49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2246 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2246  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 117 aa  236  6.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2940  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0165  XRE family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 200 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3344  XRE family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 125 aa  48.1  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  32.22 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0540  helix-turn-helix domain-containing protein  32.43 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.229999 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  35.06 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4967  transcriptional regulator, XRE family  34.94 
 
 		 218 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454469  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4938  XRE family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 206 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0155  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3103  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 503 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1957  XRE family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 208 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.210401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  35.38 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3549  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000469163  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2247  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.88 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 513 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2625  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 217 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2233  transcriptional regulator, XRE family  28.3 
 
 		 107 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0669523  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 81 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  31.76 
 
 		 517 aa  41.6  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 181 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4983  transcriptional regulator, XRE family  34.57 
 
 		 209 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0953387  normal  0.300371 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4933  transcriptional regulator, XRE family  34.57 
 
 		 209 aa  41.6  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5790  XRE family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.902407  hitchhiker  0.00485473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4469  helix-turn-helix domain-containing protein  34.57 
 
 		 209 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3035  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 208 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1361  EPSP synthase (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase)  35.71 
 
 		 516 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419571  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1419  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 64 aa  41.2  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  43.86 
 
 		 233 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2442  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1448  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1721  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 201 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0116  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 205 aa  40.4  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0574196 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 179 aa  40.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  43.86 
 
 		 233 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 812 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  43.86 
 
 		 233 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 256 aa  40.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3519  transcriptional regulator, XRE family  31.08 
 
 		 210 aa  40  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0116433 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1957  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 		 89 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>