More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0922 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00182  DNA polymerase III subunit alpha  38.53 
 
 
1160 aa  756    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  38.53 
 
 
1160 aa  755    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09151  DNA polymerase III subunit alpha  38.89 
 
 
1165 aa  666    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  37.48 
 
 
1170 aa  667    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  40.54 
 
 
1155 aa  791    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1606  DNA polymerase III subunit alpha  38.17 
 
 
1174 aa  760    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  40.7 
 
 
1149 aa  721    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  41.2 
 
 
1165 aa  809    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0780  DNA polymerase III, alpha subunit  58.66 
 
 
1109 aa  1351    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.493984  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2205  DNA polymerase III subunit alpha  39.72 
 
 
1173 aa  763    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344019  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4735  DNA polymerase III DnaE  36.11 
 
 
1108 aa  672    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1570  DNA polymerase III subunit alpha  41.18 
 
 
1186 aa  754    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.749203  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1830  DNA polymerase III, alpha subunit  38.75 
 
 
1187 aa  756    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.575666  normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_004310  BR0825  DNA polymerase III subunit alpha  44.43 
 
 
1163 aa  989    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1644  DNA polymerase III subunit alpha  38.02 
 
 
1158 aa  752    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1549  DNA polymerase III, alpha subunit  37.7 
 
 
1173 aa  754    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4498  DNA polymerase III DnaE  37.44 
 
 
1108 aa  672    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4333  DNA polymerase III DnaE  37.34 
 
 
1108 aa  667    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4345  DNA polymerase III DnaE  37.44 
 
 
1108 aa  669    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1913  DNA polymerase III subunit alpha  39.71 
 
 
1174 aa  777    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00377925  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1024  DNA polymerase III, alpha chain  40.07 
 
 
1148 aa  797    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0991  DNA polymerase III, alpha chain  39.95 
 
 
1148 aa  794    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1358  DNA polymerase III subunit alpha  37.88 
 
 
1173 aa  755    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1177  DNA polymerase III, alpha subunit  37.14 
 
 
1247 aa  689    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.710188 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0559  DNA polymerase III, alpha subunit  38.19 
 
 
1156 aa  761    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.77827 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  38.05 
 
 
1172 aa  660    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2534  DNA polymerase III subunit alpha  39.73 
 
 
1175 aa  770    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0187  DNA polymerase III alpha subunit  89.36 
 
 
1123 aa  2091    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0858  DNA polymerase III, alpha subunit  37.59 
 
 
1141 aa  759    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  unclonable  0.0000342881  normal  0.701952 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1860  DNA polymerase III subunit alpha  45.48 
 
 
1168 aa  1028    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.100328 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10281  DNA polymerase III subunit alpha  37.54 
 
 
1165 aa  643    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0846  DNA polymerase III, alpha subunit  39.96 
 
 
1158 aa  814    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1116  DNA polymerase III subunit alpha  37.92 
 
 
1173 aa  758    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3553  DNA polymerase III subunit alpha  42.62 
 
 
1163 aa  920    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  40.33 
 
 
1156 aa  784    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5655  DNA polymerase III subunit alpha  39.98 
 
 
1176 aa  784    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2925  DNA polymerase III, alpha subunit  38.81 
 
 
1173 aa  734    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.917555 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1301  DNA polymerase III subunit alpha  37.16 
 
 
1172 aa  654    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.357557  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  37.28 
 
 
1172 aa  654    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  40.87 
 
 
1155 aa  805    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  37.19 
 
 
1165 aa  733    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1115  DNA polymerase III, alpha subunit  40.13 
 
 
1158 aa  795    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.560519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4849  DNA polymerase III DnaE  37.44 
 
 
1108 aa  672    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0910  DNA polymerase III subunit alpha  36.87 
 
 
1186 aa  639    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.689093  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  38.43 
 
 
1165 aa  664    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2731  DNA polymerase III, alpha subunit  39.87 
 
 
1174 aa  796    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1582  DNA polymerase III subunit alpha  45.62 
 
 
1170 aa  999    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  42.15 
 
 
1156 aa  743    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0984  DNA polymerase III subunit alpha  39.71 
 
 
1278 aa  777    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3445  DNA polymerase III, alpha subunit  37.91 
 
 
1210 aa  708    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2601  DNA polymerase III subunit alpha  44.44 
 
 
1151 aa  984    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742859  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1770  DNA polymerase III, alpha subunit  38.42 
 
 
1215 aa  845    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183542  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0167  DNA polymerase III, alpha subunit  48.16 
 
 
1077 aa  963    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0922  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 
1120 aa  2295    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0940  DNA polymerase III subunit alpha  41.92 
 
 
1155 aa  880    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.863457 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2040  DNA polymerase III, alpha subunit  38.85 
 
 
1185 aa  744    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918185  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1106  DNA polymerase III subunit alpha  40.07 
 
 
1173 aa  775    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2433  DNA polymerase III subunit alpha  43.78 
 
 
1185 aa  990    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.184139 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1247  DNA polymerase III, alpha subunit  40.91 
 
 
1149 aa  810    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2893  DNA polymerase III, alpha subunit  38.17 
 
 
1190 aa  721    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.580471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3292  DNA polymerase III subunit alpha  40.83 
 
 
1193 aa  784    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1569  DNA polymerase III subunit alpha  38.02 
 
 
1159 aa  762    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.840877  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2858  DNA polymerase III subunit alpha  44.4 
 
 
1151 aa  986    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.813555  normal  0.262906 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  39.54 
 
 
1168 aa  787    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1693  DNA polymerase III subunit alpha  44.74 
 
 
1168 aa  1009    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1214  DNA polymerase III, alpha subunit  36.95 
 
 
1247 aa  684    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.69236  normal  0.734793 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0754  DNA polymerase III subunit alpha  39.88 
 
 
1176 aa  773    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291929  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0538  DNA polymerase III, alpha subunit  42.68 
 
 
1163 aa  759    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2747  DNA polymerase III, alpha subunit  36.36 
 
 
1159 aa  691    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.782351 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0500  DNA polymerase III subunit alpha  42.77 
 
 
1166 aa  921    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0751072  normal  0.378075 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1179  DNA polymerase III, alpha subunit  41.26 
 
 
1162 aa  882    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1701  DNA polymerase III subunit alpha  40.26 
 
 
1177 aa  787    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  36.77 
 
 
1165 aa  658    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1264  DNA polymerase III, alpha subunit  38.96 
 
 
1155 aa  760    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1255  DNA polymerase III subunit alpha  44.68 
 
 
1172 aa  978    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  37.89 
 
 
1172 aa  663    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.146562 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0198  DNA polymerase III subunit alpha  40.65 
 
 
1158 aa  782    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2626  DNA polymerase III subunit alpha  38.06 
 
 
1158 aa  753    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0206088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2693  DNA polymerase III subunit alpha  38.06 
 
 
1158 aa  753    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112631 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  42.55 
 
 
1182 aa  759    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1285  DNA polymerase III subunit alpha  37.31 
 
 
1158 aa  724    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.876044  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  41.89 
 
 
1130 aa  753    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1378  DNA polymerase III subunit alpha  45.21 
 
 
1147 aa  993    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.450591  normal  0.182438 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2352  DNA polymerase III subunit alpha  40.06 
 
 
1177 aa  779    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17260  DNA polymerase III subunit alpha  38.03 
 
 
1173 aa  761    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1453  DNA polymerase III, alpha subunit  36.7 
 
 
1183 aa  736    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2313  DNA polymerase III subunit alpha  40.26 
 
 
1177 aa  787    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  40.54 
 
 
1164 aa  814    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3229  DNA polymerase III, alpha subunit  39.18 
 
 
1195 aa  788    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909958  normal  0.738512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2800  DNA polymerase III subunit alpha  37.94 
 
 
1158 aa  749    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.867982 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4484  DNA polymerase III, alpha subunit  39.6 
 
 
1186 aa  746    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.355677  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1044  DNA polymerase III, alpha subunit, form 1  39.71 
 
 
1686 aa  779    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.108134  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  41.46 
 
 
1184 aa  794    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0872  DNA polymerase III subunit alpha  43.7 
 
 
1161 aa  920    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.224124  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1762  DNA polymerase III subunit alpha  44.5 
 
 
1156 aa  905    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.402462  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1154  DNA polymerase III subunit alpha  38.37 
 
 
1157 aa  758    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2961  DNA polymerase III, alpha subunit  37.63 
 
 
1173 aa  717    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.078928 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  37.71 
 
 
1162 aa  757    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  40.8 
 
 
1175 aa  748    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3240  DNA polymerase III, alpha subunit  39.17 
 
 
1190 aa  753    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.860175 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>