152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0412 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0412  Agmatine deiminase  100 
 
 		 413 aa  855    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.512784  hitchhiker  0.000333823 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2461  hypothetical protein  32.6 
 
 		 477 aa  214  2.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00038995  hitchhiker  0.00000000000217462 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2812  Agmatine deiminase  26.67 
 
 		 400 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.872566 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  28.3 
 
 		 372 aa  139  8.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  27.1 
 
 		 368 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  26.86 
 
 		 368 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  26.53 
 
 		 368 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  27.08 
 
 		 368 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  28.16 
 
 		 368 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  27.55 
 
 		 368 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  26.2 
 
 		 368 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  27.08 
 
 		 368 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  28.4 
 
 		 639 aa  127  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  26.57 
 
 		 368 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  26.92 
 
 		 368 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  27.25 
 
 		 370 aa  122  8e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2192  agmatine deiminase  25.5 
 
 		 373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  25.93 
 
 		 640 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  27.7 
 
 		 348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  25.18 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  26.79 
 
 		 366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  26.2 
 
 		 369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  25.48 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  26.94 
 
 		 371 aa  106  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  26.15 
 
 		 347 aa  106  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  27.49 
 
 		 348 aa  106  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  26.85 
 
 		 352 aa  106  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  24.02 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  26.14 
 
 		 370 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  25.62 
 
 		 334 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2405  agmatine deiminase  25.55 
 
 		 365 aa  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.761895  normal  0.0406266 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  25.89 
 
 		 349 aa  103  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  27.58 
 
 		 370 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  25.24 
 
 		 624 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  23.61 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1189  peptidyl-arginine deiminase  25.67 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  25.84 
 
 		 339 aa  102  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  26.08 
 
 		 370 aa  101  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  25.72 
 
 		 365 aa  100  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  25.24 
 
 		 370 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  26.1 
 
 		 349 aa  100  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1202  agmatine deiminase  25.67 
 
 		 368 aa  100  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  26.08 
 
 		 370 aa  100  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0172  Agmatine deiminase  24.94 
 
 		 374 aa  100  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  26.08 
 
 		 370 aa  99.8  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  25.84 
 
 		 370 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  26.73 
 
 		 370 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2482  agmatine deiminase  23.66 
 
 		 375 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  26.49 
 
 		 370 aa  97.4  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0681  Agmatine deiminase  25.66 
 
 		 348 aa  97.4  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  26.08 
 
 		 370 aa  96.7  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  25 
 
 		 346 aa  96.7  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  23.65 
 
 		 351 aa  96.3  9e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6169  Agmatine deiminase  25.31 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  26.43 
 
 		 346 aa  95.9  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  26.49 
 
 		 370 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  25.31 
 
 		 348 aa  95.5  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3810  agmatine deiminase  25.96 
 
 		 365 aa  95.1  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.387298  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  26.65 
 
 		 347 aa  94.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  25.07 
 
 		 349 aa  94.4  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2373  twin-arginine translocation pathway signal  23.34 
 
 		 372 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0189025 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  25.43 
 
 		 334 aa  93.6  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  25.3 
 
 		 375 aa  93.6  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  23.77 
 
 		 352 aa  92.8  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  24.94 
 
 		 342 aa  92.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  24.4 
 
 		 349 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  23.86 
 
 		 347 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1048  agmatine deiminase  24.75 
 
 		 368 aa  92  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.649771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2072  Agmatine deiminase  25.3 
 
 		 364 aa  90.5  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  22.14 
 
 		 364 aa  90.1  6e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  23.56 
 
 		 367 aa  89.7  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  22.78 
 
 		 367 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  25.49 
 
 		 343 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2561  Agmatine deiminase  24.15 
 
 		 377 aa  88.2  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  24.88 
 
 		 374 aa  87.4  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  24.03 
 
 		 365 aa  87  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48450  putative peptidyl-arginine deiminase  22.55 
 
 		 372 aa  87  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000979902  normal  0.148444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4219  Agmatine deiminase  25 
 
 		 340 aa  87  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  24.03 
 
 		 371 aa  86.7  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  24.03 
 
 		 371 aa  86.7  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4756  peptidyl-arginine deiminase  23.77 
 
 		 345 aa  86.7  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322594  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0059  Agmatine deiminase  23.43 
 
 		 375 aa  86.3  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  23.4 
 
 		 631 aa  85.9  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4626  agmatine deiminase  24.5 
 
 		 369 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  25.31 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  24.23 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  25.98 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0678  agmatine deiminase  25 
 
 		 386 aa  84  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.421408 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  23.86 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3203  agmatine deiminase  25.67 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.659757  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2154  peptidyl-arginine deiminase  23.26 
 
 		 371 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0369  peptidyl-arginine deiminase  25.12 
 
 		 339 aa  82.8  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1849  agmatine deiminase  23.36 
 
 		 369 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552976  decreased coverage  0.00228426 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1601  hypothetical protein  23.37 
 
 		 363 aa  82.8  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  24.56 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0759  peptidyl-arginine deiminase  23.96 
 
 		 336 aa  82.4  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.451964  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3209  agmatine deiminase  23.38 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  20.91 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1544  agmatine deiminase  23.37 
 
 		 363 aa  81.6  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  26.49 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>