161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2072 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2072  Agmatine deiminase  100 
 
 		 364 aa  728    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1048  agmatine deiminase  47.11 
 
 		 368 aa  311  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.649771  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0172  Agmatine deiminase  44.18 
 
 		 374 aa  288  7e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2482  agmatine deiminase  42.48 
 
 		 375 aa  277  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2373  twin-arginine translocation pathway signal  39.36 
 
 		 372 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0189025 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4759  peptidyl-arginine deiminase  46.25 
 
 		 370 aa  269  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675137  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4626  agmatine deiminase  38.87 
 
 		 369 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48450  putative peptidyl-arginine deiminase  38.67 
 
 		 372 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000979902  normal  0.148444 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  40.24 
 
 		 350 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  38.46 
 
 		 346 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48490  putative peptidylarginine deiminase  40.36 
 
 		 346 aa  249  7e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000276698  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2561  Agmatine deiminase  42.77 
 
 		 377 aa  249  7e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  41.42 
 
 		 370 aa  237  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  40.48 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  36.61 
 
 		 346 aa  230  3e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  36.61 
 
 		 347 aa  230  3e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4756  peptidyl-arginine deiminase  36.5 
 
 		 345 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322594  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6169  Agmatine deiminase  39.7 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0059  Agmatine deiminase  36.39 
 
 		 375 aa  207  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  36.97 
 
 		 334 aa  203  5e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  37.03 
 
 		 372 aa  202  7e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  38.42 
 
 		 369 aa  200  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  36.65 
 
 		 370 aa  199  5e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  35.21 
 
 		 369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0833  Agmatine deiminase  39.53 
 
 		 339 aa  196  7e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  35.88 
 
 		 368 aa  195  9e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  36.62 
 
 		 368 aa  195  9e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  34.81 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  36.84 
 
 		 341 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  35.99 
 
 		 343 aa  191  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  32.69 
 
 		 358 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  35.14 
 
 		 367 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  35.48 
 
 		 348 aa  188  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  35.78 
 
 		 640 aa  188  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3505  hypothetical protein  34.39 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  34.29 
 
 		 367 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3209  agmatine deiminase  35.96 
 
 		 387 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1751  agmatine deiminase  34.13 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  36.99 
 
 		 347 aa  186  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  33.71 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  34.28 
 
 		 375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3497  agmatine deiminase  33.33 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0681  Agmatine deiminase  35.07 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0759  peptidyl-arginine deiminase  36.21 
 
 		 336 aa  184  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.451964  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  35.03 
 
 		 368 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  36.6 
 
 		 352 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  37.46 
 
 		 368 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3810  agmatine deiminase  34.26 
 
 		 365 aa  182  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.387298  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  34.46 
 
 		 368 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  36.76 
 
 		 348 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2450  agmatine deiminase  34.8 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  34.46 
 
 		 368 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  33.06 
 
 		 365 aa  180  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  33.9 
 
 		 368 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  36.01 
 
 		 334 aa  180  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  32.68 
 
 		 366 aa  179  4.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  34.46 
 
 		 365 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  33.06 
 
 		 371 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  33.06 
 
 		 371 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  33.9 
 
 		 370 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  33.62 
 
 		 370 aa  179  7e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  35.59 
 
 		 624 aa  179  7e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  33.53 
 
 		 355 aa  179  9e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  34.29 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  34.81 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0369  peptidyl-arginine deiminase  34.14 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  35.28 
 
 		 348 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  35.06 
 
 		 350 aa  177  4e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  33.05 
 
 		 370 aa  176  8e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  33.05 
 
 		 348 aa  175  9e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  32.29 
 
 		 370 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  32.76 
 
 		 370 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  31.16 
 
 		 631 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  32.57 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  33.73 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  32.3 
 
 		 370 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  32.19 
 
 		 370 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  34.22 
 
 		 340 aa  173  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1849  agmatine deiminase  32.03 
 
 		 369 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552976  decreased coverage  0.00228426 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  33.43 
 
 		 347 aa  172  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  32.19 
 
 		 370 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  32.19 
 
 		 370 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  33.13 
 
 		 367 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  34.41 
 
 		 639 aa  170  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  32.76 
 
 		 355 aa  170  4e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4219  Agmatine deiminase  35.57 
 
 		 340 aa  170  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  32.18 
 
 		 349 aa  169  5e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2192  agmatine deiminase  31.94 
 
 		 373 aa  169  6e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  34.49 
 
 		 343 aa  169  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  32.27 
 
 		 341 aa  168  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  35.23 
 
 		 374 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  34.41 
 
 		 344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  34.73 
 
 		 371 aa  167  2.9999999999999998e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  34.4 
 
 		 342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3153  peptidyl-arginine deiminase  35.99 
 
 		 330 aa  166  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  33.14 
 
 		 349 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  31.05 
 
 		 365 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2154  peptidyl-arginine deiminase  31.37 
 
 		 371 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  33.24 
 
 		 350 aa  166  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  33.05 
 
 		 368 aa  165  9e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>