164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4626 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4626  agmatine deiminase  100 
 
 		 369 aa  758    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2373  twin-arginine translocation pathway signal  70.7 
 
 		 372 aa  544  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0189025 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2482  agmatine deiminase  69.6 
 
 		 375 aa  518  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48450  putative peptidyl-arginine deiminase  59.46 
 
 		 372 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000979902  normal  0.148444 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2561  Agmatine deiminase  60.24 
 
 		 377 aa  400  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0172  Agmatine deiminase  52.41 
 
 		 374 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4759  peptidyl-arginine deiminase  53.35 
 
 		 370 aa  331  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675137  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1048  agmatine deiminase  43.77 
 
 		 368 aa  277  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.649771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2072  Agmatine deiminase  39.23 
 
 		 364 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  40.35 
 
 		 346 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  37.04 
 
 		 368 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  39.18 
 
 		 350 aa  223  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  37.89 
 
 		 372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6169  Agmatine deiminase  40.06 
 
 		 331 aa  215  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  35 
 
 		 347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  34.71 
 
 		 346 aa  213  5.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  35.9 
 
 		 368 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  35.9 
 
 		 368 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0681  Agmatine deiminase  37.71 
 
 		 348 aa  208  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  35.61 
 
 		 368 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  35.61 
 
 		 368 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0759  peptidyl-arginine deiminase  38.42 
 
 		 336 aa  206  6e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.451964  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  36.47 
 
 		 368 aa  206  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  33.62 
 
 		 368 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  36.07 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  35.9 
 
 		 370 aa  203  4e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  35.13 
 
 		 368 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48490  putative peptidylarginine deiminase  38.3 
 
 		 346 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000276698  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  34.56 
 
 		 368 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  37.04 
 
 		 369 aa  196  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0059  Agmatine deiminase  37.79 
 
 		 375 aa  196  7e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  34.4 
 
 		 358 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  34.08 
 
 		 368 aa  193  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2192  agmatine deiminase  32.29 
 
 		 373 aa  193  4e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4756  peptidyl-arginine deiminase  36.09 
 
 		 345 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322594  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  33.33 
 
 		 346 aa  192  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0833  Agmatine deiminase  37.9 
 
 		 339 aa  192  6e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  32.96 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  30.93 
 
 		 334 aa  186  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3497  agmatine deiminase  30.61 
 
 		 385 aa  186  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  31.81 
 
 		 366 aa  186  8e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4760  peptidyl-arginine deiminase  33.63 
 
 		 509 aa  185  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  33.43 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  32.94 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  35.71 
 
 		 339 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  32 
 
 		 369 aa  183  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3209  agmatine deiminase  30.9 
 
 		 387 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3505  hypothetical protein  30.32 
 
 		 385 aa  182  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1751  agmatine deiminase  30.03 
 
 		 385 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  33.81 
 
 		 367 aa  179  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  35.58 
 
 		 365 aa  179  5.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  34.69 
 
 		 624 aa  179  8e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  33.62 
 
 		 367 aa  178  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2450  agmatine deiminase  30.64 
 
 		 393 aa  177  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  32.55 
 
 		 342 aa  176  9e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  32.1 
 
 		 347 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  32.85 
 
 		 348 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1202  agmatine deiminase  30.55 
 
 		 368 aa  172  9e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  32.58 
 
 		 370 aa  171  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  32.58 
 
 		 370 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  34.2 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  30.2 
 
 		 370 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  31.16 
 
 		 370 aa  170  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  30.47 
 
 		 348 aa  170  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  31.16 
 
 		 370 aa  170  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  31.43 
 
 		 365 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  30.88 
 
 		 370 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  32.48 
 
 		 371 aa  169  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  32.48 
 
 		 371 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  29.91 
 
 		 370 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  30.95 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  30.31 
 
 		 348 aa  168  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  33.04 
 
 		 348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  30.2 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  30.52 
 
 		 334 aa  166  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2405  agmatine deiminase  30.55 
 
 		 365 aa  166  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.761895  normal  0.0406266 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  29.91 
 
 		 370 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  34.31 
 
 		 374 aa  166  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  32.38 
 
 		 347 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  36.43 
 
 		 349 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1849  agmatine deiminase  31.99 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552976  decreased coverage  0.00228426 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0678  agmatine deiminase  31.08 
 
 		 386 aa  162  6e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.421408 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0369  peptidyl-arginine deiminase  33.53 
 
 		 339 aa  162  6e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2154  peptidyl-arginine deiminase  32.67 
 
 		 371 aa  162  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36398  predicted protein  30.26 
 
 		 386 aa  160  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  33.73 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  31.23 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  36.17 
 
 		 365 aa  160  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  30.99 
 
 		 351 aa  159  6e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  37.69 
 
 		 639 aa  159  7e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  30.37 
 
 		 357 aa  159  9e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0984  Agmatine deiminase  32.37 
 
 		 345 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  31.76 
 
 		 351 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4219  Agmatine deiminase  33.83 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1013  Agmatine deiminase  32.37 
 
 		 345 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.28 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1189  peptidyl-arginine deiminase  31.12 
 
 		 373 aa  157  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  32.26 
 
 		 355 aa  157  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3810  agmatine deiminase  36.17 
 
 		 365 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.387298  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  30 
 
 		 375 aa  156  6e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.415458 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>