162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2812 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2812  Agmatine deiminase  100 
 
 		 400 aa  819    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.872566 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2461  hypothetical protein  37.31 
 
 		 477 aa  259  6e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00038995  hitchhiker  0.00000000000217462 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  32.61 
 
 		 640 aa  192  9e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  32.12 
 
 		 624 aa  191  2e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  29.46 
 
 		 639 aa  190  4e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  31.59 
 
 		 348 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  32.43 
 
 		 351 aa  181  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  30.68 
 
 		 352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  31 
 
 		 350 aa  179  9e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  30.21 
 
 		 348 aa  177  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0412  Agmatine deiminase  26.67 
 
 		 413 aa  170  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.512784  hitchhiker  0.000333823 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  31.5 
 
 		 631 aa  170  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  30.14 
 
 		 349 aa  171  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  31.28 
 
 		 334 aa  171  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  31.97 
 
 		 349 aa  170  4e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  30.71 
 
 		 348 aa  169  7e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  31.01 
 
 		 346 aa  168  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  30.62 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4756  peptidyl-arginine deiminase  29.04 
 
 		 345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322594  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  32.7 
 
 		 347 aa  167  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  30.62 
 
 		 349 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  30.91 
 
 		 342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  31.46 
 
 		 334 aa  162  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  31.4 
 
 		 339 aa  160  5e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  30.53 
 
 		 370 aa  160  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  29.44 
 
 		 368 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  28.8 
 
 		 364 aa  157  2e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  29.84 
 
 		 365 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  31.4 
 
 		 343 aa  158  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  29.7 
 
 		 347 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  27.56 
 
 		 366 aa  156  6e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3497  agmatine deiminase  29.5 
 
 		 385 aa  155  8e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  27.17 
 
 		 346 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0759  peptidyl-arginine deiminase  30.52 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.451964  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  27.51 
 
 		 372 aa  155  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  29.04 
 
 		 356 aa  155  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  28.53 
 
 		 368 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1048  agmatine deiminase  27.57 
 
 		 368 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.649771  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  31.45 
 
 		 346 aa  152  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1751  agmatine deiminase  28.82 
 
 		 385 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  30.58 
 
 		 348 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  28 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  28.69 
 
 		 350 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  28 
 
 		 370 aa  151  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  28.45 
 
 		 347 aa  151  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0059  Agmatine deiminase  27.76 
 
 		 375 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3209  agmatine deiminase  31.2 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  27.78 
 
 		 368 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3505  hypothetical protein  29.57 
 
 		 385 aa  149  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  28.15 
 
 		 357 aa  149  9e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0172  Agmatine deiminase  26.48 
 
 		 374 aa  149  9e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  27.51 
 
 		 368 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  27.2 
 
 		 368 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4759  peptidyl-arginine deiminase  32.05 
 
 		 370 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675137  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  26.81 
 
 		 358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  27.25 
 
 		 368 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4626  agmatine deiminase  28.73 
 
 		 369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2450  agmatine deiminase  30.54 
 
 		 393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  28.91 
 
 		 368 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1202  agmatine deiminase  28.46 
 
 		 368 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2373  twin-arginine translocation pathway signal  30.25 
 
 		 372 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0189025 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  28.35 
 
 		 371 aa  146  7.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  29.09 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  27.55 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0681  Agmatine deiminase  27.55 
 
 		 348 aa  145  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  27.49 
 
 		 343 aa  145  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  27.93 
 
 		 375 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  29.32 
 
 		 350 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2405  agmatine deiminase  28.76 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.761895  normal  0.0406266 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  28.01 
 
 		 369 aa  144  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  28.02 
 
 		 343 aa  144  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  28.02 
 
 		 343 aa  144  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  28.1 
 
 		 342 aa  143  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  30.08 
 
 		 351 aa  143  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  26.45 
 
 		 344 aa  142  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  28.25 
 
 		 344 aa  142  7e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  27.95 
 
 		 355 aa  142  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48450  putative peptidyl-arginine deiminase  29.93 
 
 		 372 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000979902  normal  0.148444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2072  Agmatine deiminase  28.85 
 
 		 364 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  28.53 
 
 		 368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2482  agmatine deiminase  28.33 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  28.93 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  28.53 
 
 		 347 aa  140  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  28.53 
 
 		 346 aa  140  6e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  26.86 
 
 		 369 aa  139  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3490  agmatine deiminase  31.2 
 
 		 348 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  27.47 
 
 		 365 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  27.47 
 
 		 371 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  27.47 
 
 		 371 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  28.73 
 
 		 341 aa  139  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  26.94 
 
 		 349 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1755  agmatine deiminase  30.03 
 
 		 348 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.807714  normal  0.973962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6353  Agmatine deiminase  28.05 
 
 		 383 aa  138  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2192  agmatine deiminase  27.85 
 
 		 373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3203  agmatine deiminase  29.75 
 
 		 348 aa  137  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.659757  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  26.6 
 
 		 368 aa  136  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  28.53 
 
 		 370 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  27.85 
 
 		 367 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48490  putative peptidylarginine deiminase  28.38 
 
 		 346 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000276698  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6169  Agmatine deiminase  27.93 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.107362 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>