103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1419 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1419  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 64 aa  124  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1374  transcriptional regulator, XRE family  53.12 
 
 		 71 aa  78.2  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.111041  normal  0.717323 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  49.21 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2958  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.526804  normal  0.873082 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 81 aa  53.5  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1357  helix-turn-helix domain-containing protein  41.94 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.222468  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1401  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1916  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193475  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  37.1 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 81 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2410  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 141 aa  48.1  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000774173  normal  0.481646 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  41.07 
 
 		 508 aa  47.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0995  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 72 aa  47.4  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.651052 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2349  hypothetical protein  37.1 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1458  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3103  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 503 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3034  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123448  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6923  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0165  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 200 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08540  predicted transcriptional regulator  40.32 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 513 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3867  Cro/CI family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4980  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0459  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.995488  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9535  hypothetical transcription regulator protein  40.98 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111117  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4023  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2581  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 209 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2272  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.7 
 
 		 201 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306888  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1719  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 104 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.134789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2246  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 197 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3261  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 190 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.957848  normal  0.179215 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  35 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  34.43 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  47.27 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3469  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 197 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  38.71 
 
 		 245 aa  43.9  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  37.29 
 
 		 517 aa  43.9  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 213 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0410  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 516 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3542  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4018  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3519  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 210 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0116433 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 218 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20520  DNA binding protein, XRE family  38.6 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1153  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 1143 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648529  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13300  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  38.98 
 
 		 509 aa  42.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.801467  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1826  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2426  hypothetical protein  35.09 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3420  transcriptional regulator, XRE family protein  34.43 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0378  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309443  hitchhiker  0.00198984 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4969  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0029  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2543  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0592097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3349  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0885  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 83 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4154  hypothetical protein  41.82 
 
 		 82 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06215  hypothetical protein  37.7 
 
 		 68 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 76 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6350  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 283 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12010  predicted transcription factor, MBF1 like protein  43.64 
 
 		 284 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3680  helix-turn-helix domain protein  36.07 
 
 		 66 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2290  hypothetical protein  35.09 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3035  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 208 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1478  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1361  EPSP synthase (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase)  38.46 
 
 		 516 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419571  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0751  helix-turn-helix domain-containing protein  35 
 
 		 69 aa  41.2  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2246  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 117 aa  41.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4574  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 276 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0931  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0364  phage repressor  40.98 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1891  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3457  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  46 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4302  transcriptional regulator, XRE family  32.76 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.397769  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 230 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2174  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2406  hypothetical protein  35.48 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2176  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4271  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4410  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3100  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000473627  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1896  transcriptional regulator, XRE family  41.51 
 
 		 512 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1184  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 73 aa  40.8  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410956  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  41.94 
 
 		 210 aa  40.4  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>