157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_36398 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_36398  predicted protein  100 
 
 
386 aa  801    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  46.3 
 
 
368 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  45.62 
 
 
368 aa  295  8e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  44.06 
 
 
368 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  41.45 
 
 
364 aa  293  4e-78  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  43.57 
 
 
368 aa  292  8e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  45 
 
 
372 aa  288  8e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  42.56 
 
 
368 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  42.78 
 
 
368 aa  285  8e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  40.56 
 
 
368 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  40.56 
 
 
368 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  40.56 
 
 
368 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  40.61 
 
 
368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  42.13 
 
 
370 aa  278  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  43.73 
 
 
369 aa  275  8e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  40.48 
 
 
370 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  40.11 
 
 
370 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  40.11 
 
 
370 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  40.16 
 
 
375 aa  271  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  39.68 
 
 
370 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  42.02 
 
 
365 aa  269  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  42.02 
 
 
371 aa  269  5.9999999999999995e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  42.02 
 
 
371 aa  269  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  39.32 
 
 
370 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  40.16 
 
 
370 aa  267  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  38.54 
 
 
370 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  39.95 
 
 
370 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  41.91 
 
 
371 aa  266  2.9999999999999995e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  39.31 
 
 
370 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  40.96 
 
 
367 aa  266  5e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  41.16 
 
 
365 aa  266  5e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  38.79 
 
 
370 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3810  agmatine deiminase  40.68 
 
 
365 aa  261  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.387298  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  40.96 
 
 
367 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  40.64 
 
 
374 aa  258  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  39.31 
 
 
366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  39.69 
 
 
369 aa  250  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  38.24 
 
 
347 aa  238  2e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  39.27 
 
 
355 aa  237  3e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2154  peptidyl-arginine deiminase  37.74 
 
 
371 aa  236  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  37.79 
 
 
346 aa  235  8e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1189  peptidyl-arginine deiminase  38.27 
 
 
373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0678  agmatine deiminase  37.53 
 
 
386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.421408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1849  agmatine deiminase  37.74 
 
 
369 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552976  decreased coverage  0.00228426 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1202  agmatine deiminase  35.66 
 
 
368 aa  229  6e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2405  agmatine deiminase  35.22 
 
 
365 aa  226  7e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.761895  normal  0.0406266 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2192  agmatine deiminase  34.22 
 
 
373 aa  222  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  37.27 
 
 
346 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  35.68 
 
 
352 aa  206  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  32.98 
 
 
339 aa  202  7e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  36.34 
 
 
624 aa  202  9e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  34.66 
 
 
347 aa  199  7e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  33.95 
 
 
348 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  34.47 
 
 
348 aa  196  7e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  35.99 
 
 
370 aa  193  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  34.47 
 
 
350 aa  193  5e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  34.83 
 
 
631 aa  193  5e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  35.6 
 
 
640 aa  192  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  34.03 
 
 
344 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  33.08 
 
 
358 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  33.86 
 
 
347 aa  191  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  32.49 
 
 
349 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  35.23 
 
 
639 aa  190  4e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4219  Agmatine deiminase  34.2 
 
 
340 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  33.85 
 
 
349 aa  187  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  36.03 
 
 
350 aa  186  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  35.14 
 
 
346 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0681  Agmatine deiminase  35.77 
 
 
348 aa  186  6e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  32.2 
 
 
346 aa  186  8e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  33.59 
 
 
332 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  34.45 
 
 
348 aa  184  3e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0059  Agmatine deiminase  36.91 
 
 
375 aa  182  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  32.91 
 
 
365 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  33.33 
 
 
342 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0172  Agmatine deiminase  34.74 
 
 
374 aa  181  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  32.9 
 
 
349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  32.11 
 
 
341 aa  176  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  31.91 
 
 
348 aa  176  8e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  31.94 
 
 
352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  32.09 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  30.77 
 
 
334 aa  174  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  31.68 
 
 
342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  31.35 
 
 
356 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48490  putative peptidylarginine deiminase  35.7 
 
 
346 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000276698  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  31.43 
 
 
350 aa  170  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  31.25 
 
 
343 aa  169  9e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  31.41 
 
 
344 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  33.68 
 
 
367 aa  168  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  34.81 
 
 
327 aa  167  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  31.94 
 
 
347 aa  166  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  29.18 
 
 
353 aa  166  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2402  hypothetical protein  31.54 
 
 
376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00162245  decreased coverage  0.000927611 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  33.16 
 
 
365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  32.36 
 
 
342 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  32.54 
 
 
351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4626  agmatine deiminase  30.26 
 
 
369 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192221  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  30.47 
 
 
351 aa  160  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  31.56 
 
 
343 aa  159  5e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  31.32 
 
 
341 aa  158  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  30.24 
 
 
355 aa  157  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>