160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2455 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  100 
 
 
334 aa  685    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  65.2 
 
 
343 aa  453  1.0000000000000001e-126  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  62.54 
 
 
348 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  47.01 
 
 
348 aa  311  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  42.34 
 
 
339 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  47.01 
 
 
348 aa  302  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  45.29 
 
 
346 aa  294  2e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  44.61 
 
 
342 aa  294  2e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  44.25 
 
 
352 aa  291  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  43.53 
 
 
349 aa  290  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  43.84 
 
 
349 aa  288  6e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  45.54 
 
 
334 aa  288  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  41.84 
 
 
358 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  45.43 
 
 
347 aa  286  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  43.95 
 
 
348 aa  286  4e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  44.38 
 
 
347 aa  286  4e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  43.28 
 
 
624 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  44.64 
 
 
347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  44.05 
 
 
631 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  42.94 
 
 
350 aa  280  3e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  43.07 
 
 
349 aa  280  3e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  41.21 
 
 
365 aa  279  6e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  43.41 
 
 
640 aa  277  2e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  43.53 
 
 
370 aa  276  4e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  41.32 
 
 
639 aa  268  1e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  40.65 
 
 
352 aa  266  5e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  41.49 
 
 
346 aa  264  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  43.86 
 
 
356 aa  263  4e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  39.82 
 
 
346 aa  256  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  40.6 
 
 
349 aa  256  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  38.97 
 
 
347 aa  252  5.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  40.35 
 
 
353 aa  251  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  38.97 
 
 
346 aa  248  8e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  42.23 
 
 
341 aa  246  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6353  Agmatine deiminase  40.35 
 
 
383 aa  244  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  41 
 
 
344 aa  243  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  38.94 
 
 
351 aa  243  3.9999999999999997e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  39.94 
 
 
340 aa  239  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  37.96 
 
 
372 aa  237  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  35.43 
 
 
365 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  35.43 
 
 
371 aa  236  5.0000000000000005e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  35.43 
 
 
371 aa  236  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  39.46 
 
 
332 aa  236  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  36.39 
 
 
370 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0369  peptidyl-arginine deiminase  38.81 
 
 
339 aa  233  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  40.48 
 
 
344 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  35.98 
 
 
371 aa  233  5e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  36.26 
 
 
368 aa  232  6e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4697  agmatine deiminase  41.46 
 
 
336 aa  232  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.399563  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  35.11 
 
 
369 aa  232  7.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  39.29 
 
 
351 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  41.39 
 
 
327 aa  229  4e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  35.04 
 
 
368 aa  229  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  35.92 
 
 
369 aa  229  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  38.82 
 
 
342 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  39.07 
 
 
386 aa  228  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  37.01 
 
 
350 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  34.67 
 
 
367 aa  226  6e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  39.36 
 
 
355 aa  223  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  40.53 
 
 
343 aa  223  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  36.99 
 
 
350 aa  223  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  37.22 
 
 
374 aa  223  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  40.53 
 
 
343 aa  223  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4219  Agmatine deiminase  41.49 
 
 
340 aa  222  6e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  35.24 
 
 
355 aa  222  6e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  34.38 
 
 
367 aa  222  8e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4759  peptidyl-arginine deiminase  38.97 
 
 
370 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675137  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2402  hypothetical protein  37.43 
 
 
376 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00162245  decreased coverage  0.000927611 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  35.9 
 
 
368 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  36.29 
 
 
368 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  35.9 
 
 
368 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  35.21 
 
 
346 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1642  Agmatine deiminase  37.28 
 
 
345 aa  219  3.9999999999999997e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  38.3 
 
 
343 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  37.5 
 
 
367 aa  219  5e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  40.41 
 
 
365 aa  219  5e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  35.61 
 
 
368 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  35.61 
 
 
368 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  35.8 
 
 
368 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0172  Agmatine deiminase  37.24 
 
 
374 aa  216  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  36.26 
 
 
368 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  37.57 
 
 
357 aa  216  4e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  36.03 
 
 
365 aa  216  4e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4756  peptidyl-arginine deiminase  38.86 
 
 
345 aa  216  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322594  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3810  agmatine deiminase  36.8 
 
 
365 aa  216  5e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.387298  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  33.24 
 
 
366 aa  215  7e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  38.17 
 
 
341 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  31.91 
 
 
364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  36.18 
 
 
368 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0897  peptidyl-arginine deiminase family protein  36.78 
 
 
325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0085  peptidyl-arginine deiminase family protein  37.5 
 
 
348 aa  210  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.360574  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.85 
 
 
322 aa  210  2e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1601  hypothetical protein  35.21 
 
 
363 aa  210  3e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3209  agmatine deiminase  33.83 
 
 
387 aa  209  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48490  putative peptidylarginine deiminase  36.12 
 
 
346 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000276698  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1544  agmatine deiminase  34.91 
 
 
363 aa  207  1e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1172  peptidyl-arginine deiminase family protein  34.25 
 
 
325 aa  207  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0842  peptidyl-arginine deiminase family protein  32.82 
 
 
322 aa  206  5e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00603168  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0144  hypothetical protein  37.94 
 
 
341 aa  205  7e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3505  hypothetical protein  34.32 
 
 
385 aa  205  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>