999999999999999e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.521894  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  47.79 
 
 
357 aa  312  4.999999999999999e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1544  agmatine deiminase  48.41 
 
 
363 aa  311  7.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00887  peptidyl-arginine deiminase  48.78 
 
 
328 aa  296  3e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0609278  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  49.42 
 
 
365 aa  291  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0085  peptidyl-arginine deiminase family protein  43.94 
 
 
348 aa  289  5.0000000000000004e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.360574  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.64 
 
 
322 aa  286  2.9999999999999996e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0842  peptidyl-arginine deiminase family protein  38.74 
 
 
322 aa  273  3e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00603168  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1172  peptidyl-arginine deiminase family protein  38.81 
 
 
325 aa  263  2e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0897  peptidyl-arginine deiminase family protein  39.16 
 
 
325 aa  259  3e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1581  Agmatine deiminase  40.29 
 
 
330 aa  259  6e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.715324  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  42.6 
 
 
342 aa  257  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1027  peptidyl-arginine deiminase family protein  38.81 
 
 
325 aa  257  3e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0531  peptidyl-arginine deiminase  38.87 
 
 
323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.709217  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0973  peptidyl-arginine deiminase family protein  38.21 
 
 
325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  40.41 
 
 
351 aa  247  2e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  40.52 
 
 
343 aa  242  9e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  41.08 
 
 
348 aa  239  5e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  36.42 
 
 
339 aa  237  2e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  41.59 
 
 
334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  39.88 
 
 
347 aa  233  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  41.59 
 
 
348 aa  233  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  39.59 
 
 
350 aa  232  6e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  39.3 
 
 
348 aa  232  8.000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3964  peptidyl-arginine deiminase  37.68 
 
 
350 aa  230  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  38.39 
 
 
349 aa  229  6e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  39.53 
 
 
352 aa  229  8e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  37.46 
 
 
352 aa  228  9e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  40.95 
 
 
347 aa  228  9e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  38.29 
 
 
353 aa  226  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  40.52 
 
 
348 aa  226  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00673  peptidyl-arginine deiminase  37.18 
 
 
354 aa  224  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.027225  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  35.86 
 
 
346 aa  224  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  39.36 
 
 
334 aa  223  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  38.26 
 
 
349 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  38.12 
 
 
346 aa  220  3e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  36.98 
 
 
639 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  37.17 
 
 
347 aa  216  5e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  35.52 
 
 
640 aa  215  9e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  36.31 
 
 
349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  36.98 
 
 
346 aa  209  7e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1873  GGDEF  33.24 
 
 
339 aa  208  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0147389  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  36.59 
 
 
372 aa  206  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  35.12 
 
 
624 aa  205  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  36 
 
 
365 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  38.28 
 
 
332 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  33.8 
 
 
369 aa  203  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  34.12 
 
 
349 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  33.61 
 
 
368 aa  199  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  30.92 
 
 
366 aa  194  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  33.89 
 
 
368 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  36.84 
 
 
327 aa  193  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  32.96 
 
 
368 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  34.17 
 
 
368 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  33.33 
 
 
368 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  33.9 
 
 
368 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  34.07 
 
 
369 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  34.23 
 
 
631 aa  191  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  33.62 
 
 
368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  33.99 
 
 
367 aa  189  8e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  33.15 
 
 
371 aa  189  8e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  33.15 
 
 
371 aa  189  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  33.15 
 
 
365 aa  189  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  33.43 
 
 
367 aa  186  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  33.61 
 
 
368 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  32.68 
 
 
370 aa  185  8e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  32.68 
 
 
370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  32.68 
 
 
370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  33.05 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  35.1 
 
 
375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  31.44 
 
 
370 aa  182  6e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6353  Agmatine deiminase  38.26 
 
 
383 aa  182  7e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  30.73 
 
 
364 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  32.68 
 
 
370 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  33.71 
 
 
365 aa  180  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  32.41 
 
 
368 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  33.63 
 
 
358 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2450  agmatine deiminase  32.11 
 
 
393 aa  179  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>