159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0834 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  100 
 
 		 365 aa  759    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  100 
 
 		 371 aa  769    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  100 
 
 		 371 aa  769    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  76.16 
 
 		 367 aa  585  1e-166  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  76.62 
 
 		 367 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  76.82 
 
 		 365 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3810  agmatine deiminase  75.98 
 
 		 365 aa  556  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.387298  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  69.02 
 
 		 375 aa  525  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  70.19 
 
 		 370 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  69.92 
 
 		 370 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  69.08 
 
 		 370 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  70.19 
 
 		 370 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  69.64 
 
 		 370 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  69.36 
 
 		 370 aa  513  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  68.8 
 
 		 370 aa  510  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  68.8 
 
 		 370 aa  510  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  68.52 
 
 		 370 aa  510  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  67.41 
 
 		 370 aa  499  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  56.02 
 
 		 369 aa  418  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  56.42 
 
 		 368 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  56.82 
 
 		 369 aa  415  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  56.32 
 
 		 372 aa  414  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  55.37 
 
 		 368 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  55.96 
 
 		 368 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  55.37 
 
 		 368 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  55.1 
 
 		 368 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  55.52 
 
 		 368 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  55.25 
 
 		 368 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  52.45 
 
 		 370 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  54.82 
 
 		 368 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  57.26 
 
 		 368 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  55.25 
 
 		 368 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  51.25 
 
 		 364 aa  391  1e-107  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  50.4 
 
 		 371 aa  375  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  55.77 
 
 		 374 aa  372  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  46.93 
 
 		 366 aa  345  1e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1202  agmatine deiminase  46.24 
 
 		 368 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2405  agmatine deiminase  45.81 
 
 		 365 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.761895  normal  0.0406266 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  48.85 
 
 		 355 aa  333  2e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2154  peptidyl-arginine deiminase  44.66 
 
 		 371 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1849  agmatine deiminase  44.85 
 
 		 369 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552976  decreased coverage  0.00228426 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1189  peptidyl-arginine deiminase  45.79 
 
 		 373 aa  317  2e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0678  agmatine deiminase  45.21 
 
 		 386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.421408 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2192  agmatine deiminase  42.7 
 
 		 373 aa  304  2.0000000000000002e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  41.39 
 
 		 347 aa  288  8e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  41.67 
 
 		 346 aa  287  2e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36398  predicted protein  42.02 
 
 		 386 aa  269  5.9999999999999995e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  41.24 
 
 		 346 aa  258  9e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  36.07 
 
 		 347 aa  248  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4219  Agmatine deiminase  40.22 
 
 		 340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  35.91 
 
 		 348 aa  242  7e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  36.74 
 
 		 348 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  38.19 
 
 		 370 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  35.43 
 
 		 334 aa  236  5.0000000000000005e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  36.91 
 
 		 342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  39.17 
 
 		 350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  35.54 
 
 		 348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  37.02 
 
 		 640 aa  233  3e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  34.81 
 
 		 346 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  34.53 
 
 		 350 aa  232  8.000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  39.22 
 
 		 346 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  36.74 
 
 		 349 aa  232  1e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  34.81 
 
 		 348 aa  226  4e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  34.16 
 
 		 624 aa  225  9e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  35.18 
 
 		 352 aa  225  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  34.89 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  34.25 
 
 		 631 aa  224  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  34.43 
 
 		 353 aa  224  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  33.7 
 
 		 347 aa  222  7e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  35.49 
 
 		 334 aa  222  9e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  33.05 
 
 		 339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  35.81 
 
 		 352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  33.88 
 
 		 347 aa  219  5e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  33.33 
 
 		 349 aa  219  5e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48490  putative peptidylarginine deiminase  39.39 
 
 		 346 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000276698  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  38.24 
 
 		 351 aa  217  2e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  34.15 
 
 		 349 aa  215  9e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  35.39 
 
 		 343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  34.25 
 
 		 639 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  34.5 
 
 		 358 aa  212  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  35.15 
 
 		 356 aa  210  4e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0681  Agmatine deiminase  34.82 
 
 		 348 aa  206  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  31.66 
 
 		 365 aa  205  9e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0759  peptidyl-arginine deiminase  37.08 
 
 		 336 aa  202  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.451964  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  34.75 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0172  Agmatine deiminase  36.57 
 
 		 374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  32.23 
 
 		 350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  31.77 
 
 		 346 aa  196  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0369  peptidyl-arginine deiminase  33.33 
 
 		 339 aa  195  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0059  Agmatine deiminase  34.06 
 
 		 375 aa  194  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4756  peptidyl-arginine deiminase  32.3 
 
 		 345 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322594  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  32.12 
 
 		 344 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  33.61 
 
 		 343 aa  190  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  33.61 
 
 		 343 aa  190  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  32.49 
 
 		 344 aa  189  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  33.15 
 
 		 355 aa  189  8e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3153  peptidyl-arginine deiminase  34.27 
 
 		 330 aa  186  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4759  peptidyl-arginine deiminase  36.68 
 
 		 370 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675137  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  36 
 
 		 327 aa  186  6e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0833  Agmatine deiminase  34.93 
 
 		 339 aa  186  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>