134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3034 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3034  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 82 aa  168  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123448  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  42.03 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  36.76 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1393  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0107  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.396345 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  35.29 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0107  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5036  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 72 aa  47.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5417  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 72 aa  47.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.602876  normal  0.653324 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 84 aa  47.8  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0198  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4023  transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 		 94 aa  47.4  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2009  transcriptional regulator, XRE family  32.88 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2176  transcriptional regulator, XRE family  51.22 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3100  transcriptional regulator, XRE family  51.22 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000473627  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  46 
 
 		 75 aa  45.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1419  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2349  hypothetical protein  34.33 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0751  helix-turn-helix domain-containing protein  42.65 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0078  hypothetical protein  37.31 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2487  XRE family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 189 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3149  putative transcription regulator protein  47.83 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.369647 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1135  XRE family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1520  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 176 aa  44.7  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0757766  normal  0.0239869 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3484  transcriptional regulator, XRE family  40.43 
 
 		 200 aa  44.3  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1097  transcription regulator protein  39.13 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  34.62 
 
 		 190 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  34.62 
 
 		 190 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1231  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0450833  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 190 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  47.83 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  34.62 
 
 		 190 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  34.62 
 
 		 190 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  34.62 
 
 		 190 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  34.62 
 
 		 190 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4980  XRE family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6741  putative transcriptional regulator  34 
 
 		 58 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0202746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  34.62 
 
 		 190 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6923  XRE family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  34.62 
 
 		 190 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000231  predicted transcriptional regulator  33.8 
 
 		 207 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  38 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0685  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  33.33 
 
 		 489 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 120 aa  42.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  38 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0622  DNA-binding protein  34.62 
 
 		 190 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.475485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1153  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.78 
 
 		 1143 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648529  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3867  Cro/CI family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 193 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  34 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 503 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0888  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0319  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 191 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000379854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3725  DNA-binding protein  41.3 
 
 		 258 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05970  hypothetical protein  33.8 
 
 		 207 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0678  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 188 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5935  transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 		 67 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0843  XRE family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421262 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2401  XRE family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000242769  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3700  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000696836  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  40.38 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1374  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.111041  normal  0.717323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4469  helix-turn-helix domain-containing protein  33.82 
 
 		 209 aa  41.2  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  30.26 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0766  helix-turn-helix domain protein  30.99 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4933  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 209 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4967  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 218 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454469  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0697  transcriptional regulator, XRE family  36.96 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  28.99 
 
 		 70 aa  41.2  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 490 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08540  predicted transcriptional regulator  38.57 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102347 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30 
 
 		 481 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0073  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 210 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4938  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 206 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0116  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 205 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0574196 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4983  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 209 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0953387  normal  0.300371 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  34.78 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0324  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 191 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000421536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1957  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 208 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.210401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 201 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>