91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1342 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1342  5'-Nucleotidase domain protein  100 
 
 
618 aa  1282    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.206839  normal  0.550173 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2576  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 
614 aa  138  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  23.48 
 
 
419 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  27.48 
 
 
417 aa  69.7  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  33.57 
 
 
556 aa  62  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  33.64 
 
 
444 aa  60.5  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2337  ABC-type glucosylglycerol transport system substrate-binding protein  26.79 
 
 
448 aa  59.3  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176838  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  40.58 
 
 
493 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  49.09 
 
 
457 aa  59.3  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 
434 aa  58.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0573  extracellular solute-binding protein  40.21 
 
 
460 aa  57  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  29.77 
 
 
434 aa  56.2  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0145  extracellular solute-binding protein family 1  48 
 
 
442 aa  55.8  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  39.66 
 
 
451 aa  55.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  24.55 
 
 
451 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2983  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 
467 aa  55.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 
425 aa  55.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24620  carbohydrate-binding protein  24.61 
 
 
424 aa  55.5  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  22.84 
 
 
446 aa  55.1  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  26.26 
 
 
461 aa  54.7  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2102  periplasmic protein  37.78 
 
 
447 aa  54.3  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.502645  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  28.17 
 
 
431 aa  54.3  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2855  extracellular solute-binding protein family 1  26.88 
 
 
483 aa  53.9  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.830086 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1792  extracellular solute-binding protein  43.08 
 
 
462 aa  53.9  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  46.94 
 
 
461 aa  53.9  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 
461 aa  53.5  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  30.34 
 
 
423 aa  53.5  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3207  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 
467 aa  53.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3623  extracellular solute-binding protein family 1  26.95 
 
 
442 aa  52  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00170169  normal  0.0768086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3587  extracellular solute-binding protein  34.38 
 
 
447 aa  52  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.69287  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  30.11 
 
 
435 aa  52  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2047  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.38 
 
 
479 aa  50.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5548  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 
448 aa  51.2  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  41.18 
 
 
424 aa  50.8  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.92 
 
 
441 aa  50.8  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  23.38 
 
 
423 aa  50.8  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  30.51 
 
 
1181 aa  50.8  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1941  extracellular solute-binding protein family 1  40.43 
 
 
487 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.948884  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  40.91 
 
 
445 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4906  extracellular solute-binding protein family 1  30.77 
 
 
438 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.507884  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 
495 aa  49.7  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4050  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 
433 aa  49.7  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  22.45 
 
 
408 aa  49.3  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.4 
 
 
1284 aa  48.5  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.42 
 
 
434 aa  48.9  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  34.29 
 
 
428 aa  48.5  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.75 
 
 
426 aa  47.8  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  40.32 
 
 
434 aa  47.8  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4385  serine/threonine protein phosphatase family protein  28.98 
 
 
539 aa  47.8  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.970271 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  34.62 
 
 
434 aa  47.8  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 
429 aa  47  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  28.81 
 
 
1175 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  20.44 
 
 
408 aa  47  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  32.61 
 
 
429 aa  46.6  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  41.18 
 
 
424 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0061  extracellular solute-binding protein family 1  36.36 
 
 
462 aa  46.6  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7707  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  42.86 
 
 
485 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  41.18 
 
 
424 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  37.7 
 
 
419 aa  45.8  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  41.18 
 
 
458 aa  45.8  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  29.17 
 
 
444 aa  46.2  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 
427 aa  46.2  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  36.76 
 
 
462 aa  46.2  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 
455 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
435 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2914  extracellular solute-binding protein family 1  21.66 
 
 
440 aa  45.4  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01750  carbohydrate-binding protein  39.06 
 
 
457 aa  45.4  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110954  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 
408 aa  45.4  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  34.29 
 
 
399 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  34.29 
 
 
413 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4609  extracellular solute-binding protein family 1  28.16 
 
 
427 aa  45.8  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5152  extracellular solute-binding protein family 1  42.55 
 
 
482 aa  45.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 
437 aa  45.1  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 
424 aa  45.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3182  extracellular solute-binding protein family 1  38.98 
 
 
464 aa  44.7  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  30.51 
 
 
441 aa  44.7  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  27.59 
 
 
437 aa  44.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1291  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 
461 aa  44.3  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2483  5'-nucleotidase  26.82 
 
 
512 aa  44.3  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  32.54 
 
 
441 aa  44.3  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1609  ABC-type sugar transport system periplasmic component  25.95 
 
 
557 aa  44.3  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.051709  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  33.82 
 
 
433 aa  44.3  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  31.43 
 
 
414 aa  44.3  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3237  extracellular solute-binding protein family 1  39.29 
 
 
464 aa  43.9  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 
429 aa  43.9  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0494  extracellular solute-binding protein  32.46 
 
 
465 aa  43.9  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  21.49 
 
 
438 aa  43.9  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00840  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.7 
 
 
451 aa  43.9  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2342  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 
477 aa  43.9  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.936887  normal  0.0125511 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  31 
 
 
410 aa  43.9  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  33.33 
 
 
406 aa  43.5  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>