158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2402 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2402  hypothetical protein  100 
 
 
376 aa  766    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00162245  decreased coverage  0.000927611 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  61.83 
 
 
351 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  62.31 
 
 
344 aa  436  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  57.86 
 
 
341 aa  427  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  59.35 
 
 
340 aa  414  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  58.11 
 
 
342 aa  409  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  55.81 
 
 
343 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  54.09 
 
 
342 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  57.23 
 
 
341 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  55.13 
 
 
344 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  53.8 
 
 
356 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  51.01 
 
 
350 aa  363  3e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  50.87 
 
 
357 aa  352  4e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  51.76 
 
 
343 aa  348  9e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  51.76 
 
 
343 aa  348  9e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0984  Agmatine deiminase  49.56 
 
 
345 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1013  Agmatine deiminase  49.56 
 
 
345 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0144  hypothetical protein  49.27 
 
 
341 aa  344  1e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1642  Agmatine deiminase  52.05 
 
 
345 aa  342  5.999999999999999e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  49.71 
 
 
367 aa  341  1e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1601  hypothetical protein  49.42 
 
 
363 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  50.58 
 
 
355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1544  agmatine deiminase  48.83 
 
 
363 aa  333  2e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00887  peptidyl-arginine deiminase  47.88 
 
 
328 aa  306  4.0000000000000004e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0609278  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  46.63 
 
 
386 aa  297  2e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0378  peptidyl-arginine deiminase  39.76 
 
 
331 aa  296  4e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.521894  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  46.04 
 
 
365 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.81 
 
 
322 aa  281  2e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1581  Agmatine deiminase  41.44 
 
 
330 aa  272  6e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.715324  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0085  peptidyl-arginine deiminase family protein  41.67 
 
 
348 aa  260  3e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.360574  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0842  peptidyl-arginine deiminase family protein  36.11 
 
 
322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00603168  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0897  peptidyl-arginine deiminase family protein  38.11 
 
 
325 aa  249  5e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1172  peptidyl-arginine deiminase family protein  35.54 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0531  peptidyl-arginine deiminase  37.5 
 
 
323 aa  241  2e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.709217  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00673  peptidyl-arginine deiminase  39.24 
 
 
354 aa  238  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.027225  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3964  peptidyl-arginine deiminase  38.55 
 
 
350 aa  236  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1027  peptidyl-arginine deiminase family protein  35.54 
 
 
325 aa  233  6e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0973  peptidyl-arginine deiminase family protein  34.94 
 
 
325 aa  229  4e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  36.98 
 
 
334 aa  226  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  34.77 
 
 
346 aa  226  7e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  37.28 
 
 
351 aa  223  3e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  37.17 
 
 
342 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  35.8 
 
 
349 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  38.84 
 
 
348 aa  219  7.999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  33.53 
 
 
339 aa  217  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  35.47 
 
 
352 aa  215  9e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  36.18 
 
 
347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1873  GGDEF  35.48 
 
 
339 aa  212  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0147389  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  35.17 
 
 
350 aa  211  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  34.88 
 
 
349 aa  211  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  36.99 
 
 
334 aa  211  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  33.62 
 
 
347 aa  209  8e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  34.8 
 
 
640 aa  209  8e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  34.32 
 
 
352 aa  207  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  33.71 
 
 
348 aa  206  6e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  35.48 
 
 
353 aa  205  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  36.63 
 
 
348 aa  202  8e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  34.11 
 
 
349 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  36.55 
 
 
639 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  33.53 
 
 
343 aa  199  7e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  35.86 
 
 
348 aa  199  7e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  36.73 
 
 
346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  35.67 
 
 
624 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  33.62 
 
 
346 aa  196  6e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  32.65 
 
 
347 aa  195  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  33.61 
 
 
368 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  33.24 
 
 
349 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  32 
 
 
370 aa  193  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  31.73 
 
 
370 aa  192  6e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  32 
 
 
370 aa  192  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  34 
 
 
365 aa  192  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  34.48 
 
 
358 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  31.73 
 
 
370 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  31.47 
 
 
370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  31.47 
 
 
370 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  34.53 
 
 
372 aa  189  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  31.47 
 
 
370 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  32.59 
 
 
368 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  33.8 
 
 
368 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  33.8 
 
 
368 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  31.83 
 
 
369 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  33.52 
 
 
368 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  32.3 
 
 
368 aa  187  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  32.65 
 
 
631 aa  186  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  32.45 
 
 
370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  31.47 
 
 
370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  31.2 
 
 
370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  33.33 
 
 
368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  37.07 
 
 
332 aa  182  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  36.28 
 
 
327 aa  182  9.000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  27.96 
 
 
364 aa  182  1e-44  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  32.28 
 
 
370 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  33.24 
 
 
350 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  32.78 
 
 
368 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  32.03 
 
 
368 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1751  agmatine deiminase  31.96 
 
 
385 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  32.2 
 
 
371 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  32.2 
 
 
371 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3497  agmatine deiminase  31.96 
 
 
385 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  32.2 
 
 
365 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>