161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0034 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  100 
 
 		 343 aa  694    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  65.2 
 
 		 334 aa  453  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  57.27 
 
 		 348 aa  387  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  42.35 
 
 		 339 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  46.04 
 
 		 348 aa  288  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  42.15 
 
 		 358 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  45.45 
 
 		 348 aa  280  3e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  40.87 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  43.99 
 
 		 347 aa  277  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  45 
 
 		 342 aa  276  4e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  43.99 
 
 		 640 aa  273  5.000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  41.35 
 
 		 349 aa  272  6e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  42.94 
 
 		 347 aa  269  4e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  41.57 
 
 		 350 aa  267  2e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  42.44 
 
 		 347 aa  265  8e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  41.28 
 
 		 352 aa  265  8.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  40.35 
 
 		 624 aa  265  1e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  39.71 
 
 		 349 aa  264  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  41.64 
 
 		 639 aa  259  3e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  40.41 
 
 		 352 aa  259  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  40.87 
 
 		 348 aa  260  3e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  40.59 
 
 		 346 aa  258  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  39.89 
 
 		 370 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  39.48 
 
 		 349 aa  251  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  41.69 
 
 		 631 aa  251  1e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  41.06 
 
 		 349 aa  245  8e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  38.48 
 
 		 365 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  38.57 
 
 		 346 aa  243  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  38.68 
 
 		 353 aa  242  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  40.52 
 
 		 355 aa  242  7.999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  39.28 
 
 		 372 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  38.62 
 
 		 344 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  39.07 
 
 		 334 aa  231  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  41.64 
 
 		 332 aa  230  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  36.49 
 
 		 368 aa  228  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  40.35 
 
 		 356 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  36.42 
 
 		 346 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  43.2 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  35.75 
 
 		 368 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  40.8 
 
 		 365 aa  223  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  36.69 
 
 		 370 aa  222  8e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6353  Agmatine deiminase  41.46 
 
 		 383 aa  222  9e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4697  agmatine deiminase  41.84 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.399563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  36.13 
 
 		 357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  35.38 
 
 		 347 aa  220  3e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  35.67 
 
 		 346 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  37.36 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  35.85 
 
 		 369 aa  217  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  35.96 
 
 		 350 aa  216  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  37.61 
 
 		 351 aa  216  5e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  37.64 
 
 		 343 aa  216  5e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  34.54 
 
 		 369 aa  216  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  37.64 
 
 		 343 aa  216  5e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  37.68 
 
 		 351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  38.62 
 
 		 386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  35.39 
 
 		 365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  35.39 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  35.39 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  36.62 
 
 		 350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  38 
 
 		 344 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  37.33 
 
 		 368 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  35.56 
 
 		 368 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4756  peptidyl-arginine deiminase  37.46 
 
 		 345 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322594  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0369  peptidyl-arginine deiminase  38.24 
 
 		 339 aa  211  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  33.99 
 
 		 364 aa  209  8e-53  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48490  putative peptidylarginine deiminase  37.72 
 
 		 346 aa  209  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000276698  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  35.44 
 
 		 371 aa  207  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  34.17 
 
 		 355 aa  208  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  34.55 
 
 		 367 aa  207  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4219  Agmatine deiminase  40.82 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0172  Agmatine deiminase  37.9 
 
 		 374 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  36.03 
 
 		 368 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0059  Agmatine deiminase  37.39 
 
 		 375 aa  206  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  37.5 
 
 		 374 aa  206  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  34.59 
 
 		 341 aa  205  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  34.63 
 
 		 368 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  34.17 
 
 		 367 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  34.9 
 
 		 368 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  34.63 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1642  Agmatine deiminase  37.46 
 
 		 345 aa  204  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  35.75 
 
 		 375 aa  203  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4759  peptidyl-arginine deiminase  38.76 
 
 		 370 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675137  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  34.44 
 
 		 368 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  34.07 
 
 		 368 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0144  hypothetical protein  37.43 
 
 		 341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  33.82 
 
 		 367 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00887  peptidyl-arginine deiminase  39.4 
 
 		 328 aa  197  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0609278  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  35.26 
 
 		 342 aa  196  6e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  33.43 
 
 		 370 aa  196  7e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  33.24 
 
 		 370 aa  196  7e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  32.96 
 
 		 370 aa  195  9e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2402  hypothetical protein  33.53 
 
 		 376 aa  194  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00162245  decreased coverage  0.000927611 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  31.84 
 
 		 366 aa  195  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2482  agmatine deiminase  34.02 
 
 		 375 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1601  hypothetical protein  35.34 
 
 		 363 aa  195  1e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  34.08 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  33.24 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  35.45 
 
 		 343 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  33.52 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  33.24 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>