163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2461 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2461  hypothetical protein  100 
 
 		 477 aa  981    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00038995  hitchhiker  0.00000000000217462 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2812  Agmatine deiminase  37.31 
 
 		 400 aa  259  8e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.872566 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0412  Agmatine deiminase  32.6 
 
 		 413 aa  214  3.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.512784  hitchhiker  0.000333823 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  33.01 
 
 		 640 aa  204  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  30.3 
 
 		 639 aa  192  9e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  31.27 
 
 		 349 aa  180  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  30.63 
 
 		 369 aa  174  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  28.94 
 
 		 624 aa  173  5e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  31.17 
 
 		 348 aa  172  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  29.09 
 
 		 631 aa  172  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  31.87 
 
 		 358 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  29.77 
 
 		 339 aa  171  4e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  29.1 
 
 		 352 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  29.07 
 
 		 347 aa  168  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  29.38 
 
 		 350 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  30.67 
 
 		 372 aa  166  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  30.42 
 
 		 348 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  30.84 
 
 		 370 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  28.96 
 
 		 342 aa  163  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  29.21 
 
 		 368 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  29.03 
 
 		 347 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  30.47 
 
 		 368 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  28.86 
 
 		 352 aa  161  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  29.31 
 
 		 349 aa  160  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  28.71 
 
 		 349 aa  160  5e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  29.14 
 
 		 348 aa  159  9e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  30.52 
 
 		 351 aa  159  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  30.48 
 
 		 334 aa  158  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  28.57 
 
 		 368 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  30.34 
 
 		 369 aa  156  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  28.88 
 
 		 353 aa  156  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  27.36 
 
 		 365 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  28.99 
 
 		 368 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  29.56 
 
 		 368 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0059  Agmatine deiminase  30.05 
 
 		 375 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  28.82 
 
 		 368 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  28.75 
 
 		 349 aa  153  5e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  28.25 
 
 		 341 aa  153  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  28.71 
 
 		 348 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  28.75 
 
 		 368 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  28.93 
 
 		 368 aa  151  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  27.87 
 
 		 346 aa  150  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  29.65 
 
 		 364 aa  150  4e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  28.47 
 
 		 368 aa  150  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  30.42 
 
 		 371 aa  150  5e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  28.89 
 
 		 366 aa  150  6e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  30.38 
 
 		 370 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  29.31 
 
 		 368 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  30.4 
 
 		 370 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  28 
 
 		 346 aa  147  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0172  Agmatine deiminase  30.14 
 
 		 374 aa  147  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  30.13 
 
 		 370 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  30.13 
 
 		 370 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  30.13 
 
 		 370 aa  146  9e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  29.8 
 
 		 346 aa  146  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  29.53 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2373  twin-arginine translocation pathway signal  27.63 
 
 		 372 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0189025 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  28.89 
 
 		 375 aa  145  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  27.5 
 
 		 347 aa  144  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2405  agmatine deiminase  31.33 
 
 		 365 aa  144  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.761895  normal  0.0406266 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0681  Agmatine deiminase  27 
 
 		 348 aa  143  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  28 
 
 		 334 aa  143  8e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  28.18 
 
 		 355 aa  143  8e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  29.72 
 
 		 365 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  26.02 
 
 		 347 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  30.25 
 
 		 346 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  29.87 
 
 		 370 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  29.62 
 
 		 370 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3810  agmatine deiminase  29.72 
 
 		 365 aa  140  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.387298  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  29.11 
 
 		 370 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1202  agmatine deiminase  29.47 
 
 		 368 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0833  Agmatine deiminase  30.23 
 
 		 339 aa  140  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  28.78 
 
 		 367 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  29.56 
 
 		 367 aa  138  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  29.11 
 
 		 370 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  29.43 
 
 		 370 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  28.46 
 
 		 340 aa  137  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  30.37 
 
 		 370 aa  137  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  27.82 
 
 		 344 aa  137  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  29.65 
 
 		 365 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  29.65 
 
 		 371 aa  136  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  29.65 
 
 		 371 aa  136  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  29.14 
 
 		 374 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  28.07 
 
 		 350 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4759  peptidyl-arginine deiminase  29.57 
 
 		 370 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675137  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  28.72 
 
 		 356 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2482  agmatine deiminase  27.49 
 
 		 375 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  28.17 
 
 		 346 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  28.35 
 
 		 351 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48450  putative peptidyl-arginine deiminase  26.39 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000979902  normal  0.148444 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  27.16 
 
 		 332 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1189  peptidyl-arginine deiminase  28.4 
 
 		 373 aa  130  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  27.32 
 
 		 357 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0759  peptidyl-arginine deiminase  27.85 
 
 		 336 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.451964  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6169  Agmatine deiminase  27.89 
 
 		 331 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2450  agmatine deiminase  26.55 
 
 		 393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2154  peptidyl-arginine deiminase  29.93 
 
 		 371 aa  127  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  25.06 
 
 		 367 aa  125  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  26.26 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  26.97 
 
 		 355 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>